New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3344992 = | 81 (0.880) | 13 (0.160) | 7/158 | NT | 16.5% | coding (276/1434 nt) | rpoN | RNA polymerase, sigma 54 (sigma N) factor |
? | NC_000913 | 3345024 = | 60 (0.740) | coding (308/1434 nt) | rpoN | RNA polymerase, sigma 54 (sigma N) factor |
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
CCGACGCGCTCGAACAAAAAGAGATGCCGGAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGATGTGGCAGGTTGAGCTGACACCGTTTTCCGACAC > NC_000913/3344925‑3345123 | ccgACGCGCTCGAACAAAAAGAGATGCCGGAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGa < 2:1831209/100‑1 (MQ=255) tcaggtaatcctgcaaggtctgcgtcgtttcgccctggtagaccggcagctcgtcgtcaatgtagtCACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGAc > 2:771088‑M1/67‑100 (MQ=255) gACGCGCTCGAACAAAAAGAGATGCCGGAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACt < 2:1983462/100‑1 (MQ=255) acgcTCGAACAAAAAGAGATGCCGGAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACa > 1:2332324/2‑100 (MQ=255) cgcTCGAACAAAAAGAGATGCCGGAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACAt > 2:1420218/1‑100 (MQ=255) cgcTCGAACAAAAAGAGATGCCGGAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACAt > 2:85039/1‑100 (MQ=255) gcTCGAACAAAAAGAGATGCCGGAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACAtt > 2:325612/1‑100 (MQ=255) cTCGAACAAAAAGAGATGCCGGAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTg > 2:547990/1‑100 (MQ=255) cTCGAACAAAAAGAGATGCCGGAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTg > 2:2028971/1‑100 (MQ=255) cTCGAACAAAAAGAGATGCCGGAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTg < 2:274311/100‑1 (MQ=255) cTCGAACAAAAAGAGATGCCGGAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTg > 1:1197367/1‑100 (MQ=255) tCGAACAAAAAGAGATGCCGGAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTga < 2:2254156/100‑1 (MQ=255) cGAACAAAAAGAGATGCCGGAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTgag > 1:274308/1‑99 (MQ=255) cGAACAAAAAGAGATGCCGGAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTgac > 2:929725/1‑100 (MQ=255) cGAACAAAAAGAGATGCCGGAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTgac < 2:2070205/100‑1 (MQ=255) gAACAAAAAGAGATGCCGGAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTgac < 1:2029091/99‑1 (MQ=255) gccaggtctgcgtcgtttcgccctggtagaccggcagctcgtcgtcaatctagtCACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTgacgac > 1:2573028‑M1/55‑100 (MQ=255) aaGAGATGCCGGAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCt > 1:665153/1‑100 (MQ=255) agaTGCCGGAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGcc < 1:2258934/100‑1 (MQ=255) tGCCGGAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGt > 2:1326366/1‑100 (MQ=255) tGCCGGAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGt > 1:790292/1‑100 (MQ=255) cGGAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTa > 2:1446898/1‑100 (MQ=255) cGGAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGCACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTa > 2:1893442/1‑100 (MQ=255) ggAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCt < 1:2236326/98‑1 (MQ=255) ggAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTAc < 2:135067/100‑1 (MQ=255) ggAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTAc < 1:1146521/100‑1 (MQ=255) ggAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTGACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCgg < 1:2153356/95‑1 (MQ=255) gAAGAGCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTAcc < 2:2522476/100‑1 (MQ=255) gCTGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGc > 2:2369210/1‑100 (MQ=255) tGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTTGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGa > 1:1591852/1‑100 (MQ=255) tGCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGa < 2:2155339/100‑1 (MQ=255) gCCGCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGGGCTGCCGGTCTACCAGGGCGa > 2:645932/1‑99 (MQ=255) gCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAacg > 2:1567855/1‑100 (MQ=255) gCTCGATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAacg < 1:613447/100‑1 (MQ=255) cTCGATGCCAGTTGGGACCCCATTTAAACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACCTTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAacga < 2:1777860/100‑1 (MQ=255) gATGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGc < 1:1541620/100‑1 (MQ=255) gATGCAAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGc < 2:1926372/100‑1 (MQ=255) aTGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGCGCGAAACGACGCa < 2:1759833/100‑1 (MQ=255) tGCCAGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAg < 1:2398249/100‑1 (MQ=255) aGTTGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCt > 2:2077223/1‑100 (MQ=255) ttGGGACACCATTTACGCCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTg < 1:371144/100‑1 (MQ=255) tGGGACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGc > 1:351119/1‑100 (MQ=255) gtcgtcaatgtagtcaccgctggtgccggatggtgtaccagcggtgACTAGATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTGGc > 1:2573028‑M2/47‑100 (MQ=255) gACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAgg < 2:1763966/100‑1 (MQ=255) gACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAgg > 1:787232/1‑100 (MQ=255) gACACCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAgg > 2:122839/1‑100 (MQ=255) acacCATTTACACCGCTGGTACACCATCCAGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGa > 1:2467806/1‑100 (MQ=255) cacCATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGAt > 2:907714/1‑100 (MQ=255) ccATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTa < 2:1924326/100‑1 (MQ=255) cATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTAc < 1:1650274/100‑1 (MQ=255) cATTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTAc < 1:293210/100‑1 (MQ=255) aTTTACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTAcc < 2:1542042/100‑1 (MQ=255) tACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGa > 1:2000469/1‑100 (MQ=255) tACACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCAGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGa < 1:2401269/100‑1 (MQ=255) gtcaccgctggtgccggatggtgtaccagcggtgACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGa > 2:771088‑M2/35‑100 (MQ=255) tcaccgctggtgccggatggtgtaccagcggtgACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGAt < 1:771085‑M2/67‑1 (MQ=255) acacCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGan < 1:1171747/100‑2 (MQ=255) caccgctggtgccggatggtgtaccagcggtgACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGAtg > 1:1841679‑M2/33‑100 (MQ=255) caccgctggtgccggatggtgtaccagcggtgACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGAtg > 2:2120488‑M2/33‑100 (MQ=255) caccgctggtgccggatggtgtaccagcggtgACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGAtg > 1:3080‑M2/33‑100 (MQ=255) CACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGAtg < 1:1579473‑M1/100‑1 (MQ=255) ACCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGAtgt < 1:698486‑M1/100‑1 (MQ=255) ccgctggtgccggatggtgtaccagcggtgACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGAtgtg > 2:14322‑M2/31‑100 (MQ=255) ccgctggtgccggatggtgtaccagcggtgACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGAtgtg > 2:84133‑M2/31‑100 (MQ=255) ccgctggtgccggatggtgtaccagcggtgACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGAtgtg > 1:2096506‑M2/31‑100 (MQ=255) CCGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGAtgtg > 2:586139‑M1/1‑100 (MQ=255) CGCTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGATGTgg < 1:550495‑M1/100‑1 (MQ=255) gctggtgccggatggtgtaccagcggtgACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGATGTGGc > 1:187030‑M2/29‑100 (MQ=255) gctggtgccggatggtgtaccagcggtgACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGATGTGGc > 2:1081786‑M2/29‑100 (MQ=255) CTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGATGTGGCa > 1:1227251‑M1/1‑100 (MQ=255) CTGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGATGTGGCa > 1:1227376‑M1/1‑100 (MQ=255) TGGTACACCATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGATGTGGCAg > 2:1456678‑M1/1‑100 (MQ=255) 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ccATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGATGTGGCAGGTTGAGc > 1:1154963/1‑100 (MQ=255) cgatctgCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGATGTGGCAGGTTGAGCt < 1:632043/94‑1 (MQ=255) cATCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGATGTGGCAGGTTGAGCt < 2:698489/100‑1 (MQ=255) aTCCGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGATGTGGCAGGTTGAGccg < 1:1829143/100‑3 (MQ=255) ccGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGATGTGGCAGGTTGAGCTGan < 1:1363064/100‑2 (MQ=255) cGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGATGTGGCAGGTTGAGCTGaca < 2:790295/100‑1 (MQ=255) cGGCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGATGTGGCAGGTTGAGCTGaca > 1:1066864/1‑100 (MQ=255) ggccccagcggtgACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGATGTGGCAGGTTGAGCTGacac < 1:2128635‑M2/87‑1 (MQ=255) ggCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGATGTGGCAGGTTGAGCTGacac > 2:442727/1‑100 (MQ=255) ggCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGATGTGGCAGGTTGAGCTGacac > 2:1019446/1‑100 (MQ=255) ggCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGATGTGGCAGGTTGAGCTGaca > 1:79405/1‑99 (MQ=255) gCACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGATGTGGCAGGTTGAGCtagatcg > 2:632046/1‑94 (MQ=255) cACCAGCGGTGACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGATGTGGCCGGTTGAGCTGACACCg > 1:2341903/1‑100 (MQ=255) cagcggtgACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGATGTGGCAGGTTGAGCTGACACCGttt < 1:129217‑M2/92‑1 (MQ=255) agcggtgACTACATTGACGACGAGCTGCCGGTCTACCAGGGCGAAACGACGCAGACCTTGCAGGATTACCTGATGTGGCAGGTTGAGCTGACACCGtttt > 1:1400659‑M2/8‑100 (MQ=255) 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NC_000913/3344925‑3345123 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |