| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4636330 | 135 (0.860) | 10 (0.070) | 9/164 | NT | 6.6% | coding (324/690 nt) | creB | response regulator in two‑component regulatory system with CreC |
| ? | NC_000913 | = 4636367 | 157 (1.090) | coding (361/690 nt) | creB | response regulator in two‑component regulatory system with CreC | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
GTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTA > NC_000913/4636268‑4636465 | gTCGATCACCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTc > 2:2316633/1‑100 (MQ=255) tCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCg < 1:767615‑M2/100‑2 (MQ=255) gATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCggg < 1:3696280‑M2/100‑4 (MQ=255) gATCGCCTGCTTGGGCTGGAAAGTGGTGCTGACGACTACGGGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCggg > 1:2078040‑M2/1‑97 (MQ=255) ttgccTGCTTGGGCTGTAATTTGGGGGTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCgggtn > 1:1826292‑M2/3‑95 (MQ=255) tCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCgggtg > 1:4041319‑M2/1‑95 (MQ=255) cGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGTCTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCGCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCgggtga > 1:3319625‑M2/1‑94 (MQ=255) cGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTTAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCgggtga > 1:2049086‑M2/1‑94 (MQ=255) cGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCgggtga > 2:2828930‑M2/1‑94 (MQ=255) gCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCgggtgaa < 1:2964245‑M2/100‑8 (MQ=255) cTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGCGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCCTCGGGTgaaga < 1:2316623/100‑1 (MQ=255) cTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGt < 1:301723/100‑1 (MQ=255) gCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCg > 2:3339718/1‑100 (MQ=255) gCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCg < 2:3569168/100‑1 (MQ=255) gCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCg > 1:1526497/1‑100 (MQ=255) gCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCg < 2:1961201/100‑1 (MQ=255) cTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGa > 2:4243165/1‑100 (MQ=255) ggAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACg < 1:805405/100‑1 (MQ=255) aaTTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCg > 1:4275039/1‑100 (MQ=255) tGGTGCTGACGACTACGTTGCTAAACCGTTTTCACTCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGtct < 2:894403/100‑1 (MQ=255) gTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTcc > 2:1710209/1‑100 (MQ=255) gTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTcc < 1:1860851/100‑1 (MQ=255) tGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTccc > 2:2143047/1‑100 (MQ=255) gCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTGACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCCACGCCGTCTCCCg < 1:2722212/100‑1 (MQ=255) cTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGt > 2:3425057/1‑100 (MQ=255) tGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGACTCCCg > 1:22529/1‑98 (MQ=255) nacgacTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCa > 2:41168/2‑100 (MQ=255) cgacTACGTGGCTAACCCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATc < 1:993743/100‑1 (MQ=255) cgacTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTCCTGCGCCGGGTGTCGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATc > 2:3190986/1‑100 (MQ=255) cgacTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGTGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATc < 1:887655/100‑1 (MQ=255) acTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGGAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCg > 1:897122/1‑100 (MQ=255) acTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCg > 1:2225187/1‑100 (MQ=255) tACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTa > 1:3390335/1‑100 (MQ=255) aCGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTAt > 1:678363/1‑100 (MQ=255) cGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTAtt > 1:1567907/1‑100 (MQ=255) tGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCgggtgaagacggtttagccacgtagtcgtcagcaccaatttcc < 1:3193201‑M2/100‑44 (MQ=255) tGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTgg < 2:1852242/100‑1 (MQ=255) ggCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCATACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGa > 1:2452913/1‑100 (MQ=255) cTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACa > 1:1295031/1‑100 (MQ=255) atAAACCGTTTTCACCTCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGCAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGt > 1:1134476/2‑92 (MQ=255) aaaCCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACAtt > 1:901117/1‑100 (MQ=255) aaCCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCgggtgaaaacggtttagccacgtagtcgtcagcaccaatttccagccca < 1:2621396‑M2/100‑50 (MQ=255) aaCCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACAttt > 2:2225061/1‑100 (MQ=255) aaCCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACAttt > 2:4010490/1‑100 (MQ=255) aCCGTTTTCGCCCCGCGATGTGTGCGCCAGGGTGCGCCCCTTACTGCGTCGGGTGAAGGAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGACATCCGTATTGGACAttt < 1:3518271/99‑1 (MQ=255) aCCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACAtttt < 2:1224415/100‑1 (MQ=255) ccGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTttg > 2:3889058/1‑100 (MQ=255) cGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCCGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTttga < 1:646172/100‑1 (MQ=255) cGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCgggtgaaaacggtttagccacgtagtcgtcagcaccaatttccagcccaagc < 2:2809536‑M2/100‑53 (MQ=255) gTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTttgaa > 1:2666923/1‑100 (MQ=255) tttCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTttgaatt < 1:3456619/100‑1 (MQ=255) tttCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTttgaatt < 1:4381470/100‑1 (MQ=255) ttCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTttga > 1:4103740/1‑96 (MQ=255) tCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCgggtgaaaacggtttagccacgtagtcgtcagcaccaatttccagcccaagcaggcg < 2:1928885‑M2/100‑58 (MQ=255) cACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTttgaattgaa > 2:2686720/1‑100 (MQ=255) cACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTttgaattgaa < 1:39198/100‑1 (MQ=255) aCCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTtgaattgaat < 2:677947/100‑1 (MQ=255) aCCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTtgaattgaat < 1:2391526/100‑1 (MQ=255) aCCCCGCGAAGTGTGAGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTtgaattgaat < 2:4337097/100‑1 (MQ=255) ccccGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCgggtgaaaacggtttagccccgtagtcgtcagcaccaatttccagcccaagcaggcgatc < 1:29211‑M2/100‑61 (MQ=255) ccccGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTtgaattgaat < 1:836814/99‑1 (MQ=255) cccGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATtgaatga > 2:3520197/1‑100 (MQ=255) cccGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATtgaatga > 2:1456897/1‑100 (MQ=255) cccGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATtgaatga > 1:1052161/1‑100 (MQ=255) cccGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGAGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATtgaatga > 2:3738096/1‑100 (MQ=255) gcgAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAAcc > 2:3245137/1‑100 (MQ=255) gcgAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAAcc < 2:2606971/100‑1 (MQ=255) gcgAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAAcc < 2:570291/100‑1 (MQ=255) cgAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAAccc > 1:1896022/1‑100 (MQ=255) gAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAAccc < 1:1743878/99‑1 (MQ=255) aaGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATGGAATGAACCcgc > 2:1270435/1‑100 (MQ=255) gtgtGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCgcgg > 2:462254/1‑100 (MQ=255) tgtgCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCgcggc > 2:767208/1‑100 (MQ=255) gtgCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCgcggcg > 2:2415432/1‑100 (MQ=255) gtgCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCgcggcg > 1:2745100/1‑100 (MQ=255) tgCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGgcgc < 2:3797728/100‑1 (MQ=255) tgCGCCAGGGTGCACACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGgcgc > 1:1641379/1‑100 (MQ=255) cgcCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAg > 1:3540164/1‑100 (MQ=255) cgcCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAg > 2:1557486/1‑100 (MQ=255) cgcCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAg < 2:4164769/100‑1 (MQ=255) gcCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGa > 2:692912/1‑100 (MQ=255) cAGTGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATc < 2:845769/100‑1 (MQ=255) cAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATc < 2:2036710/100‑1 (MQ=255) cAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATc < 1:2881852/100‑1 (MQ=255) aGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCa < 1:245514/100‑1 (MQ=255) gggTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCACGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAg > 1:4177331/1‑100 (MQ=255) gTGCGCGCCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCt < 1:2039607/100‑1 (MQ=255) gTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCt < 1:4304120/100‑1 (MQ=255) gTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCt < 2:2248200/100‑1 (MQ=255) gTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCt > 2:3066830/1‑100 (MQ=255) tGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTg > 2:71077/1‑100 (MQ=255) aCCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTg < 2:2389419/100‑1 (MQ=255) cTTACTGGGTCGGGTGAAGAAGTTCACGGCGCCGTCTCCTGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATAAGCTGGTTTg < 1:3872895/98‑1 (MQ=255) cTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCAGCGGCGCAGATGAGCTGGTTTGac > 2:3280991/1‑100 (MQ=255) aCTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACg > 2:2942937/1‑100 (MQ=255) cTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGc > 2:4278612/1‑100 (MQ=255) cTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGc > 1:2132994/1‑100 (MQ=255) tGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGcc < 2:1351908/100‑1 (MQ=255) gCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCa > 1:1222314/1‑100 (MQ=255) tCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTa < 1:3778635/100‑1 (MQ=255) | GTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTGAATGAACCCGCGGCGCAGATCAGCTGGTTTGACACGCCATTA > NC_000913/4636268‑4636465 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |