| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4326184 | 70 (0.720) | 12 (0.230) +AGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAG |
5/98 | NT | 23.9% | noncoding (383/583 nt) | REP325 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP325 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 4374596 | NA (NA) | noncoding (99/99 nt) | RIP329 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences and 1 IHF site | RIP329 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences and 1 IHF site | |||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
TGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGCCAGT > NC_000913/4374497‑4374695 | tGCCGGATGCAGCCTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGc < 1:1539740/100‑1 (MQ=255) gCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCa < 1:1968001/100‑1 (MQ=255) gCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCa > 2:2138042/1‑100 (MQ=255) gCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCa > 1:2337053/1‑100 (MQ=255) ccGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCaa > 1:1375891/1‑100 (MQ=255) cGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTATAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAAt < 2:1405225/100‑1 (MQ=255) ggATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAAtt > 2:753097/1‑100 (MQ=255) cAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAAt > 1:1550152/1‑100 (MQ=255) aGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATg < 1:148103/100‑1 (MQ=255) aGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATg > 1:2019474/1‑100 (MQ=255) aGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAACGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATg < 2:1473252/100‑1 (MQ=255) cGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGtt > 1:1276929/1‑100 (MQ=255) cGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCATAGCGAATCAGGCAATTTTAATGtt > 1:239640/1‑100 (MQ=255) gTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGttt > 2:186657/1‑100 (MQ=255) gTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGttt < 2:167133/100‑1 (MQ=255) tAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTa < 2:41036/100‑1 (MQ=255) tAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTa < 2:1646522/100‑1 (MQ=255) tAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTa < 1:977071/100‑1 (MQ=255) tAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTa > 2:1726597/1‑100 (MQ=255) aaaCGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTaa > 2:1484317/1‑100 (MQ=255) aaCGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGATTCAGGCAATTTTAATGTTTAAc < 2:1536410/100‑1 (MQ=255) aCGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAAc > 2:29292/1‑99 (MQ=255) gCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTc < 1:169772/100‑1 (MQ=255) gCCTTATCCGGCCTACAATTCATTGCAAATCCAATCCATTTCAATGCAACATGTAAGCCTGAGAAGCGTAACGAAACAGGGAATTTTAAAGTTTAACTTc > 2:2587778/1‑100 (MQ=21) cTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTccc < 2:709001/100‑1 (MQ=255) cTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTccc < 2:1738178/100‑1 (MQ=255) ttATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCt > 1:948554/1‑100 (MQ=255) tATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGTCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTg < 2:1467234/100‑1 (MQ=255) tATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTg < 1:2574146/100‑1 (MQ=255) aTCCGGCCTACAGTTTATTGCAAATCCATTCAATTTCAATACATGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCTAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGt < 2:2541506/100‑1 (MQ=38) tCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGtt < 1:1956797/100‑1 (MQ=255) ccGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGttt > 2:2544318/1‑100 (MQ=255) cGGCTTATAGTTCATTGCAAATCCATTCTATTTCAATTCACGATGTAGGTCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGttt < 1:1229622/99‑1 (MQ=255) cGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTTCCTGTTTa < 2:1723727/100‑1 (MQ=255) ccTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATc < 1:734155/100‑1 (MQ=255) ccTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATc < 2:777861/100‑1 (MQ=255) cTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCa > 2:163054/1‑100 (MQ=255) tACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAg > 1:634239/1‑100 (MQ=255) aCAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGt < 1:1003905/100‑1 (MQ=255) cAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGtt > 2:1932845/1‑100 (MQ=255) cAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGtt < 2:2060398/100‑1 (MQ=255) gTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTAc < 1:184482/100‑1 (MQ=255) tCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTActg > 2:323150/1‑100 (MQ=255) tCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTActg < 1:106366/100‑1 (MQ=255) cATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTActgc < 2:54513/100‑1 (MQ=255) ttGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTActgctg < 1:380753/100‑1 (MQ=255) tGCAAATCCATTCAATTTCAATGTACGATGTAGGTCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTgg < 1:1997416/100‑1 (MQ=255) tGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTgg > 2:1028651/1‑100 (MQ=255) tGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTgg < 1:2402435/100‑1 (MQ=255) tGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTgg < 1:1997837/100‑1 (MQ=255) gCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGc > 1:445472/1‑100 (MQ=255) gCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGc < 1:1589152/100‑1 (MQ=255) gCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAAATTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTActgc > 2:948851/1‑96 (MQ=255) aaTCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTa > 1:923287/1‑100 (MQ=255) tCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGc < 1:1932863/100‑1 (MQ=255) ttcaatttcaatGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGga < 1:1758611/100‑1 (MQ=255) ttcaatttcaatGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGga > 2:1362268/1‑100 (MQ=255) ttcaatttcaatGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGga < 1:1248271/100‑1 (MQ=255) ttcaatttcaatGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGga < 1:672515/100‑1 (MQ=255) tcaatttcaatGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGgag < 2:240372/100‑1 (MQ=255) caatttcaatGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGgaga > 2:2145620/1‑100 (MQ=255) caatttcaatGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGgaga < 1:451511/100‑1 (MQ=255) caatttcaatGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGgaga < 2:2588249/100‑1 (MQ=255) aatttcaatGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTTCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGAt < 1:1870047/100‑1 (MQ=255) aatttcaatGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGAt < 2:2533003/100‑1 (MQ=255) tcaatGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGTAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAg < 1:2156656/100‑1 (MQ=255) caatGCACGATGTAGGCCTGATAAGTGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAgc < 1:1421418/100‑1 (MQ=255) caatGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAgc < 1:1376825/100‑1 (MQ=255) atGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAgcgg < 2:2014611/100‑1 (MQ=255) gCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAgcggcg > 1:112442/1‑100 (MQ=255) cACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAgcggc > 2:563519/1‑98 (MQ=255) gATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGtttt < 1:2138068/100‑1 (MQ=255) gATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGttt < 1:1427224/99‑1 (MQ=255) gTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCctacatcgtgcattgaaattgaatggatttgcaatgaactgtaggccggataaggcgtttacgctgcatcc < 1:2593337‑M2/100‑72 (MQ=255) gTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCctacatcgtgcattgaaattgaatggatttgcaatgaactgtaggccggataaggcgtttacgctgcatcc < 1:1491964‑M2/100‑72 (MQ=255) tAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTg > 2:2280059/1‑100 (MQ=255) aGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCctacatcgtgcattgaaattgaatggatttgcaatgaactgtaggccggataaggcgtttacgctgcatccgg < 1:2427556‑M2/100‑74 (MQ=255) aGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTgg > 2:1042078/1‑100 (MQ=255) aGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTgg < 1:2618172/100‑1 (MQ=255) ggCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCctacatcgtgcattgaaattgaatggatttgcaatgaactgtaggccggataaggcgtttgcgctgcatccggc < 1:2570127‑M2/100‑75 (MQ=255) ggCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTggg > 2:576092/1‑100 (MQ=255) ggCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTggg < 2:2650044/100‑1 (MQ=255) gCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCctacatcgtgcattgaaattgaatggatttgcaatgaactgtaggccggataaggcgtttacgctgcatccggca < 1:764020‑M2/100‑76 (MQ=255) gCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCctacatcgtgcattgaaattgaatggatttgcaatgaactgtaggccggataaggcgtttacgctgcatccggca < 1:1667310‑M2/100‑76 (MQ=255) gCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGt > 2:1318691/1‑100 (MQ=255) ccTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCctacatcgtgcattgaaattgaatggatttgcaatgaactgtaggccggataaggcgtttacgctgcatccggcaa < 1:2218599‑M2/100‑77 (MQ=255) ccTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCcaacatcgtgcattgaaattgaatggatttgcaacgaactgtaggccggctacggcgtttacgctgcatcccg < 1:1124135‑M2/97‑74 (MQ=255) aTAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTcgcc < 1:656729/100‑1 (MQ=255) aaGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCGCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTcgccgc > 2:1420817/1‑100 (MQ=255) aaGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTcgccgc < 2:2019455/100‑1 (MQ=255) gTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCACTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAAt > 2:1751395/1‑100 (MQ=255) gCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTtc < 1:290767/100‑1 (MQ=255) gCGAATCAGGCAATTTTAAAGTTTAAATTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGAGTAGCTGCAGAACCATCGGCGTTTTGCTGGGTTCGACGCCAAttt > 2:1178927/1‑99 (MQ=255) aaTCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTcg < 1:323152/100‑1 (MQ=255) aTCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTcgc > 2:375129/1‑100 (MQ=255) aGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGcc < 2:116010/100‑1 (MQ=255) aGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGcc < 2:1503170/100‑1 (MQ=255) aGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGcc < 2:116193/100‑1 (MQ=255) ggCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGCCa > 2:1888743/1‑100 (MQ=255) cAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGACGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGCCAGt > 1:1006263/1‑100 (MQ=255) | TGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATGTTTAACTTCCCTGTTTAATCAGTTACTGCTGGCGTAGCTGGAGATCCAGCGGCGTTTTGCTGGGTTCGCCGCCAATTTCTCGCGCCAGT > NC_000913/4374497‑4374695 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |