New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2617939 = | NA (NA) | 4 (0.050) | 4/164 | NT | NA | intergenic (+2/+136) | yfgD/hda | putative oxidoreductase/ATPase regulatory factor involved in DnaA inactivation |
? | NC_000913 | 2617967 = | NA (NA) | intergenic (+30/+108) | yfgD/hda | putative oxidoreductase/ATPase regulatory factor involved in DnaA inactivation |
TGGATAATCCGAAGCTGATGGAGCGCCCGATTGTGGTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATACTATGGATTAACTTCGCGTAGTTCGG > NC_000913/2617840‑2618035 | ttattgtcggatgcggcgcgaacgccttatccgaactacgcgaagttaatccatagtattcgtaggccggataagacgtggcaagcgtcgcatcaggcaa < 1:2107244‑M1/1‑1 (MQ=255) tattgtcggatgcggcgcgaacgccttatccgaactacgcgaagttaatccatagtattcgtaggccggataagacgtggcaagcgtcgcatccggcaAt < 1:232645‑M1/2‑1 (MQ=255) ggATAATCCGAAGCTGATGGAGCGCCCGATTGTGGTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGAt > 1:602616/1‑100 (MQ=255) ggATAATCCGAAGCTGATGGAGCGCCCGATTGTGGTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGAt > 2:671147/1‑100 (MQ=255) gATAATCCGAAGCTGATGGAGCGCCCGATTGTGGTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGAtg > 1:286711/1‑100 (MQ=255) ttgtcggatgcggcgcgaacgccttatccgaactacgcgaagttaatccatagtattcgtaggccggataagacgtggcaagcgtcgcatccggcaAtgt < 2:131801‑M1/4‑1 (MQ=255) gtcggatgcggcgcgaacgccttatccgaactacgcgaagttaatccatagtattcgtaggccggataagacgtggcaagcgtcgcatccggcaATGTGc > 2:1356109‑M1/95‑100 (MQ=255) gtcggatgcggcgcgaacgccttatccgaactacgcgaagttaatccatagtattcgtaggccggataagacgtggcaagcgtcgcatccggcaATGTGc < 1:1558601‑M1/6‑1 (MQ=255) gtcggatgcggcgcgaacgccttatccgaactacgcgaagttaatccatagtattcgtaggccggataagacgtggcaagcgtcgcatccggcaATGTGc < 2:1948294‑M1/6‑1 (MQ=255) tcggatgcggcgcgaacgccttatccgaactacgcgaagttaatccatagtattcgtaggccggataagacgtggcaagcgtcgcatccggcaATGTGCt > 2:920784‑M1/94‑100 (MQ=255) aTCCGAAGCTGATGGAGCGCCCGATTGTGGTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCt > 1:925608/1‑100 (MQ=255) aTCCGAAGCTGATGGAGCGCCCGATTGTGGTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCt > 2:184796/1‑100 (MQ=255) tCCGAAGCTGATGGAGCGCCCGATTGTGGTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTc > 2:148544/1‑100 (MQ=255) ccGAAGCTGATGGAGCGCCCGATTGTGGTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTcc > 2:216224/1‑100 (MQ=255) cGAAGCTGATGGAGCGCCCGATTGTGGTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCa > 1:1918809/1‑100 (MQ=255) cGAAGCTGATGGAGCGCCCGATTGTGGTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCa < 1:192617/100‑1 (MQ=255) cTGATGGAGCGCCCGATTGTGGTCGCGACTGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCGCCATCGc < 1:866709/99‑1 (MQ=255) gATGGAGCGCCCGATTGTGGTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAg > 2:71729/1‑100 (MQ=255) ggAGCGCCCGATTGTGGTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGCTGTGCTCCATCGCTAGTTg < 1:269700/100‑1 (MQ=255) gcgcCCGATTGTGGTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAg < 1:69162/100‑1 (MQ=255) gcgcCCGATTGTGGTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAg < 1:1620211/100‑1 (MQ=255) gcgcCCGATTGTGGTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAg > 1:903444/1‑100 (MQ=255) gcgcCCGATTGTGGTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAg < 1:1184551/100‑1 (MQ=255) ccttatccgaactacgcgaagttaatccatagtattcgtaggccggataagacgtggcaagcgtcgcatccggcaATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGca > 1:854011‑M1/76‑100 (MQ=255) ttatccgatatacgcgaagttaatccatagtattcgtaggccggataagacgtggcaagcgtcgcatccggcaATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGcaca > 1:341481‑M1/74‑100 (MQ=255) tatccgaactacgcgaagttaatccatagtattcgtaggccggataagacgtggcaagcgtcgcatccggcaATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACAt > 1:2349900‑M1/73‑100 (MQ=255) gATTGTGGTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACAtt > 2:1789740/1‑100 (MQ=255) tgtgGTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGcc < 1:805494/100‑1 (MQ=255) gaactacgcgaagttaatccatagtattcgtaggccggataagacgtggcaagcgtcgcatccggcaATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCg > 2:873021‑M1/68‑100 (MQ=255) ggTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGa < 1:2230942/100‑1 (MQ=255) ggTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGa > 1:686508/1‑100 (MQ=255) ggTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGa < 1:2128461/100‑1 (MQ=255) ggTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGa > 1:2194855/1‑100 (MQ=255) gTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGAt > 1:1407357/1‑100 (MQ=255) cgcgAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGc > 1:295678/1‑100 (MQ=255) gcgAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCg < 2:179359/100‑1 (MQ=255) cgAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGa > 2:1366783/1‑100 (MQ=255) tGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCt > 1:531043/1‑100 (MQ=255) gCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTg > 1:1193121/1‑100 (MQ=255) gCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTg < 2:2128043/100‑1 (MQ=255) cAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGc > 2:390273/1‑100 (MQ=255) cAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGc > 1:732014/1‑100 (MQ=255) aaGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCa > 1:438741/1‑100 (MQ=255) aGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAACCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCa < 2:2248477/99‑1 (MQ=255) gcgGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTc > 1:1120836/1‑100 (MQ=255) gcgGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTc < 2:2124537/100‑1 (MQ=255) gcgGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTc < 1:396207/100‑1 (MQ=255) gcgGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTc < 1:1166730/100‑1 (MQ=255) gcgGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTc < 1:224537/100‑1 (MQ=255) cgGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCt > 2:984063/1‑100 (MQ=255) cgGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCt < 1:1384114/100‑1 (MQ=255) cgGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCt > 2:1834121/1‑100 (MQ=255) aTTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTAt < 2:1850402/100‑1 (MQ=255) ttGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATc > 1:1421238/1‑100 (MQ=255) ggTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCg > 1:2261473/1‑100 (MQ=255) ggTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCg > 2:1739262/1‑100 (MQ=255) tcgtcCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGc < 1:1539856/100‑1 (MQ=255) cgtcCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGcc > 1:2304469/1‑100 (MQ=255) tctcACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCt < 2:872123/97‑1 (MQ=255) tcCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGATGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTa > 2:1279453/1‑100 (MQ=255) cACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTaga > 1:872127/1‑98 (MQ=255) cACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACg > 2:1303486/1‑100 (MQ=255) aCCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGa < 1:616047/100‑1 (MQ=255) ccGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGCAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGaa < 2:1964977/100‑1 (MQ=255) cGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAAt < 2:2159102/100‑1 (MQ=255) cGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAAt < 1:1055549/100‑1 (MQ=255) ggAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATa > 2:244311/1‑100 (MQ=255) aGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATACTATg < 1:184797/100‑1 (MQ=255) aGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATACTATg > 1:1418350/1‑100 (MQ=255) ggTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATACTATgg > 1:1541085/1‑100 (MQ=255) ggTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATACTATgg < 1:216225/100‑1 (MQ=255) ggTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATACTATgg < 2:1992082/100‑1 (MQ=255) ggTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATACTATgg < 2:1421230/100‑1 (MQ=255) atctcTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATACTATgg < 1:1579357/96‑1 (MQ=255) gTACTGGAAAACGTAGGTTAAGAGGCGCTCCATCGAGAGTTGAAACACACTGCCGGATGCGACGCACACCACGACTGACCCGGCCTACGAATACTATGGa < 2:1253544/100‑1 (MQ=255) tACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATACTATGGAt < 1:2279774/100‑1 (MQ=255) tACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATACTATGGAt > 1:1337757/1‑100 (MQ=255) tACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACACTTGCCACGTCTTCTCCGACCTACGAATACTATGAAt < 2:1373786/100‑1 (MQ=39) cTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATACTATGGagat > 2:1579347/1‑97 (MQ=255) ggAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATACTATGGATTAAc > 1:1263851/1‑100 (MQ=255) tCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATACTATGGATTAACTTcgc > 2:1645413/1‑100 (MQ=255) cGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATACTATGGATTAACTTcgcg < 2:438738/100‑1 (MQ=255) gTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATACTATGGATTAACTTCGCGt < 2:1023483/100‑1 (MQ=255) gTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATACTATGGATTAACTTCGCGt < 1:1469278/100‑1 (MQ=255) tGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGATGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATACTATGGATTAACTTCGCGTa < 1:1279459/100‑1 (MQ=255) gggTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGGGTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATACTATGGATTAACTTCGCGTa < 2:853921/99‑1 (MQ=255) gTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATACTATGGATTAACTTCGCGTAGTT > 2:116218‑M1/1‑100 (MQ=255) ttAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATACTATGGATTAACTTCGCGTAGTTC < 2:686505‑M1/100‑1 (MQ=255) tAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATACTATGGATTAACTTCGCGTAGTTCG > 2:240255‑M1/1‑100 (MQ=255) aaGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATCCTCTGGATTAACTTCGCGTAGTTCGG < 2:471702‑M1/100‑1 (MQ=255) | TGGATAATCCGAAGCTGATGGAGCGCCCGATTGTGGTCGCGAATGGCAAAGCGCGGATTGGTCGTCCACCGGAGCAGGTACTGGAAATCGTGGGTTAAGATGTGCTCCATCGCTAGTTGAAGCACATTGCCGGATGCGACGCTTGCCACGTCTTATCCGGCCTACGAATACTATGGATTAACTTCGCGTAGTTCGG > NC_000913/2617840‑2618035 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |