| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2304590 | 130 (0.830) | 27 (0.190) | 12/164 | NT | 20.6% | noncoding (174/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 2304608 | 89 (0.620) | noncoding (192/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | |||||
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
CGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAG > NC_000913/2304509‑2304690 | cGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCtt < 2:1647210/100‑1 (MQ=33) gCTGTGAACTGCGGCACCCCGTAGCTCAGACGAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCtt < 1:2187235/99‑1 (MQ=255) gtgAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatca < 1:3880512‑M2/100‑5 (MQ=255) gtgAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatca < 1:2540367‑M2/100‑5 (MQ=255) gtgAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatca > 2:4260098‑M2/1‑96 (MQ=255) gtgAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatca > 2:2600397‑M2/1‑96 (MQ=255) gtgAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatc < 2:1447787‑M2/99‑4 (MQ=255) tgAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcag > 1:1904167‑M2/1‑95 (MQ=255) tgAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcag > 1:4090615‑M2/1‑95 (MQ=255) tgAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGCCTTatcag < 2:3508300‑M2/100‑6 (MQ=255) tgAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGCCGCGTCTTatcag < 2:3816724‑M2/100‑6 (MQ=255) gAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcagg < 1:3343480‑M2/100‑7 (MQ=255) gAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcagg > 1:303364‑M2/1‑94 (MQ=255) gAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcagg > 2:4031584‑M2/1‑94 (MQ=255) gAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcagg > 1:2939840‑M2/1‑94 (MQ=255) gAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcagg > 2:2803575‑M2/1‑94 (MQ=255) gAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACACCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcag < 2:1354313‑M2/99‑6 (MQ=255) aaGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggc < 1:3817993‑M2/100‑8 (MQ=255) gCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcag < 1:2103481‑M2/94‑6 (MQ=255) cAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCt < 1:670332/100‑1 (MQ=11) cAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCt < 2:3071716/100‑1 (MQ=11) aGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGCCGCGTCTCATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTc > 1:2029585/1‑100 (MQ=9) gccAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCAGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTcc > 2:2981419/3‑100 (MQ=17) gACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTcc > 2:500313/1‑100 (MQ=32) gACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTcc > 2:689308/1‑100 (MQ=32) gACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTcc < 2:1181583/100‑1 (MQ=32) gACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACAGCCAACGCCCGAGCCGGTTTCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTcc < 1:1012388/100‑1 (MQ=12) cAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCt < 1:858575/96‑1 (MQ=11) aGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc < 2:2937063/100‑1 (MQ=38) aGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc < 1:1426808/100‑1 (MQ=38) aGGCGGTCACGCCGCAACCGACACGCAACGCCCGAGCCGGTGGCCTGATGCGCCGCTCGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc < 2:2195431/100‑1 (MQ=11) ggCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGCGGTGCACCAccc > 2:1894716/1‑99 (MQ=255) cGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGt > 2:3431052/1‑100 (MQ=38) ggTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTa < 1:2237174/100‑1 (MQ=38) gTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGAGCGTCTTATCAGGCCGACACGGCGGTCGAGGGCTCGAcc > 1:897236/1‑94 (MQ=11) tCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGG < 1:3429615‑M1/100‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGAGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTa > 1:3735201/1‑97 (MQ=18) cgccgcATCCGACATCCAACGCCCCAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTtg < 1:3662557‑M1/100‑3 (MQ=255) gccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCATCCCGTAGGTCGG < 2:3471540‑M1/100‑1 (MQ=255) gccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGG > 1:3216682‑M1/1‑100 (MQ=255) gcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGAAGCGCCGCTGGCGCGTCTAATCAGGCCTACACCGCTGTGACGTGCTGCACCCCGTAGGTCGGAca > 1:2122101‑M1/1‑98 (MQ=255) cATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATaa < 1:1958448/100‑1 (MQ=32) cATCCGACATCCAACGCCCCGGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCG < 1:2833676‑M1/95‑1 (MQ=255) tCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAgg > 1:1731755/1‑100 (MQ=33) ccGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc > 2:1152995/1‑100 (MQ=33) ccGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc > 2:2476291/1‑100 (MQ=33) ccGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCGGGGGCGACACGTCAGGCCTACACCGCTGTGGAGTGCTCGACCCCGGAGGTCGGATAAgg > 2:2587912/1‑99 (MQ=11) cGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCg > 2:3272166/1‑100 (MQ=33) cGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCg > 2:1042238/1‑100 (MQ=33) cGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCg > 2:2327126/1‑100 (MQ=18) aCATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGt < 2:2521436/100‑1 (MQ=32) cATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt > 2:2121407/1‑100 (MQ=33) aTCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTa > 2:3350307/1‑100 (MQ=33) tctaaCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAc > 1:2481386/4‑100 (MQ=18) tCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaacc > 1:2742081‑M1/1‑89 (MQ=255) tCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAc > 1:3228040/1‑100 (MQ=33) tCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAc > 1:649700/1‑100 (MQ=33) tCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCggagat > 1:3254469/1‑96 (MQ=255) ccAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCGACCCCGTAGGGCGGATGAGGCgggtgcg > 1:76041/1‑95 (MQ=11) ccAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcg > 2:1960137/1‑100 (MQ=33) ccAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGATCGGAGAAGGGGGTTGcg > 1:526316/1‑100 (MQ=11) cAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGt > 1:4251803/1‑95 (MQ=33) cAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgc > 2:1334942/1‑100 (MQ=33) cAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgc > 2:1462776/1‑100 (MQ=33) cAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgc > 1:3830864/1‑100 (MQ=33) cAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgc < 2:3829793/100‑1 (MQ=33) cAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgc < 1:4385524/100‑1 (MQ=32) cAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCCGAaagggcgg > 1:2083799‑M1/1‑86 (MQ=255) aaCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgcc < 2:140412/100‑1 (MQ=33) aaCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgcc < 2:3735227/100‑1 (MQ=32) aCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccg < 2:3304628/100‑1 (MQ=32) aCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccg < 2:547450/100‑1 (MQ=33) cGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccgc > 2:2408125/1‑100 (MQ=32) cGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccgc > 2:2011524/1‑100 (MQ=32) ccaagccGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATgcggcgtaaccgccttatc < 2:620631‑M1/97‑20 (MQ=255) ccGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatc < 2:3095342‑M1/100‑20 (MQ=255) ccGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatc < 1:1107374‑M1/100‑20 (MQ=255) taagcCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCCCCACCCCGTAGGTTGGATgcggcgtaaccgccttatcc < 2:852607‑M1/98‑21 (MQ=255) caagcCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATgcggcgtaaccgccttatcc < 1:2999539‑M1/98‑21 (MQ=255) cGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatcc < 2:2732237‑M1/100‑21 (MQ=255) cGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatcc < 1:805066‑M1/100‑21 (MQ=255) cGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatcc < 1:1767181‑M1/100‑21 (MQ=255) cGAGCCGCTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATgcggcgtaaccgccttatc < 1:1684301‑M1/99‑20 (MQ=255) aGCCGGTTGCCTGATGCAACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatccga < 2:4074680‑M1/100‑23 (MQ=255) gCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATgcggcgtaaccgccttatccaac < 1:984198‑M1/100‑24 (MQ=255) ccGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTATGTCGGATgcggcgtaaccgccttatccgacc < 2:3707299‑M1/100‑25 (MQ=255) cGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccg < 2:1565482‑M2/100‑71 (MQ=255) cGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATgcggcgtaaccgccttatccaacc < 1:4169082‑M1/99‑25 (MQ=255) ggTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagc < 1:2965399‑M2/100‑72 (MQ=255) ggTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgc < 2:2724947‑M2/100‑72 (MQ=255) ggTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgc < 2:3627345‑M2/100‑72 (MQ=255) ggTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggctcgggcgttagatgttggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagc < 1:2288554‑M2/100‑72 (MQ=255) gTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgca < 2:529859‑M2/100‑73 (MQ=255) gTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggctcggacgttggatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccaacctacggggtggagca < 2:3643242‑M2/100‑73 (MQ=255) gTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCaaccggttcggacgtgggatggctgatgcggcgtaaccgccttatctaacgtacagggtggagca > 1:2402863‑M1/1‑35 (MQ=255) ttGCTTGATGCGACGCTCGCCCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCCCCCCGTATGTCGGATgcggcgtaaccgccttatccgac < 1:3152020‑M1/95‑24 (MQ=255) ttGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTatcaggcaaccggctcgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcac < 1:1036796‑M2/100‑74 (MQ=255) ccTGATGCGACGCTGGCGCGTC‑ggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacag < 1:2376703‑M2/99‑77 (MQ=255) cTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggt > 1:1168476‑M1/1‑68 (MQ=255) cTGATGCGACGCTGGCGCG‑‑‑‑‑TCAGGCaaccggctcggacgttggatgtcggatgcggcgtcaccgccttatccaacctacggggtggagcacttcacagcg > 2:2276930‑M1/1‑25 (MQ=255) | CGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAG > NC_000913/2304509‑2304690 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |