| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4635837 = | 115 (1.110) | 9 (0.090) | 8/170 | NT | 8.1% | coding (317/474 nt) | creA | putative periplasmic protein |
| ? | NC_000913 | 4635885 = | 94 (0.950) | coding (365/474 nt) | creA | putative periplasmic protein | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
AACTGTCGGATCGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTG > NC_000913/4635786‑4635984 | aaCTGTCGGATCGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTa < 2:1310206/100‑1 (MQ=255)aaCTGTCGGATCGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTa > 2:735178/1‑100 (MQ=255) aactttgtcggattaagccagataagcgagcgtgttgcgtttggcatcatAAAACCGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTa > 1:2421363‑M1/51‑99 (MQ=255) aCTGTCGGATCGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTat < 2:2238044/100‑1 (MQ=255) cTGTCGGATCGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTGTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTat > 1:1379796/1‑99 (MQ=255) cTGTCGGATCGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGACTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTat > 1:1837750/1‑99 (MQ=255) tGTCGGATCGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTat < 2:1991402/98‑1 (MQ=255) tttgtcggagtaagccagataagcgagcgcgttgcgtttggcatcatAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTatgat > 1:760503‑M1/48‑100 (MQ=255) tttgtcggagtaagccagataagcgagcgcgttgcgtttggcatcatAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTatgat > 1:705366‑M1/48‑100 (MQ=255) ttgtcggagtaagccagataagcgagcgcgttgcgtttggcatcatAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTatgatg > 1:749348‑M1/47‑100 (MQ=255) tCGGATCGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTatgatg < 1:368375/100‑1 (MQ=255) tgtcggagtaagccagataagcgagcgcgttgcgtttggcatcatAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGc > 1:735459‑M1/46‑100 (MQ=255) cGGATCGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGc > 1:1185494/1‑100 (MQ=255) cGGATCGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGc < 1:885122/100‑1 (MQ=255) gtcggagtaagccagataatcgagcgcgttgcgtttggcatcatAAATACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGcc > 1:937512‑M1/45‑100 (MQ=255) ggATCGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGcn < 2:1230326/100‑2 (MQ=255) ggATCGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGcc > 2:215908/1‑100 (MQ=255) tcggagtaagccagataagcgagcgcgttgcgtttggcatcatAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCa > 2:365003‑M1/44‑100 (MQ=255) gATCGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCa > 2:2211588/1‑100 (MQ=255) cGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAaac > 2:119421/1‑100 (MQ=255) gTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAaacg > 2:2003969/1‑100 (MQ=255) gTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAaac > 2:2563388/1‑99 (MQ=255) tATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAaacgc < 2:1921162/100‑1 (MQ=255) tATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAaacgc > 2:2600351/1‑100 (MQ=255) tATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAAGTAGTATTCAAAAAACGAACGTCCCTGGCCAGTAAGTCGTTACAGGACGTGCGCTCTGATGATGCCAaacgc > 1:1436517/1‑100 (MQ=255) aTTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAaacgca > 1:2745961/1‑100 (MQ=255) ttAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAaacgcaa > 1:2324775/1‑100 (MQ=255) aaaaaCGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAaacgcaac > 2:2056036/1‑99 (MQ=255) aaCGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACgcgc > 1:2607979/1‑100 (MQ=255) cGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGcgctc > 2:2837447/1‑100 (MQ=255) cGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGcgctc > 2:831176/1‑100 (MQ=255) tgCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGcgctcg < 1:936877/99‑1 (MQ=255) gCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGcgctcga > 2:936879/1‑99 (MQ=255) cAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGcgctcgct > 2:307159/1‑100 (MQ=255) aaGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTa > 1:1155849/1‑100 (MQ=255) aaGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTa < 2:2404411/100‑1 (MQ=255) cTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCt < 2:665060/100‑1 (MQ=255) cTCAGAGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCCTGCGCTTTTATGATGCCAACCGCAACGCGCTCGCTTGTCt > 1:628465/1‑100 (MQ=255) tCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTg > 1:541289/1‑100 (MQ=255) gggCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGc < 1:2400769/99‑1 (MQ=255) gggCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCt < 2:2736804/100‑1 (MQ=255) gggCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCt > 2:649093/1‑100 (MQ=255) gggCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCt > 1:341358/1‑100 (MQ=255) ggCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCtt < 2:1934301/100‑1 (MQ=255) ggTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTcc > 1:2406182/1‑100 (MQ=255) ggTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTcc < 2:2387854/100‑1 (MQ=255) gtagtaTTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCg > 2:1567155/1‑100 (MQ=255) tggcatcataaaagcgcacgacctgtaacgacttaaagaccagggacgtgcgtttttATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGa > 2:365003‑M2/58‑100 (MQ=255) ggcatcataaaagcgcacgacctgtaacgacttaaagaccagggacgtgcgtatttATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGATTATCTGGCTTACTCCGAc > 1:937512‑M2/57‑100 (MQ=255) gcatcataaaagcgcacgacctgtaacgacttaaagaccagggacgtgcgtttttATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACa > 1:735459‑M2/56‑100 (MQ=255) taTTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACaa < 2:2623110/100‑1 (MQ=255) atcataaaagcgcacgacctgtaacgacttaaagaccagggacgtgcgtttttATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACaaa > 1:760503‑M2/54‑100 (MQ=255) atcataaaagcgcacgacctgtaacgacttaaagaccagggacgtgcgtttttATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACaaa > 1:705366‑M2/54‑100 (MQ=255) aTTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACaaa > 2:2663194/1‑100 (MQ=255) aTTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACaaa > 1:2800526/1‑100 (MQ=255) ttCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAg > 1:1887466/1‑100 (MQ=255) tCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGt > 2:624834/1‑100 (MQ=255) cAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGtt > 2:1288824/1‑100 (MQ=255) cAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGATCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGtt > 1:2535137/1‑100 (MQ=255) taaaagcgcacgacctgtaacgacttaaagaccagggacgtgcggttttATGATGCCAAACGCAACACGCTCGCTTATCTGGCTTAATCCGACAAAGtt > 1:2421363‑M2/50‑99 (MQ=255) aaaaaaCGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTg > 2:297860/1‑100 (MQ=255) aaaaaaCGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTg < 2:1823234/100‑1 (MQ=255) AAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGt < 2:1328437‑M1/100‑1 (MQ=255) AAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTa < 1:1117474‑M1/100‑1 (MQ=255) AAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTa < 2:2230993‑M1/100‑1 (MQ=255) AAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTa > 2:2607727‑M1/1‑100 (MQ=255) AAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAg > 2:2310713‑M1/1‑100 (MQ=255) AAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAg > 2:2310714‑M1/1‑100 (MQ=255) AACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGa > 2:1531709‑M1/1‑100 (MQ=255) cacgacctgtaacgacttaaagaccagggacgtgcgcttttATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGt > 2:1106582‑M2/42‑100 (MQ=255) cGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTc > 2:2811628/1‑100 (MQ=255) gTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCg < 2:1793713/100‑1 (MQ=255) cccTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGcc > 1:2663830/1‑100 (MQ=255) ctgtaacgacttaaagaccagggacgtgcgtttttATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCg < 2:705368‑M2/65‑1 (MQ=255) cTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGa > 1:250201/1‑100 (MQ=255) cTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGa > 1:2862001/1‑100 (MQ=255) cTGGTCTTTAAGTCGTTACAGATCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTGATCTGGCTTACTCCGACAAAATTGTAGAAGGTTCGCCg > 1:908770/1‑99 (MQ=255) ttAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAAcgc > 1:2146069/1‑100 (MQ=255) tAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAAcgcg < 1:1718627/100‑1 (MQ=255) aaGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGa < 1:462837/100‑1 (MQ=255) tCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTa < 2:541290/100‑1 (MQ=255) cGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAg < 1:1056209/100‑1 (MQ=255) nttACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTGGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTCgc > 1:1353397/2‑100 (MQ=255) gTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAgc < 2:2457526/100‑1 (MQ=255) tACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAgcgc < 2:2800536/100‑1 (MQ=255) tACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAgcgc < 2:2710267/100‑1 (MQ=255) tACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAgcg > 1:1673157/1‑99 (MQ=255) aCAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGcgcg < 1:1933226/100‑1 (MQ=255) ggTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGtt > 1:349029/1‑100 (MQ=255) ggTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGtt < 2:9195/100‑1 (MQ=255) tCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTcc < 2:1155851/100‑1 (MQ=255) cGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCt > 1:1139579/1‑100 (MQ=255) cGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCCAAAAACGCGATTAGCGCGGTTcc > 2:2480679/1‑99 (MQ=255) gTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTg < 2:2168000/100‑1 (MQ=255) gTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTg < 2:2677708/100‑1 (MQ=255) gcgcTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTc > 2:846877/1‑100 (MQ=255) gcTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCAt > 2:1516443/1‑100 (MQ=255) cTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATg > 1:343993/1‑100 (MQ=255) tttATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGcc > 1:2676985‑M2/4‑100 (MQ=255) tgtATGATGCCATACGCAACGCGCTCGCTTATATGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGATTCGACAAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGc < 1:1999665‑M2/96‑1 (MQ=255) | AACTGTCGGATCGTATTAAAAACGGCAAAGCTCAGGGCGAGGTAGTATTCAAAAAACGCACGTCCCTGGTCTTTAAGTCGTTACAGGTCGTGCGCTTTTATGATGCCAAACGCAACGCGCTCGCTTATCTGGCTTACTCCGACAAAGTTGTAGAAGGTTCGCCGAAAAACGCGATTAGCGCGGTTCCTGTCATGCCGTG > NC_000913/4635786‑4635984 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |