New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4433109 = | 146 (1.140) | 9 (0.080) | 8/166 | NT | 6.5% | intergenic (‑53/+55) | ytfF/qorB | DMT transporter family inner membrane protein/NAD(P)H:quinone oxidoreductase |
? | NC_000913 | 4433147 = | 122 (1.020) | intergenic (‑91/+17) | ytfF/qorB | DMT transporter family inner membrane protein/NAD(P)H:quinone oxidoreductase | |||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
CTAATCATTACTGGCATCCATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGC > NC_000913/4433049‑4433246 | gttagccgaaagcgtaagccatctttttaatgttaataactagttaattaaagtggcatcCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGggagga > 2:1537052‑M1/61‑100 (MQ=255) ttagccgaaagcgtaagccatctttttaatgttaataactagttaattaaagtggcatcCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGAt > 2:343165‑M1/60‑100 (MQ=255) ttagccgaaagcgtaagccatctttttaatgttaataactagttaattaaagtggcatcCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGAt > 2:2474188‑M1/60‑100 (MQ=255) aaTCATTACTGGCATCCATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGggagggcc > 1:1191216/1‑97 (MQ=255) aTCATTACTGGCATCCATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGc > 1:1763116/1‑100 (MQ=255) tCATTACTGGCATCCATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGcc > 2:137683/1‑100 (MQ=255) tCATTACTGGCATCCACTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGcc < 1:2024086/100‑1 (MQ=255) aTTACTGGCATCCATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCAc < 2:14140/100‑1 (MQ=255) aTTACTGGCATCCATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCAc < 2:3063587/100‑1 (MQ=255) aCTGGCATCCATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACttt < 1:319081/100‑1 (MQ=255) cTGGCATCCATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTtta < 2:3301930/100‑1 (MQ=255) tCCATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAAc < 1:1057510/100‑1 (MQ=255) cATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTa > 2:349409/1‑100 (MQ=255) cATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTa > 1:2168507/1‑100 (MQ=255) cATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTa > 1:3409552/1‑100 (MQ=255) cATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGCCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTa > 2:404587/1‑100 (MQ=255) cATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGAAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACt < 1:2599463/99‑1 (MQ=255) aTTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAg > 2:462609/1‑100 (MQ=255) ttGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGTAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGt < 2:636634/100‑1 (MQ=255) ttGATCGGTCTGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGt < 2:1308029/100‑1 (MQ=255) tGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGtt < 2:1165603/100‑1 (MQ=255) gATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGtta > 2:1860196/1‑100 (MQ=255) gATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGtta > 1:2836253/1‑100 (MQ=255) gATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACAAGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGtta > 2:3276542/1‑100 (MQ=255) aTCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGttat < 2:1544402/100‑1 (MQ=255) aTCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGttat < 2:3171947/100‑1 (MQ=255) aTCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGttat < 1:135912/100‑1 (MQ=255) tGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTaa > 1:2652509/1‑100 (MQ=255) tGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTaa > 2:892638/1‑100 (MQ=255) tGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTaa > 2:2763977/1‑100 (MQ=255) tGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTaa < 2:3024136/100‑1 (MQ=255) gTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAAc > 2:1879214/1‑100 (MQ=255) cAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACAt < 1:2224662/100‑1 (MQ=255) cAGAAGAAAATTCAGGAAGCAGACATGATTGCGCCCGGCATACAGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACAt < 1:3172150/100‑1 (MQ=255) gaagaaAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTa > 1:2462896/1‑100 (MQ=255) gaagaaAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTa > 2:2926940/1‑100 (MQ=255) aagaaAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGTATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTaa > 2:430767/1‑100 (MQ=255) gaaAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTaaaa < 2:2061827/100‑1 (MQ=255) gaaAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTaaaa < 2:2400475/100‑1 (MQ=255) aaGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAg > 1:934889/1‑100 (MQ=255) ttCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATg < 1:2765481/100‑1 (MQ=255) tCAGGAAGCAGAGATGGTTGGTGCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATg < 1:818460/99‑1 (MQ=255) cAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGc > 1:1019827/1‑100 (MQ=255) ggAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCtt > 1:2463253/1‑100 (MQ=255) gAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTa < 1:2488101/100‑1 (MQ=255) aaGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTAc > 1:600073/1‑100 (MQ=255) aGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACg > 2:1811461/1‑100 (MQ=255) cAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCt > 1:1167008/1‑100 (MQ=255) aCATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTc < 1:56430/100‑1 (MQ=255) cATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCg < 2:822901/100‑1 (MQ=255) aTGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCgg < 2:1478824/100‑1 (MQ=255) tGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGATAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGc < 1:2328553/100‑1 (MQ=255) tGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGc > 1:286574/1‑100 (MQ=255) ctcatcctcccgcatcctctctgataatgacgggatgccgggagGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGc < 2:2952351‑M2/56‑1 (MQ=255) catcctcccgcatcctctctgataatgacgggatgccgggagGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCggcag > 1:2952328‑M2/43‑98 (MQ=255) tcctcccgcatcctctctgataatgacgggatgccgggagGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAAc > 2:1537052‑M2/41‑100 (MQ=255) gCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACg > 2:958450/1‑100 (MQ=255) cctcccgcatcctctctgataatggcgggatgccgggagGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTGCGGCTAACg > 1:2240099‑M2/40‑100 (MQ=255) CTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGt < 1:2796756‑M1/100‑1 (MQ=255) CTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGt < 1:875706‑M1/100‑1 (MQ=255) CTCCCGGCATCCCGGGATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGt > 2:2017203‑M1/1‑100 (MQ=255) CCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTg > 2:2981483‑M1/1‑100 (MQ=255) CCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTg < 1:891685‑M1/100‑1 (MQ=255) CCCGGCATCCCGTAATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTg < 2:2348978‑M1/100‑1 (MQ=255) cccgcatcctctctgataatgacgggatgcgggagGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGt > 2:1443486‑M2/36‑100 (MQ=255) gCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGt < 2:566879/100‑1 (MQ=255) gCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGt < 2:2000653/100‑1 (MQ=255) gCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGt > 2:2243885/1‑100 (MQ=255) catcctctctgataatgacgggatgccgggagGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGt > 1:165282‑M2/33‑100 (MQ=255) cATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGtt > 2:3079507/1‑100 (MQ=255) aTCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTg < 1:1700217/100‑1 (MQ=255) aTCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTg < 1:2566500/100‑1 (MQ=255) tCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTgg > 2:2721621/1‑100 (MQ=255) ccGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTggg < 1:1717330/99‑1 (MQ=255) cGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTg > 2:2593821/1‑100 (MQ=255) cGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTg < 2:662895/100‑1 (MQ=255) cGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTg > 1:1572661/1‑100 (MQ=255) cGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTAAAAAAAAAAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTg < 1:914948/100‑1 (MQ=255) cATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGcc < 1:3226266/100‑1 (MQ=255) cATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGcc > 1:1302270/1‑100 (MQ=255) tATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCcaat < 2:1307561/100‑1 (MQ=255) tATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCcaat < 1:2721600/100‑1 (MQ=255) tATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACGAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCcaat < 2:2750751/100‑1 (MQ=255) aTCAGAGAGGCTGCGGGAGGATGCCACTTTAATTCACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCca > 1:24108/1‑97 (MQ=255) aTCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCcaatc < 1:1277985/100‑1 (MQ=255) cAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCcaatcaa > 1:2042860/1‑100 (MQ=255) agagagGGTGCTGGAGGATGTCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCaaatcact > 1:1497382/1‑98 (MQ=255) gagagGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAAtt < 1:454978/100‑1 (MQ=255) agagGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAAttt > 1:2183234/1‑100 (MQ=255) gggatgccgggagGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTg < 1:343162‑M2/87‑1 (MQ=255) gATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCt < 2:751170/99‑1 (MQ=255) cgggagGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAgtg > 2:467272‑M2/7‑100 (MQ=255) cgggagGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAgtg > 1:2296554‑M2/7‑100 (MQ=255) cgggagGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAgtg < 2:2555539‑M2/94‑1 (MQ=255) ggagGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGtt < 2:1019836‑M2/96‑1 (MQ=255) agGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGtttt < 1:1380564‑M2/98‑1 (MQ=255) gGATGCCACTTTAATTAACTAGTTACTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTg > 1:957032‑M2/2‑100 (MQ=255) gaTGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGTCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGc < 2:1763132/100‑1 (MQ=255) gaTGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGc < 2:1757784/100‑1 (MQ=255) gaTGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGc < 2:1167019/100‑1 (MQ=255) | CTAATCATTACTGGCATCCATTGATCTGTCAGAAGAAAGTTCAGGAAGCAGACATGATTGCTCCCGGCATCCCGTCATTATCAGAGAGGATGCGGGAGGATGCCACTTTAATTAACTAGTTATTAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGC > NC_000913/4433049‑4433246 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |