| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2232736 = | NA (NA) | 3 (0.040) | 3/166 | NT | NA | noncoding (1/34 nt) | REP155 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP155 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | NC_000913 | 2232766 = | NA (NA) | noncoding (31/34 nt) | REP155 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP155 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
AGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGG > NC_000913/2232638‑2232834 | ctaaggaaaatttccatcaggctactttacccgctggttttgcgcaagaaacggcaaactgtttgccgggaatttcgacaccaggagagggctggcaaGc > 1:815235‑M1/99‑100 (MQ=255)aGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGc < 2:1705361/100‑1 (MQ=255) taaggaaaatttccatcaggctactttacccgctggttttgcgcaagaaacggcaaactgtttgccgggactttcgacaccaggagagggctggcaag < 2:475373‑M1/1‑1 (MQ=255) ccGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCg < 1:832991/100‑1 (MQ=255) aaggaaaatttccatcaggctactttacccgctggttttgcgcaagaaacggcaaactgtttgccgggaatttggacaccaggagagggctggcaaGCCg > 1:1430592‑M1/97‑100 (MQ=255) aaggaaaatttccatcaggctactttacccgctggttttgcgcaagaaacggcaaactgtttgccgggaatttcgacaccaggagagggctggcaaGCCg < 2:719315‑M1/4‑1 (MQ=255) aaggaaaatttccatcaggctactttacccgctggttttgcgcaagaaacggcaaactgtttgccgggaatttcgacaccaggagagggctggcaaGCCg > 1:1044345‑M1/97‑100 (MQ=255) aaggaaaatttccatcaggctactttacccgctggttttgcgcaagaaacggcaaactgtttgccgggaatttcgacaccaggagagggctggcaaGCCg < 1:364506‑M1/4‑1 (MQ=255) cGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCgg < 2:1830230/100‑1 (MQ=255) cGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCgg < 1:1089569/100‑1 (MQ=255) ggaaaatttccatcaggctactttacccgctggttttgcgcaagaaacggcaaactgtttgccgggaatttcgacaccaggagagggctggcaaGCCgg < 1:1518729‑M1/5‑1 (MQ=255) ggaaaatttccatcaggctactttacccgctggttttgcgcaagaaacggcaaactgtttgccgggaatttcgacaccaggagagggctggcaaGCCGGa < 1:1025122‑M1/6‑1 (MQ=255) ggaaaatttccatcaggctactttacccgctggttttgcgcaagaaacggcaaactgtttgccgggaatttcgacaccaggagagggctggcaaGCCGGa > 2:1027304‑M1/95‑100 (MQ=255) ggaaaatttccatcaggctactttacccgctggttttgcgcaagaaacggcaaactgtttgccgggaatttcgacaccaggagagggctggcaaGCCGGa < 2:103759‑M1/6‑1 (MQ=255) ggaaaatttccatcaggctactttacccgctggttttgcgcaagaaacggcaaactgtttgccgggaatttcgacaccaggagagggctggcaaGCCGGa < 2:1910555‑M1/6‑1 (MQ=255) ggaaaatttccatcaggctactttacccgctggttttgcgcaagaaacggcaaactgtttgccgggaatttcgacaccaggagagggctggcaaGCCGGa < 1:2117717‑M1/6‑1 (MQ=255) gATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGa < 1:2099047/100‑1 (MQ=255) gcgcCGTTGATTCAGTGGGTTGCCACCTCCGCAACGCTGACAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATgc < 2:490335/100‑1 (MQ=255) gcgcCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATgc > 1:823429/1‑100 (MQ=255) gcCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCCGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATgc > 2:1308380/1‑98 (MQ=255) ccGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATgcggc < 1:609584/100‑1 (MQ=255) cGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGTCCGAGTACTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATgcggcg > 2:1654092/1‑100 (MQ=255) cGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATgcggcg < 1:1932700/100‑1 (MQ=255) cGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATgcggcg < 1:335079/100‑1 (MQ=255) ttGATTCAGTGGGATGCCTCCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTg < 2:1607313/100‑1 (MQ=255) aTTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAAc > 2:1219736/1‑100 (MQ=255) tCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGc < 1:620122/100‑1 (MQ=255) cAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGcc > 2:390114/1‑100 (MQ=255) cAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGcc < 1:348016/100‑1 (MQ=255) cAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGcc > 1:1735822/1‑100 (MQ=255) cAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGcc < 1:1677541/100‑1 (MQ=255) cAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGcc < 2:2059555/100‑1 (MQ=255) aTGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCg > 1:155626/1‑100 (MQ=255) tGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCgg > 1:1988360/1‑100 (MQ=255) gCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGc < 1:1706653/100‑1 (MQ=255) ccACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGCTGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGc > 1:907209/1‑99 (MQ=255) ccACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCt > 1:2064821/1‑100 (MQ=255) ccACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCt > 2:1025117/1‑100 (MQ=255) ccgctggttttgcgcaagaaacggcaaactgtttgccgggaatttcgacaccaggagagggctggcaaGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCtt > 2:428911‑M1/69‑100 (MQ=255) cACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCtt > 1:2085613/1‑100 (MQ=255) ccTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGc > 1:304020/1‑100 (MQ=255) tCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCa < 1:1290024/100‑1 (MQ=255) cGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGc > 2:315384/1‑100 (MQ=255) cGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGc < 1:480450/100‑1 (MQ=255) cAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGccc < 1:1497424/100‑1 (MQ=255) aCGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCctc < 2:2018188/100‑1 (MQ=255) aCGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCctc > 1:1813618/1‑100 (MQ=255) cTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTcc < 2:1065738/100‑1 (MQ=255) ctctCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGgtgt < 2:252346/99‑1 (MQ=255) tctcGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCg < 1:2282248/100‑1 (MQ=255) tctcGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCg < 2:1495837/100‑1 (MQ=255) ggcaaactgtttgccgggaatttcgacaccaggagagggctggcaaGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGa > 1:2056882‑M1/47‑100 (MQ=255) ctcGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGa > 1:296117/1‑100 (MQ=255) tcGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGaa < 1:955483/100‑1 (MQ=255) tcGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGaa < 1:331369/100‑1 (MQ=255) cGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGaaa < 1:297634/100‑1 (MQ=255) ggCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAAt < 1:120956/100‑1 (MQ=255) tCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCg < 2:2179522/100‑1 (MQ=255) 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2:1913144/100‑1 (MQ=255) gTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCgg > 1:719318/1‑100 (MQ=255) gTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCgg > 1:480999/1‑100 (MQ=255) tGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCggg < 2:916173/100‑1 (MQ=255) tGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCACAAAACCAGCggg < 2:1526761/100‑1 (MQ=255) | AGCCGATGCGCCGTTGATTCAGTGGGATGCCACCTCCGCAACGCTGAAAGCTCTCGGCTGTCACAGTATCGACCGAGTGCTTCTCGCTTAAGCCTGGTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTGTCCGGCTTGCCAGCCCTCTCCTGGTGTCGAAATTCCCGGCAAACAGTTTGCCGTTTCTTGCGCAAAACCAGCGGG > NC_000913/2232638‑2232834 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |