| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3423259 = | 126 (1.370) | 88 (1.070) | 55/160 | NT | 58.3% | intergenic (+65/+164) | yhdZ/rrfF | putative amino acid ABC transporter ATPase/5S ribosomal RNA of rrnD operon |
| ? | NC_000913 | 4213156 = | 13 (0.160) | noncoding (117/120 nt) | rrfE | 5S ribosomal RNA of rrnE operon | |||||
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
CGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTG > NC_000913/3423163‑3423357 | gAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGc < 2:1931456/100‑1 (MQ=255) tacagaactgacatgagattcccttcatcatgcaaataattgatatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGt < 2:799177‑M1/8‑1 (MQ=255) tacagaactgacatgagattcccttcatcatgcaaataattgatatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGt < 1:1575538‑M1/8‑1 (MQ=255) gCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGtt < 1:1676474/100‑1 (MQ=255) cagaactgacatgagattcccttcatcatgcaaataattgatatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGttt < 2:2118082‑M1/10‑1 (MQ=255) cATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGttt > 1:24208/1‑100 (MQ=255) gaactgacatgagattcccttcatcatgcaaataattgatatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTAt < 1:2379682‑M1/12‑1 (MQ=255) ctgacatgagattcccttcatcatgcaaataattgatatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATggc > 2:567710‑M1/86‑100 (MQ=255) gacatgagattcccttcatcatgcaaataattgatatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATggcgg < 1:1103893‑M1/17‑1 (MQ=255) aTCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATggcgg > 1:1078027/1‑100 (MQ=255) tCGCAGGTAATTCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATggcggg < 1:1763557/100‑1 (MQ=255) catgagattcccttcatcatgcaaataattgatatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATggcgggc > 2:1967267‑M1/82‑100 (MQ=255) tgagattcccttcatcatgcaaataattgttatgctaaaaaccccggccttatggacctgggtttgtttaattttatgtCTGGCAGTTTATggcgg < 1:2327834‑M1/17‑1 (MQ=255) cAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGt > 2:504646/1‑100 (MQ=255) cAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGt > 2:1127361/1‑100 (MQ=255) aGGTAAGCCATTAATTGAATGCTCATGCGAATAGCAAAAAGGCCATTCTTTCGGATGGCCTGTCGCTTGATTTGATTTCTGGCAGTTTATggcgggcg < 1:2402638/98‑1 (MQ=21) agattcccttcatcatgcaaataattgatatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTcc > 1:879732‑M1/78‑100 (MQ=255) agattcccttcatcatgcaaataattgatatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTcc > 2:599761‑M1/78‑100 (MQ=255) gattcccttcatcatgcaaataattgatatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGtttatggcgggcaggac > 2:682985‑M1/77‑95 (MQ=255) tAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTGTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTg > 1:1435906/1‑100 (MQ=255) ttcccttcatcatgcaaataattgatatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTccttc < 1:1038053‑M1/26‑3 (MQ=255) ttcccttcatcatgcaaataattgatatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGc > 2:1296575‑M1/75‑100 (MQ=255) aaTCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGc < 1:414143/100‑1 (MQ=255) tcccttcatcatgcaaataattgatatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGcc < 1:837847‑M1/27‑1 (MQ=255) tCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGccc > 2:1072931/1‑100 (MQ=255) tCCATGAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTCCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGcc < 1:551640/99‑1 (MQ=255) ccttcatcatgcaaataattgatatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCt < 1:472909‑M1/24‑1 (MQ=255) ccttcatcatgcaaataattgatatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCg < 2:2578500‑M1/29‑1 (MQ=255) cATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAATGGTATCCTTTCGGATGGCGTGTAGCTTGATTTGATGACTGGCGGt > 1:2121221/1‑78 (MQ=255) cATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGc > 2:1553844/1‑100 (MQ=255) aTTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGcc < 2:555236/100‑1 (MQ=255) tcatcatgcaaataattgatatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCa > 1:1229238‑M1/69‑100 (MQ=255) aTTGAGTGTTAGTTCGAAAAGGAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTGATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCAccc < 1:152842/100‑1 (MQ=255) catgcaaataattgatatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCt < 1:1308885‑M1/36‑1 (MQ=255) tGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTc > 2:2450360/1‑100 (MQ=255) tGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTc < 2:691448/100‑1 (MQ=255) gcaaataattgatatgcaaaaaaccccggccttatggaacggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATACCGGGCGTCCTTCCCGCCACCCTCCg < 2:1666164‑M1/39‑1 (MQ=255) aataattgatatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGc < 2:609739‑M1/42‑1 (MQ=255) aGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGt > 2:835449/1‑100 (MQ=255) gTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGtt < 2:94904/100‑1 (MQ=255) attgatatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGtt > 2:18103‑M1/55‑100 (MQ=255) attgatatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGtt > 1:667134‑M1/55‑100 (MQ=255) gAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCtt > 1:1474607/1‑100 (MQ=255) atatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCtt > 2:679062‑M1/51‑100 (MQ=255) tatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTc < 2:757561‑M1/51‑1 (MQ=255) tatgcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGCttcttc < 1:2184963‑M1/51‑1 (MQ=255) aaaaGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTc > 1:315147/1‑100 (MQ=255) aaaGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCg < 2:368343/100‑1 (MQ=255) aaaGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGACGTTGCTTCg > 2:1261501/1‑100 (MQ=255) gcaaaancccccggccttatggaccgaggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCNTGCCNGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCa > 2:2101204‑M1/47‑100 (MQ=255) gcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGc < 1:584990‑M1/53‑1 (MQ=255) gcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCa < 1:99485‑M1/54‑1 (MQ=255) gcaaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCa < 1:736639‑M1/54‑1 (MQ=255) aGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCa < 2:2001833/100‑1 (MQ=255) aGCAAAAAGGCCATCCTTGCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTTCCCGCCACCCTCCGGGCCGGTCCTTCGc > 1:2237694/1‑99 (MQ=17) caaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCaa < 1:292429‑M1/55‑1 (MQ=255) caaaaaaccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCaa < 1:376605‑M1/55‑1 (MQ=255) gcagaaGGCCATCCTGACGGATGGCCTTCTGCTTAATTTGATGCCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAAc > 1:1632033/5‑100 (MQ=1) gcagaaGGCCATCCTGACGGATGGCCTTCTGCTTAATTTGATGCCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAAc > 2:416376/5‑100 (MQ=1) cAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGAATAGATGTATGTCAGTTTATGGCGGCGGTCCCGCCGGGCACCCTCCGGGGCGGTGCTTCGCAAc > 1:1629600/1‑100 (MQ=17) aaaaaGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACg > 2:2515731/1‑100 (MQ=255) aaaaaGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACg > 2:1736812/1‑100 (MQ=255) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTCTGCTTAATTTGATGCCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCa > 2:1052399/1‑100 (MQ=1) aGGCCATCCTGACGGATGGCCTTCTGCTTAATTTGATGCCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCa > 2:1437878/1‑100 (MQ=1) ggCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCaa > 1:716762/1‑100 (MQ=255) ccccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCaa < 2:952550‑M1/62‑1 (MQ=255) nccATCCTGACGGATGGCCTTCTGCTTAATTTGATGCCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCACCGTTCaaa > 1:1993553/2‑100 (MQ=1) gCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCaaa < 2:1335850/100‑1 (MQ=255) gCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCaaa > 2:1877552/1‑100 (MQ=255) cccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCaaa > 1:1249890‑M1/38‑100 (MQ=255) cccggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCaaa > 1:513245‑M1/38‑100 (MQ=255) ccATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAAt > 2:2164498/1‑100 (MQ=255) ccATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAAt > 1:619130/1‑100 (MQ=255) cATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATc > 2:862333/1‑100 (MQ=255) ggccttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATcc < 2:904526‑M1/66‑1 (MQ=255) tCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCg > 1:1949789/1‑100 (MQ=255) cttatggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCt > 2:203276‑M1/32‑100 (MQ=255) ggaccggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCcgg < 2:287591‑M1/74‑1 (MQ=255) ggATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCcgg > 2:2297587/1‑100 (MQ=255) gATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCcggc > 2:2402100/1‑100 (MQ=255) accggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCcggcg < 2:404237‑M1/76‑1 (MQ=255) accggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCcggcg > 2:635282‑M1/25‑100 (MQ=255) ggCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGa < 2:2268563/100‑1 (MQ=255) ggggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCcggcgg < 2:1191014‑M1/77‑1 (MQ=255) gggtttttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGAtt > 2:462775‑M1/21‑100 (MQ=255) ccTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGAtt < 2:1768638/100‑1 (MQ=255) tCGCTTGCTTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCTCTCCCGGCGGATTTGTc < 1:504379/100‑1 (MQ=255) tCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTc < 2:85428/100‑1 (MQ=40) tttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTcc > 2:1350121‑M1/16‑100 (MQ=255) cGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTcc < 2:716765/100‑1 (MQ=40) ttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCt < 2:211216‑M1/86‑1 (MQ=255) ttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCt > 1:453041‑M1/15‑100 (MQ=255) ttctaatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCt < 2:2371186‑M1/86‑1 (MQ=255) ttgatttgatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCCCTCCCGGCGGGTTTGTCCTAc > 1:1839669/1‑100 (MQ=255) taatttgatgcCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACt < 1:1315252‑M1/89‑1 (MQ=255) tttgatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTGCTCgg < 1:2495874/100‑1 (MQ=25) tgatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCgg > 1:115594/1‑98 (MQ=35) tgatGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGga > 2:1622657/1‑100 (MQ=38) atGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCGTCCGGGCCGTTGATTCGCAACGTTCAAATACGGTCCTGGCGGATTTGTCGTACTCggg > 1:2278609/1‑97 (MQ=11) tCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAgtg < 1:2572326/100‑1 (MQ=38) | CGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAATCCATTAATTGAATGTTAGTTCGAAAAGCAAAAAGGCCATCCTTTCGGATGGCCTTTCGCTTGATTTGATGTCTGGCAGTTTATGGCGGGCGTCCTGCCCGCCACCCTCCGGGCCGTTGCTTCGCAACGTTCAAATCCGCTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCGGGAGAGTG > NC_000913/3423163‑3423357 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |