Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC | NC_000913 | 2,765,463 | (TATGGCAC)6→8 | 79.8% | intergenic (‑310/+50) | yfjL ← / ← yfjM | CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2765412 = | 19 (0.210) | 34 (0.630) | 23/106 | NT | 79.8% | intergenic (‑259/+101) | yfjL/yfjM | CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
? | NC_000913 | = 2765427 | 6 (0.110) | intergenic (‑274/+86) | yfjL/yfjM | CP4‑57 putative defective prophage, DUF4297/DUF1837 polymorphic toxin family protein/CP4‑57 prophage; uncharacterized protein |
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
CATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTG > NC_000913/2765328‑2765526 | cATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTATGCACAGCCTTAATCAAGGTGTTGGGTTTCAAATAGTTCAGAGCTTAGACCGCCAACCgcacgatggcactatg > 2:117689/1‑100 (MQ=255) cATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGCTCAGAGCTGAGACCGCCAACCgcactatggcactatg < 1:1383927/100‑1 (MQ=255) acgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatg > 1:489591‑M1/85‑100 (MQ=255) cgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatgg < 2:1189959‑M1/17‑1 (MQ=255) tACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCCGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgc < 1:192545‑M2/100‑3 (MQ=255) tACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgc < 1:1764507‑M2/100‑3 (MQ=255) tACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgc > 2:237191‑M2/1‑98 (MQ=255) tACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgc > 2:2433703‑M2/1‑98 (MQ=255) taaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggca < 2:1936210‑M1/19‑1 (MQ=255) cTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcac < 2:318154‑M2/100‑5 (MQ=255) aaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactattgcactatggca > 1:858006‑M1/81‑99 (MQ=255) aaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcac > 2:2043885‑M1/81‑100 (MQ=255) ggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactattgcacta > 2:1321425‑M1/79‑100 (MQ=255) ggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcacta > 1:45759‑M1/79‑100 (MQ=255) gCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcacta > 1:1327221‑M2/1‑94 (MQ=255) gCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcacta < 2:479236‑M2/100‑7 (MQ=255) cccAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatg > 2:1663112‑M2/1‑92 (MQ=255) gcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggca > 2:2105448‑M1/74‑100 (MQ=255) aaCTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggca < 2:438791‑M2/100‑12 (MQ=255) cagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcacta < 1:1795405‑M1/30‑1 (MQ=255) aCGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatg > 1:489591‑M2/1‑84 (MQ=255) ccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatgg < 2:1979300‑M1/33‑1 (MQ=255) cGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatgg > 2:2240498‑M2/1‑83 (MQ=255) cGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGATATTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGACACTATGgcactatggcactatg < 1:143118‑M2/99‑17 (MQ=255) taatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcac > 2:1096074‑M1/65‑100 (MQ=255) taatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcac > 2:439367‑M1/65‑100 (MQ=255) aaGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcac > 2:2043885‑M2/1‑80 (MQ=255) aggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggctaaaaatg < 2:1195821‑M1/42‑9 (MQ=255) aggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggc > 2:2571597‑M1/59‑100 (MQ=255) aggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggc < 1:1038381‑M1/42‑1 (MQ=255) ggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatg < 1:111998‑M1/40‑1 (MQ=255) gttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcac < 2:2425905‑M1/44‑1 (MQ=255) gttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaacgcactatggcactatgacactaaggaactatcgcactatggcactatggcactatggcac < 1:1932033‑M1/44‑1 (MQ=255) cacaGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcac > 2:2069746‑M2/1‑72 (MQ=255) caGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcacta < 1:1795405‑M2/100‑31 (MQ=255) ccTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatgg < 2:1979300‑M2/100‑34 (MQ=255) tttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcac > 2:1534348‑M1/49‑100 (MQ=255) aTCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcacta < 2:2390297‑M2/100‑39 (MQ=255) aaGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatgg > 2:79970‑M2/1‑59 (MQ=255) aGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggctaaaaatg < 2:1195821‑M2/100‑43 (MQ=255) aGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggc > 2:2571597‑M2/1‑58 (MQ=255) aGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggc < 1:1038381‑M2/100‑43 (MQ=255) ggttttggttttCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGc < 2:395029/100‑1 (MQ=255) gttttggttttAAAATAGTGAAAAGCTGCGAACGTCTACCGAACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATCGCACTATGGCACCGCCAGCg < 1:232230/100‑1 (MQ=18) gttcagagctaagaccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCGCTATGGCACTATGGCACTATGGCACTAGGGCACTATGGGATCGCCa < 1:1297992‑M1/57‑1 (MQ=255) tttggttttCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGAt < 2:751054/100‑1 (MQ=255) tggttttCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATTGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatg > 2:883942‑M2/1‑52 (MQ=255) gagctgagaccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTa < 1:1973271‑M1/66‑1 (MQ=255) gagctgagaccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTa < 2:716278‑M1/66‑1 (MQ=255) tttCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcac < 2:2346925‑M2/100‑53 (MQ=255) tttCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcac > 2:1534348‑M2/1‑48 (MQ=255) tttCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatgacactatggcac < 1:937539‑M2/100‑53 (MQ=255) gctgagaccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAAt < 2:858150‑M1/68‑1 (MQ=255) tgagaccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATCGTAATca < 1:866257‑M1/70‑1 (MQ=255) ccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACtt > 2:2445737‑M1/26‑100 (MQ=255) ccgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACtt < 2:397535‑M1/75‑1 (MQ=255) cgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCCGCGATTGTAATcaca < 1:2013438‑M1/72‑1 (MQ=255) cgccaaccgcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTg > 2:885893‑M1/25‑100 (MQ=255) gTTCAGAGCTAAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcgctatggcactatggcactatggcactagggcactatgggatcgcca < 1:1297992‑M2/96‑58 (MQ=255) tCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcaccatggcactatggcaccgccagcgatt > 2:1577863‑M2/1‑37 (MQ=255) aaccgcactatgggactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGatat > 2:84232‑M1/21‑100 (MQ=255) gagCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgta < 1:1973271‑M2/100‑67 (MQ=255) accgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGAtatta > 2:445113‑M1/19‑100 (MQ=255) gcactatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATtata < 2:2251031‑M1/84‑1 (MQ=255) gCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaat < 2:858150‑M2/100‑69 (MQ=255) gCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgt < 1:2171895‑M2/97‑66 (MQ=255) tGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgatcgtaatca < 1:866257‑M2/100‑71 (MQ=255) actatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATaaa > 1:1222724‑M1/15‑100 (MQ=255) ntatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGCATGTAATCACACTTGATATTATaaaa < 2:971210‑M1/87‑1 (MQ=255) gagaCCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATaaaa < 2:1846307/100‑1 (MQ=255) ctatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATaaaa > 2:2156417‑M1/14‑100 (MQ=255) tatggcactatgGCACTATGGCACTATGGCACGATGGCACTATGGCACTATGGCAGTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATGTTATaaa > 1:1360841‑M1/13‑98 (MQ=255) ccGCCAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcacctccagcgattgtaatca < 1:1334299‑M2/95‑71 (MQ=255) gcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCGAGCGATTGTAATAACACTTGATATTATAAAccac < 1:392987‑M1/90‑1 (MQ=255) gacaaaccCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGTAAACGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAaca > 1:1476584‑M1/9‑96 (MQ=255) ccAACCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggccctctggcaccgcccgcgaacgtaatcagactt < 1:1930893‑M2/97‑76 (MQ=255) aaCCGCACTATGGCACTATGgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacacttgatat > 1:1307194‑M2/1‑20 (MQ=255) aCCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCACCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGc > 1:712756/1‑99 (MQ=255) tgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCAc < 2:2314219‑M1/98‑1 (MQ=255) accgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacacttgatatta > 2:445113‑M2/11‑18 (MQ=255) ggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatgACACCGTCAGCGCTTGTAATAAGACGTGATATTCTAAACCCCAGtt > 1:1833192/2‑95 (MQ=18) cactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacacttgatattataa < 1:2011598‑M2/100‑86 (MQ=255) ctatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacacttgatattataaaa > 2:2156417‑M2/1‑13 (MQ=255) CTATGGCACTATGGTACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCatt > 1:1763678‑M1/1‑100 (MQ=255) CTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCatt < 2:1788320‑M1/100‑1 (MQ=255) CTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCatt > 1:1402563‑M1/1‑100 (MQ=255) ATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCAAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCatta > 1:116464‑M1/1‑99 (MQ=255) TGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCattatt > 1:2088438‑M1/1‑100 (MQ=255) gcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacacttgatattataaaacacag < 2:283904‑M2/100‑93 (MQ=255) gcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacacttgatattataaaacacag > 2:697208‑M2/1‑8 (MQ=255) gcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacacttgatattataaaacaca < 1:839565‑M2/99‑92 (MQ=255) GCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTc < 1:2017680‑M1/100‑1 (MQ=255) ACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCt > 1:392461‑M1/1‑100 (MQ=255) ctatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacacttgatattataaaacacagttg < 2:1918811‑M2/100‑96 (MQ=255) TATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCtgg > 2:517832‑M1/1‑100 (MQ=255) ATGGCACTATGGCACCATGGAACTATGGCAATATGGCACCGACAGCGATTGTAATAACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCtggt > 1:1091215‑M1/1‑100 (MQ=255) tggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacacttgatattataaaacacagttgcac < 2:2314219‑M2/100‑99 (MQ=255) tggcactagggcactatggcactatggcattatggcactatggcactatggcaccgccagcgattgtaatcacacttgatattataaaacacagttgca > 1:620899‑M2/1‑2 (MQ=255) GGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCtggttg < 1:414630‑M1/100‑1 (MQ=255) GGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCtggttg < 2:725319‑M1/100‑1 (MQ=255) | CATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTG > NC_000913/2765328‑2765526 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |