Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
JC NC_000913 2,765,463 (TATGGCAC)6→8 79.8% intergenic (‑310/+50) yfjL ← / ← yfjM CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein

New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? NC_000913 2765412 =19 (0.210)34 (0.630) 23/106 NT 79.8% intergenic (‑259/+101) yfjL/yfjM CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein
?NC_000913 = 2765427 6 (0.110)intergenic (‑274/+86) yfjL/yfjM CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein

Only 100 of 148 total aligned reads displayed.

AATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCAC  >  NC_000913/2765313‑2765509
                                                                                                   |                                                                                                 
atactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagtacagagatgagaccgacaaccgcactatggcactatgg                                                                                                   <  1:1741881‑M1/1‑1 (MQ=255)
aaTTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCg                                                                                                   >  2:1850049/1‑100 (MQ=255)
 tactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggc                                                                                                  <  1:1764507‑M1/2‑1 (MQ=255)
 tactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggc                                                                                                  >  2:2433703‑M1/99‑100 (MQ=255)
 tactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggc                                                                                                  >  2:237191‑M1/99‑100 (MQ=255)
 aTTTGGTTATATAACATATTGCCACAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgc                                                                                                  <  1:407372/100‑1 (MQ=255)
   ntgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcac                                                                                                <  1:1050905‑M1/4‑1 (MQ=255)
   ctgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcac                                                                                                <  2:318154‑M1/4‑1 (MQ=255)
     gccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcacta                                                                                              <  2:479236‑M1/6‑1 (MQ=255)
      gTTATGTCACATACTGCCCCAACTAACGTACGGTAGGCTCAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGGTCAGAGCTGAGACCGCCAACAgcact                                                                                               >  1:305727/1‑98 (MQ=255)
      gTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGATTTGGTATTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgcactat                                                                                             >  1:893230/1‑100 (MQ=255)
       ttATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgcactatg                                                                                            <  2:1954485/100‑1 (MQ=255)
       cccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatg                                                                                            >  2:1663112‑M1/93‑100 (MQ=255)
         atataACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgcactatggc                                                                                          <  2:2003476/100‑1 (MQ=255)
          tataACATACTGCCCGAACTAAAGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAGGGGTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCGAACCgcactatggca                                                                                         <  1:1904696/100‑1 (MQ=255)
          aactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggca                                                                                         <  2:438791‑M1/11‑1 (MQ=255)
            taACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgcactatggcact                                                                                       >  2:90241/1‑100 (MQ=255)
            taACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgcactatggcact                                                                                       >  1:272568/1‑100 (MQ=255)
             aaCATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgcactatggcacta                                                                                      <  2:1502112/100‑1 (MQ=255)
               cATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTATGCACAGCCTTAATCAAGGTGTTGGGTTTCAAATAGTTCAGAGCTTAGACCGCCAACCgcacgatggcactatg                                                                                    >  2:117689/1‑100 (MQ=255)
               cATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGCTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgcactatggcactatg                                                                                    <  1:1383927/100‑1 (MQ=255)
               acgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatg                                                                                    >  1:489591‑M1/85‑100 (MQ=255)
                cgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatgg                                                                                   <  2:1189959‑M1/17‑1 (MQ=255)
                 tACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCCGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgc                                                                                  <  1:192545‑M2/100‑3 (MQ=255)
                 tACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgc                                                                                  >  2:2433703‑M2/1‑98 (MQ=255)
                 tACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgc                                                                                  >  2:237191‑M2/1‑98 (MQ=255)
                 tACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgc                                                                                  <  1:1764507‑M2/100‑3 (MQ=255)
                 tACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGAAGAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTGCAGAGCTGAGACCGACAACCgcactatggcactat                                                                                     >  1:190669/1‑97 (MQ=255)
                  taaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggca                                                                                 <  2:1936210‑M1/19‑1 (MQ=255)
                   cTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcac                                                                                <  2:318154‑M2/100‑5 (MQ=255)
                   aaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactattgcactatggca                                                                                 >  1:858006‑M1/81‑99 (MQ=255)
                   aaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcac                                                                                >  2:2043885‑M1/81‑100 (MQ=255)
                     ggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactattgcacta                                                                              >  2:1321425‑M1/79‑100 (MQ=255)
                     gCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcacta                                                                              >  1:1327221‑M2/1‑94 (MQ=255)
                     gCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcacta                                                                              <  2:479236‑M2/100‑7 (MQ=255)
                        ccAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatgg                                                                           >  2:1202932‑M2/1‑91 (MQ=255)
                          aaCTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggca                                                                         <  2:438791‑M2/100‑12 (MQ=255)
                           cacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcac                                                                        >  2:2069746‑M1/73‑100 (MQ=255)
                             cagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcacta                                                                      <  1:1795405‑M1/30‑1 (MQ=255)
                                ccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatgg                                                                   <  2:1979300‑M1/33‑1 (MQ=255)
                                cGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatgg                                                                   >  2:2240498‑M2/1‑83 (MQ=255)
                                cGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGATATTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGACACTATGgcactatggcactatg                                                                    <  1:143118‑M2/99‑17 (MQ=255)
                                   taatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcac                                                                >  2:1096074‑M1/65‑100 (MQ=255)
                                   aaGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactattgcactatggca                                                                 >  1:858006‑M2/1‑80 (MQ=255)
                                     ggTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcacta                                                              >  1:45759‑M2/1‑78 (MQ=255)
                                        aaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatgg                                                           >  2:79970‑M1/60‑100 (MQ=255)
                                         aggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggctaaaaatg                                                          <  2:1195821‑M1/42‑9 (MQ=255)
                                         aggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggc                                                          <  1:1038381‑M1/42‑1 (MQ=255)
                                         aggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggc                                                          >  2:2571597‑M1/59‑100 (MQ=255)
                                          ggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatg                                                            <  1:111998‑M1/40‑1 (MQ=255)
                                          gCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggca                                                         >  2:2105448‑M2/1‑73 (MQ=255)
                                           gttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcac                                                        <  2:2425905‑M1/44‑1 (MQ=255)
                                           gttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaacgcactatggcactatgacactaaggaactatcgcactatggcactatggcactatggcac                                                        <  1:1932033‑M1/44‑1 (MQ=255)
                                           cacaGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcac                                                        >  2:2069746‑M2/1‑72 (MQ=255)
                                             caGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcacta                                                      <  1:1795405‑M2/100‑31 (MQ=255)
                                               tggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactattgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatg                                                    >  2:883942‑M1/53‑100 (MQ=255)
                                                   tttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcac                                                >  2:1534348‑M1/49‑100 (MQ=255)
                                                   tttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcac                                                <  2:2346925‑M1/52‑1 (MQ=255)
                                                   tAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcac                                                >  2:439367‑M2/1‑64 (MQ=255)
                                                     aTCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcacta                                              <  2:2390297‑M2/100‑39 (MQ=255)
                                                        aaGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatgg                                           >  2:79970‑M2/1‑59 (MQ=255)
                                                         aGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggctaaaaatg                                          <  2:1195821‑M2/100‑43 (MQ=255)
                                                         aGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggc                                          >  2:2571597‑M2/1‑58 (MQ=255)
                                                         aGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggc                                          <  1:1038381‑M2/100‑43 (MQ=255)
                                                          ggttttggttttCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatg                                            <  1:111998‑M2/97‑41 (MQ=255)
                                                           gttttggttttCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAAACGCACTATGGCACTATGacactaaggaactatcgcactatggcactatggcactatggcac                                        <  1:1932033‑M2/100‑45 (MQ=255)
                                                            gttcagagctaagaccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCGCTATGGCACTATGGCACTATGGCACTAGGGCACTATGGGATCGCCa                                           <  1:1297992‑M1/57‑1 (MQ=255)
                                                               tggttttCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATTGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatg                                    >  2:883942‑M2/1‑52 (MQ=255)
                                                                 gagctgagaccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTa                                  <  2:716278‑M1/66‑1 (MQ=255)
                                                                   tttCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcac                                >  2:1534348‑M2/1‑48 (MQ=255)
                                                                   tttCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatgacactatggcac                                <  1:937539‑M2/100‑53 (MQ=255)
                                                                   gctgagaccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGt                                   <  1:2171895‑M1/65‑1 (MQ=255)
                                                                   gctgagaccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAAt                                <  2:858150‑M1/68‑1 (MQ=255)
                                                                          ccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCTCCAGCGATTGTAATca                              <  1:1334299‑M1/70‑1 (MQ=255)
                                                                          ccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACtt                         >  2:2445737‑M1/26‑100 (MQ=255)
                                                                          ccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACtt                         <  2:397535‑M1/75‑1 (MQ=255)
                                                                           cgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCCGCGATTGTAATcaca                            <  1:2013438‑M1/72‑1 (MQ=255)
                                                                             ccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCCCTCTGGCACCGCCCGCGAACGTAATCAGACtt                         <  1:1930893‑M1/75‑1 (MQ=255)
                                                                              tCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcaccatggcactatggcaccgccagcgatt                     >  2:1577863‑M2/1‑37 (MQ=255)
                                                                               aaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGatat                    >  1:1307194‑M1/21‑100 (MQ=255)
                                                                                 gagCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgta                  <  1:1973271‑M2/100‑67 (MQ=255)
                                                                                 gagCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgta                  <  2:716278‑M2/100‑67 (MQ=255)
                                                                                 accgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGAtatta                  >  2:445113‑M1/19‑100 (MQ=255)
                                                                                   gcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATtata                <  2:2251031‑M1/84‑1 (MQ=255)
                                                                                   gCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgt                   <  1:2171895‑M2/97‑66 (MQ=255)
                                                                                    cactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATaa               <  1:2011598‑M1/85‑1 (MQ=255)
                                                                                     tGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgatcgtaatca              <  1:866257‑M2/100‑71 (MQ=255)
                                                                                     actatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATaaa              >  1:1222724‑M1/15‑100 (MQ=255)
                                                                                      gagaCCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATaaaa             <  2:1846307/100‑1 (MQ=255)
                                                                                      ctatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATaaaa             >  2:2156417‑M1/14‑100 (MQ=255)
                                                                                       tatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACGATGGCACTATGGCACTATGGCAGTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATGTTATaaa              >  1:1360841‑M1/13‑98 (MQ=255)
                                                                                          ccGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacactt         <  2:397535‑M2/100‑76 (MQ=255)
                                                                                           gcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCGAGCGATTGTAATAACACTTGATATTATAAAccac          <  1:392987‑M1/90‑1 (MQ=255)
                                                                                           cGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacacttg        >  2:885893‑M2/1‑24 (MQ=255)
                                                                                              ctatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTg     <  2:1918811‑M1/95‑1 (MQ=255)
                                                                                               aaCCGCACTATGGGACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacacttgatat    >  2:84232‑M2/1‑20 (MQ=255)
                                                                                               aaCCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacacttgatat    >  1:1307194‑M2/1‑20 (MQ=255)
                                                                                                aCCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCACCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGc    >  1:712756/1‑99 (MQ=255)
                                                                                                 tgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCAc  <  2:2314219‑M1/98‑1 (MQ=255)
                                                                                                 tgGCACTAGGGCACTATGGCACTATGGCATTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCa   >  1:620899‑M1/3‑99 (MQ=255)
                                                                                                   |                                                                                                 
AATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCAC  >  NC_000913/2765313‑2765509

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.