| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3635910 = | 72 (0.790) | 17 (0.210) | 10/154 | NT | 20.3% | intergenic (+17/+298) | yhiM/yhiN | acid resistance protein, inner membrane/putative oxidoreductase |
| ? | NC_000913 | 3635946 = | 71 (0.900) | intergenic (+53/+262) | yhiM/yhiN | acid resistance protein, inner membrane/putative oxidoreductase | |||||
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
GAGTTCTGGTCGGTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTAACGCTGGTTTTTCTTAGGCATCATGAAATAACGCAGCATTAATGCATAGTGGTTAAGTATAAAAAACAGCAAAGT > NC_000913/3635811‑3636009 | ctttatgaaatatgaacaggttgagaaaaacagtaactttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaa < 2:838030‑M1/1‑1 (MQ=255) aGTTCTGGTCGGTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAA < 2:613355‑M1/100‑1 (MQ=255) gTTCTGGTCGGTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAA > 1:1791837‑M1/1‑100 (MQ=255) tatgaaatatgaacaggttgaaaaaaacagtaactttgatgtgttttatacgtaagcactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaaaaa < 1:600652‑M1/4‑1 (MQ=255) tCTGGTCGGTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAAC > 2:231251‑M1/1‑100 (MQ=255) atgaaatatgaacaggttgaaaaaaacagtaactttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAAc > 2:1066296‑M1/96‑100 (MQ=255) atgaaatatgaacaggttgaaaaaaacagtaactttgctgtattttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAAc < 1:1894756‑M1/5‑1 (MQ=255) tgaaatatgaacaggttgaaaaaaacagtcactttgctgttttttatacttaaccactatgcattagtgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAAcc > 1:1557102‑M1/95‑100 (MQ=255) tgaaatatgaacaggttgaaaaaaacagtaactttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAAcc < 1:451627‑M1/6‑1 (MQ=255) tgaaatatgaacaggttgaaaaaaacagtaactttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAAcc > 2:2028594‑M1/95‑100 (MQ=255) tgaaatatgaacaggttgaaaaaaacagtaactttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAAcc < 1:1365204‑M1/6‑1 (MQ=255) cTGGTCGGTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACC > 1:2441614‑M1/1‑100 (MQ=255) cTGGTCGGTGTGGGAGCGGTATGTTTGACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTGCCGGATAAAACC < 1:747495‑M1/100‑1 (MQ=255) ggTCGGTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAG > 2:1018869‑M1/1‑100 (MQ=255) ggTCGGTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAG < 2:582386‑M1/100‑1 (MQ=255) ggTCGGTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAG > 2:2243670‑M1/1‑100 (MQ=255) aaatatgaacaggttgaaaaaaacagtatctttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAACCAg > 1:931765‑M1/93‑100 (MQ=255) aaatatgaacaggttgaaaaaaacagtaactttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAACCAg < 1:183556‑M1/8‑1 (MQ=255) aatatgaacaggttgaaaaaaacagtaactttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAACCAGc > 1:2552492‑M1/92‑100 (MQ=255) ggTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTT > 2:2333215‑M1/1‑100 (MQ=255) gTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGCTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAActcaagcg > 1:1445838‑M1/1‑89 (MQ=255) gTTTGGGAGCAGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTg < 1:2119924/100‑1 (MQ=255) tttGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGa < 2:552009/100‑1 (MQ=255) tGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGAcc < 2:1419020/100‑1 (MQ=255) gAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCAtt < 2:1080396/100‑1 (MQ=255) gCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTacgcaaatg < 2:416371‑M1/100‑10 (MQ=255) gTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGGTAAAACCAGCGTAGAACATTTGCGt > 1:2485969/1‑100 (MQ=255) gCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTaacg < 1:514070‑M2/100‑5 (MQ=255) aacagtaactttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTAACGc > 1:825966‑M1/72‑100 (MQ=255) tttACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTacgcaaatggtcaacgct < 2:2183116‑M1/100‑19 (MQ=255) tACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTacgcaaatggtcaacgctgg < 1:2333201‑M1/100‑21 (MQ=255) tACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTacgcaaatggtcaacgctgg < 2:1250831‑M1/100‑21 (MQ=255) tACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTaacgctgg < 1:1149704‑M2/100‑9 (MQ=255) tACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTaacgctgg < 2:1214386‑M2/100‑9 (MQ=255) tACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTaacgctgg < 1:1326024‑M2/100‑9 (MQ=255) tACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTaacgctgg < 1:1325985‑M2/100‑9 (MQ=255) gtaactttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTAACGCTGGt > 2:1365212‑M1/68‑100 (MQ=255) gtaactttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTAACGCTGGt > 1:2515568‑M1/68‑100 (MQ=255) aCGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTacgcaaatggtcaacgctggt < 1:2310422‑M1/100‑22 (MQ=255) aCGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTacgcaaatggtcaacgctggt < 2:742746‑M1/100‑22 (MQ=255) taactttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTAACGCTGGtt > 2:1711470‑M1/67‑100 (MQ=255) taactttgctgttttttatacttaaccacgatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaTAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTAACGCTGGtt > 1:1553813‑M1/67‑100 (MQ=255) cGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTacgcaaatggtcaacgctggtt < 1:111534‑M1/100‑23 (MQ=255) cGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTacgcaaatggtcaacgctggtt < 2:1177412‑M1/100‑23 (MQ=255) cGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTacgcaaatggtcaacgctggtt < 1:371620‑M1/100‑23 (MQ=255) gttgttCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTaacgctggttt < 2:1787450‑M2/100‑12 (MQ=255) actttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTAACGCTGGtt > 2:2069607‑M1/65‑98 (MQ=255) tgttCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTacgcaaatggtcaacgctggttt < 2:2326421‑M1/98‑24 (MQ=255) gttCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTAACGCTGGTTTTTc < 2:1789857/100‑1 (MQ=255) ttgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTAACGCTGGTTTTTCt > 2:1490514‑M1/62‑100 (MQ=255) ttCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGAGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTacgcaaatggtcaacgctggttttatc < 1:1266090‑M1/100‑28 (MQ=255) tgctgttttttatacttaaccactatgcattaatgctgcgttatttcatgatgcctaagaAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTAACGCTGGTTTTTCtt > 1:2155576‑M1/61‑100 (MQ=255) tctcAATCGTTTCACTATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAAACAGCGTTGACCATTTGCGTAACGCTGGTTTTTCtt > 1:1159139/1‑100 (MQ=255) tctcAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTacgcaaatggtcaacgctggttttatcc < 2:1316380‑M1/100‑29 (MQ=255) ctcAATCGTTTTAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTacgcaaatggtcaacgctggttttatccg < 1:1056843‑M1/100‑30 (MQ=255) tcAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTAACGCTGGTTTTTCTTAg < 2:544021/100‑1 (MQ=255) 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GAGTTCTGGTCGGTTTGGGAGCGGTATGCTTTACGTTGTTCTCAATCGTTTCAATATTAGAAGCGGGTTCTGCTAAAAAATAATTGCAACGTACCGGATAAAACCAGCGTTGACCATTTGCGTAACGCTGGTTTTTCTTAGGCATCATGAAATAACGCAGCATTAATGCATAGTGGTTAAGTATAAAAAACAGCAAAGT > NC_000913/3635811‑3636009 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |