| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2304653 | 46 (0.290) | 35 (0.240) | 7/164 | NT | 24.3% | noncoding (237/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 2304782 | 176 (1.220) | noncoding (366/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | |||||
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAA > NC_000913/2304684‑2304881 | gCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCa > 1:1656415‑M2/1‑99 (MQ=255)gCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCa < 2:2814788‑M2/100‑2 (MQ=255)gCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCa > 2:2231367‑M2/1‑99 (MQ=255)gCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCa > 1:50530‑M2/1‑99 (MQ=255) cccAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTCCACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCat < 1:3999021‑M2/100‑3 (MQ=255) cccAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCat < 2:250451‑M2/100‑3 (MQ=255) ccAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCatc < 1:1460846‑M2/100‑4 (MQ=255) ccAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCatc < 1:500883‑M2/100‑4 (MQ=255) cgagcCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCatcc > 1:2547207‑M2/3‑96 (MQ=255) cAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCatcc > 2:2028399‑M2/1‑96 (MQ=255) cAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCCCCACCCCGTAGGTTGGCTAAGGCGGTTACGCCGCatac < 2:1288061‑M2/100‑5 (MQ=255) aaGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCatccg > 2:4110076‑M2/1‑95 (MQ=255) ccGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTAAACCGGTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACa < 1:915165/100‑1 (MQ=12) cGGTGGCGTGATGCGATGCTGGTGCGTCTTAGCAGGCCTACCCCGCTGTGAAGTGCGCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCatcc > 1:838658‑M2/1‑91 (MQ=255) gTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATcc < 2:582488/100‑1 (MQ=35) gCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAAc > 2:2277782/1‑100 (MQ=38) ccTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACg > 1:4365756/1‑100 (MQ=35) ccTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGCTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACg < 2:1871962/100‑1 (MQ=255) cTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTCGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGt > 2:475062/1‑100 (MQ=255) gATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTcc < 2:1577103/100‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTcc < 1:2636882/100‑1 (MQ=40) aTGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCg < 2:3219732/100‑1 (MQ=255) tGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCg < 1:2232093/99‑1 (MQ=255) tGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGa > 2:894612/1‑100 (MQ=40) cGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGc < 2:4055717/100‑1 (MQ=255) gACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGcc < 2:1952902/100‑1 (MQ=255) aCGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCCCCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCg < 2:4271616/100‑1 (MQ=255) cGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGcc > 1:2957808/1‑98 (MQ=40) cGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCgg > 2:2731652/1‑100 (MQ=255) cTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGacgtgcgacgtgcggg > 1:1742352/1‑92 (MQ=11) gcgcGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTgcc < 1:3323916‑M2/100‑4 (MQ=255) gcgcGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTgcc < 1:192568‑M2/100‑4 (MQ=255) gcgcGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTg > 1:1062851‑M2/1‑97 (MQ=255) cgcgTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCatccgacctacggggtggagcagatcggaag < 2:1663101‑M2/100‑32 (MQ=255) tcttcttATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTgcctg > 1:3084683‑M2/4‑95 (MQ=255) cgTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTgcctga > 1:3426399‑M2/1‑94 (MQ=255) cgTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTgcctga < 2:3967894‑M2/100‑7 (MQ=255) gTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTgcctga > 2:775908‑M2/1‑93 (MQ=255) tCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTgcctgttg < 2:236384‑M2/100‑9 (MQ=255) tCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTgcctgaga < 2:3084701‑M2/100‑9 (MQ=255) tCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATg < 2:1372588/100‑1 (MQ=255) tCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATg < 2:3247534/100‑1 (MQ=255) tCTTACCAGGCATCCCCCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATg < 2:821181/100‑1 (MQ=14) cggatcaGGGCTACACCGCTGTGAAGTGCTGCACCCCGTAGGTCAGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTgcc > 1:3376060‑M2/4‑91 (MQ=255) aTCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCCCATCCGACATCCAGCGGCCGAGGCGGTTGCCTGTTGCGa > 1:619166/1‑99 (MQ=11) cAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGc > 2:1927757/1‑100 (MQ=255) aGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCGGACGTGCGTGGTGGATGCCTGGAGCGACGCt > 1:75649/1‑100 (MQ=11) ggCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTg < 2:2555158/100‑1 (MQ=255) ggCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTg > 2:340505/1‑100 (MQ=40) ggCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTg > 2:1060034/1‑100 (MQ=40) cTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGgcg < 2:4142334/100‑1 (MQ=255) acCGCTGTGAAGTGCGCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTc < 1:1348109/100‑1 (MQ=255) ctgCTGTGAAGTGCTCCGCCCCGTAGGTGGGATAAGGCGGTTTCGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCt < 1:4069892/98‑1 (MQ=14) ccgccgGGAAGTTCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCACCGTGCGAGGCGGTTGCGTGGTGCGCCGGTggtgtgtat > 1:3017681/1‑93 (MQ=14) gCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTa < 2:2512967/100‑1 (MQ=255) cTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTgcctgacgcgccagcgtcgcatcaggc > 1:3244298‑M2/1‑73 (MQ=255) gtgAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCa > 1:3524564/1‑100 (MQ=255) gtgAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCa < 2:3643798/100‑1 (MQ=40) gAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAgg < 2:3524588/100‑1 (MQ=255) taGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAgc < 1:1533660/98‑2 (MQ=2) gTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCt > 2:2058045/1‑100 (MQ=255) gTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCt > 2:3008862/1‑100 (MQ=255) tGCTCCACCCTGTACGTTAGATAAGGCGGTTACGCCGCATCAGCCATCCCACGTCCGAACCGGTTgcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaac > 1:2402863‑M2/1‑65 (MQ=255) tGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTa < 2:2151412/100‑1 (MQ=255) gCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTac < 2:78886/100‑1 (MQ=255) ccACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAgcataccacc > 1:2517295/1‑91 (MQ=255) ccACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACAcc < 1:4207888/100‑1 (MQ=255) ccACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACAcc < 2:2898913/100‑1 (MQ=255) aCCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGc < 1:4117241/100‑1 (MQ=255) cccGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCtg > 1:641513/1‑100 (MQ=255) cccGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCtg < 2:1437775/100‑1 (MQ=255) cccGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCtg < 2:608716/100‑1 (MQ=255) aGGTTGGATAAGGTGGTTACGCCGCatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccg < 1:1128719‑M2/100‑76 (MQ=255) aGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAg < 2:627384/100‑1 (MQ=255) ggTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccgg < 2:3817755‑M2/100‑77 (MQ=255) ggTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCTTACACCGCTGCGAAGt > 1:291695/1‑100 (MQ=255) ggTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGt > 2:3169930/1‑100 (MQ=255) gTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACCCCGCTGTGAAGTg > 2:1774378/1‑100 (MQ=255) gTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggc < 2:3898353‑M2/100‑78 (MQ=255) gTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCatccgacatacgggggggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgggcgagcgtcgcatcaagcaa < 1:3152020‑M2/95‑73 (MQ=255) cagatAAGGCGGTTACGCCGCatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggctc < 2:2975117‑M2/98‑80 (MQ=255) ggATAAGGCGGTTACGCCGCatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggctcg < 1:1767181‑M2/100‑81 (MQ=255) ggATAAGGCGGTTACGCCGCatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgcccgcgtcgcatcaggcaaccggcttg < 2:3735753‑M2/100‑81 (MQ=255) ggATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACACCCAACGTCCGAGCCGCTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAg < 1:2177548/95‑1 (MQ=255) gATAAGGCGGTTACGCCGCatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggctcgg < 2:2742098‑M2/100‑82 (MQ=255) gATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTcc < 1:2075701/100‑1 (MQ=40) atatcgatgTTAGGCTGCATCGGACATGGAACGTCCGAGCCGGCTGCCTGATGAGACGCTGGCGCGTCGTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCa < 1:1473362/92‑1 (MQ=11) tAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAc < 2:1979141/100‑1 (MQ=38) aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc < 1:325964/100‑1 (MQ=35) aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc < 1:3160221/100‑1 (MQ=38) aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc > 2:915657/1‑100 (MQ=38) aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCCGGAGCGTCGTCTCGGAGCGACACCGCGGTGATGTGCTCAAccc > 1:379812/1‑100 (MQ=14) ctgTTCCGCCGCATCCGGCATCCAACGTCCAAGCCGGTTGGCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc < 1:2822951/95‑1 (MQ=11) cGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGt < 2:3154900/100‑1 (MQ=38) cGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGt < 2:3310443/100‑1 (MQ=35) cgccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCg > 2:4226544/1‑100 (MQ=33) gccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCgg > 2:3611457/1‑100 (MQ=33) gcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATa < 2:2101390/100‑1 (MQ=32) cATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATaa < 2:971617/100‑1 (MQ=33) cATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATa > 1:69967/1‑99 (MQ=32) | GCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAA > NC_000913/2304684‑2304881 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |