| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4433109 = | 146 (1.140) | 9 (0.080) | 8/166 | NT | 6.5% | intergenic (‑53/+55) | ytfF/qorB | DMT transporter family inner membrane protein/NAD(P)H:quinone oxidoreductase |
| ? | NC_000913 | 4433147 = | 122 (1.020) | intergenic (‑91/+17) | ytfF/qorB | DMT transporter family inner membrane protein/NAD(P)H:quinone oxidoreductase | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
CGACAACGTTAGCCGAAAGCGTAAGCCATCTTTTTAATGTTAATAACTAGTTAATTAAAGTGGCATCCTCCCGCATCCTCTCTGATAATGACGGGATGCCGGGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4433213‑4433109‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgggagGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTG > NC_000913/4433147‑4433245 CGACAACGTTAGCCGAAAGCGTAAGCCATCTTTTTAATGTTAATAACTAGTTAATTAAAGAGGCATCCTCCCGCATCCTCTCTGATAATGACGGGATGCC < 1:1238280/100‑1 CAACGTTAGCCGAAAGCGTAAGCCATCTTTTTAATGTTAATAACTAGTTAATTAAAGTGGCATCCTCCCGCATCCTCTCTGATAATTACGGGATGCCGGG < 2:2348978/100‑1 CAACGTTAGCCGAAAGCGTAAGCCATCTTTTTAATGTTAATAACTAGTTAATTAAAGTGGCATCCTCCCGCATCCTCTCTGATAATGACGGGATGCCGGG < 2:1468700/100‑1 CAACGTTAGCCGAAAGCGTAAGCCATCTTTTTAATGTTAATAACTAGTTAATTAAAGTGGCATCCTCCCGCATCCTCTCTGATAATGACGGGATGCCGGG > 2:2981483/1‑100 CAACGTTAGCCGAAAGCGTAAGCCATCTTTTTAATGTTAATAACTAGTTAATTAAAGTGGCATCCTCCCGCATCCTCTCTGATAATGACGGGATGCCGGG < 1:891685/100‑1 ACGTTAGCCGAAAGCGTAAGCCATCTTTTTAATGTTAATAACTAGTTAATTAAAGTGGCATCCTCCCGCATCCTCTCTGATAATGACGGGATGCCGGGAG > 2:2449387/1‑100 ACGTTAGCCGAAAGCGTAAGCCATCTTTTTAATGTTAATAACTAGTTAATTAAAGTGGCATCCTCCCGCATCCTCTCTGATAATGACGGGATGCCGGGAG < 1:2796756/100‑1 ACGTTAGCCGAAAGCGTAAGCCATCTTTTTAATGTTAATAACTAGTTAATTAAAGTGGCATCCTCCCGCATCCTCTCTGATAATGACGGGATGCCGGGAG < 1:875706/100‑1 ACGTTAGCCGAAAGCGTAAGCCATCTTTTTAATGTTAATAACTAGTTAATTAAAGTGGCATCCTCCCGCATCCTCTCTGATAATCCCGGGATGCCGGGAG > 2:2017203/1‑100 ctCATCCTCCCGCATCCTCTCTGATAATGACGGGATGCCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGC < 2:2952351/98‑1 CATCCTCCCGCATCCTCTCTGATAATGACGGGATGCCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCag > 1:2952328/1‑98 ATCCTCCCGCATCCTCTCTGATAATGACGGGATGCCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAA > 2:2474188/1‑100 ATCCTCCCGCATCCTCTCTGATAATGACGGGATGCCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAA > 2:343165/1‑100 TCCTCCCGCATCCTCTCTGATAATGACGGGATGCCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAAC > 2:1537052/1‑100 CCTCCCGCATCCTCTCTGATAATGGCGGGATGCCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTGCGGCTAACG > 1:2240099/1‑100 CCCGCATCCTCTCTGATAATGACGGGATG‑CGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGT > 2:1443486/1‑100 CATCCTCTCTGATAATGACGGGATGCCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGT > 1:165282/1‑100 GGGATGCCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTG < 1:343162/100‑1 CGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTG > 1:2296554/1‑100 CGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTG < 2:2555539/100‑1 CGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTG > 2:467272/1‑100 GGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTT < 2:1019836/100‑1 GGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTT > 2:1838913/1‑100 GAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTT < 1:3458986/100‑1 AGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTT < 1:1380564/100‑1 GGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTG < 1:281644/100‑1 GGATGCCACTTTAATTAACTAGTTACTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTG > 1:957032/1‑100 CGACAACGTTAGCCGAAAGCGTAAGCCATCTTTTTAATGTTAATAACTAGTTAATTAAAGTGGCATCCTCCCGCATCCTCTCTGATAATGACGGGATGCCGGGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4433213‑4433109‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgggagGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTG > NC_000913/4433147‑4433245 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |