| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4325861 = | 106 (0.970) | 184 (2.230) | 91/150 | 0.0 | 67.9% | noncoding (60/583 nt) | REP325 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP325 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 4374507 | 94 (1.140) | noncoding (10/99 nt) | RIP329 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences and 1 IHF site | RIP329 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences and 1 IHF site | |||||
Only 100 of 388 total aligned reads displayed.
GAAGCCAGTTAAGTGTAGTTCGAAATTTATACAGATGAGAGGCGGCCTGATAAGACGCGCGAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACCATTGCCGGATGCG > NC_000913/4325762‑4325960 | tgcatatgaataattaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcag > 1:775236‑M1/100‑100 (MQ=255) catatgaataattaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCg < 2:1298787‑M1/3‑1 (MQ=255) atatgaataattaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGt < 1:469547‑M1/4‑1 (MQ=255) atatgaataattaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGt > 2:1948490‑M1/97‑100 (MQ=255) tatgaataattaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGt < 1:189487‑M1/4‑1 (MQ=255) tatgaataattaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTa > 1:2180907‑M1/96‑100 (MQ=255) atgaataattaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTaa < 2:2645482‑M1/6‑1 (MQ=255) tgaataattaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTaaa < 1:1843353‑M1/7‑1 (MQ=255) tgaataattaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTaaa < 1:1792866‑M1/7‑1 (MQ=255) tgaataattaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTaaa < 2:2228418‑M1/7‑1 (MQ=255) tgaataattaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTaaa < 2:1358388‑M1/7‑1 (MQ=255) tgaataattaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtactagcgttggttgctcttgccggatgcaGCGTaaa < 1:2135093‑M1/7‑1 (MQ=255) gaataattaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAAc < 1:1514526‑M1/8‑1 (MQ=255) aataattaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgtcggatgcaGCGTAAACg > 1:661385‑M1/92‑100 (MQ=255) aataattaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACg > 1:1817424‑M1/92‑100 (MQ=255) taattaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGcc < 2:1582191‑M1/11‑1 (MQ=255) taattaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGcc > 2:771748‑M1/90‑100 (MQ=255) aaGTGTAGTTCGAAATTTATACAGATGAGAGGCGGCCTGATAAGACGCGCGAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGcc < 2:896934/100‑1 (MQ=255) aattaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCt > 2:677686‑M1/89‑100 (MQ=255) attaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCtt < 2:842020‑M1/13‑1 (MQ=255) ttaaaggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTa < 2:2587661‑M1/14‑1 (MQ=255) aGTTCGAAATTTATACAGGTGAGAGGCGGCCTGATAAGACGCGCGAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATcc < 1:408330/100‑1 (MQ=255) aGTTCGAAATTTATACAGATGAGAGGCGGCCTGATAAGACGCGCGAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATcc > 2:1014384/1‑100 (MQ=255) gTTCGAAATTTATACAGATGAGAGGCGGCCTGATAAGACGCGCGAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg > 2:404949/1‑100 (MQ=255) gTTCGAAATTTATACAGATGAGAGGCGGCCTGATAAGACGCGCGAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg > 1:235462/1‑100 (MQ=255) gTTCGAAATTTATACAGATGAGAGGCGGCCTGATAAGACGCGCGAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg > 2:936349/1‑100 (MQ=255) aggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCg < 1:203389‑M1/18‑1 (MQ=255) ggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCgg > 1:1015238‑M1/82‑100 (MQ=255) ggttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggtagctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCgg < 2:1534184‑M1/19‑1 (MQ=255) ttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGcc > 2:1555111‑M1/80‑100 (MQ=255) ttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGcc > 1:832711‑M1/80‑100 (MQ=255) ttatgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGcc > 1:1761342‑M1/80‑100 (MQ=255) cGAAATTTATACACATGAGAGGCGGCCTGATAAGACGCACGAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGc > 2:1708647/1‑99 (MQ=255) tgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTAc > 1:230337‑M1/77‑100 (MQ=255) tgcaacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgttagttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTAc < 2:1764339‑M1/24‑1 (MQ=255) caacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACgg < 1:2732142‑M1/26‑1 (MQ=255) aacgggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGa > 1:2492130‑M1/74‑100 (MQ=255) taCAGATGAGAGGCGGCCTGATAAGACGCGCGAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAggg > 2:1688223/1‑100 (MQ=255) ggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAggg > 1:2557456‑M1/70‑99 (MQ=255) ggcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGt < 1:1456348‑M1/31‑1 (MQ=255) gcaaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTg > 1:527374‑M1/69‑100 (MQ=255) cAGATGAGAGGCGGCCTGATAAGACGCGCGAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTg > 1:1582858/1‑100 (MQ=255) cAGATGAGAGGCGGCCTGATAAGACGCGCGAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTg < 2:1233054/100‑1 (MQ=255) caaagattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGc < 1:39601‑M1/33‑1 (MQ=255) gattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCggg < 2:2530446‑M1/36‑1 (MQ=255) gattaaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGa < 1:1104637‑M1/37‑1 (MQ=255) gagGCGGCCTGATAAGACGCGCGAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAAt < 1:17310/100‑1 (MQ=255) taaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAAtt > 1:422225‑M1/61‑100 (MQ=255) taaacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAAtt > 1:1426412‑M1/61‑100 (MQ=255) agGCGGCCTGATAAGACGCGCGAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGTGGGAAtt < 1:975501/100‑1 (MQ=255) aacttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTg > 2:1514514‑M1/59‑100 (MQ=255) acttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGt > 1:333242‑M1/58‑100 (MQ=255) ggcCTGATAAGACGCGCGAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGATGGTGCGGGAATTTGTa < 2:1193577/100‑1 (MQ=17) ggcCTGATAAGACGCGCGAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTa < 2:830934/100‑1 (MQ=38) cttcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTa > 1:191963‑M1/57‑100 (MQ=255) tcccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAgg > 2:1843338‑M1/55‑100 (MQ=255) ccTGATAAGACGCGCGAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACTGTTGCCGGATGTGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGATGGTGCGGGAATTTg < 2:2019552/96‑1 (MQ=12) cccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGc < 1:106236‑M1/47‑1 (MQ=255) ccagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGcc > 2:2287769‑M1/53‑100 (MQ=255) cagtttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCt < 1:254486‑M1/49‑1 (MQ=255) tttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGAt > 2:2492189‑M1/49‑100 (MQ=255) aaGACGCGCGAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGAt < 1:1940622/100‑1 (MQ=38) ttaatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATa > 1:368476‑M1/48‑100 (MQ=255) taatgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATaa < 1:2445271‑M1/54‑1 (MQ=255) gACGCGCGAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATaa < 1:1691461/100‑1 (MQ=38) atgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGa < 2:1457172‑M1/56‑1 (MQ=255) atgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGa < 1:2507959‑M1/56‑1 (MQ=255) tgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGAc < 1:908343‑M1/57‑1 (MQ=255) tgacaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGAc > 2:209359‑M1/44‑100 (MQ=255) gcgAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGAcgc < 1:1554965/100‑1 (MQ=35) acaggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGAcgc > 1:62382‑M1/42‑100 (MQ=255) ggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCa < 1:2473125‑M1/62‑1 (MQ=255) ggttgctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCa < 1:127330‑M1/62‑1 (MQ=255) gctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCg < 1:1652753‑M1/66‑1 (MQ=255) ctgtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCCAGCGt < 2:734513‑M1/67‑1 (MQ=255) gtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCg < 1:2104399‑M1/69‑1 (MQ=255) gtacttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCg > 2:115334‑M1/32‑100 (MQ=255) acttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCa < 2:811448‑M1/71‑1 (MQ=255) cttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCAt < 2:1433274‑M1/72‑1 (MQ=255) cttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCAt > 2:2377775‑M1/29‑100 (MQ=255) cttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCAt < 2:649303‑M1/72‑1 (MQ=255) ttgcgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATc > 1:1709592‑M1/28‑100 (MQ=255) gCAGTCTGCAATTTTACCGGATGCGTCGTAACCGCCTTATCCGGCCTACGGAGGATGCGCGAATTTTTAGGCCTGATCAGACGCTCAAGCGTCGCATCAg < 2:623558/100‑1 (MQ=11) gCAGTCGGCACTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCGGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAg < 2:354596/100‑1 (MQ=17) gCAGTCGGCACTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAg < 2:2702137/100‑1 (MQ=33) cgtttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAgg > 2:469543‑M1/25‑100 (MQ=255) ttgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAg < 1:2383170‑M1/79‑1 (MQ=255) tgttgctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGGGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATAAGGCAg < 2:41342‑M1/79‑1 (MQ=255) cGGCACTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAGt > 1:2144964/1‑100 (MQ=11) ctcttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCa > 2:2738826‑M1/16‑100 (MQ=255) cttgccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCa < 2:561224‑M1/85‑1 (MQ=255) ttGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACCa < 2:290619/100‑1 (MQ=11) gccggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAAAATGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACCAtt < 2:1045296‑M1/90‑1 (MQ=255) gCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACCAtt > 1:1360658/1‑100 (MQ=32) cggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACCATTGc < 1:176579‑M1/92‑1 (MQ=255) ggatgcaGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACCATTGcc < 1:1148152‑M1/93‑1 (MQ=255) caGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACCATTGCCGGATg > 1:886352‑M1/3‑100 (MQ=255) ggcgTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCAACAGTGCCgactgc < 1:704153/100‑6 (MQ=11) aGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACCATTGCCGGATgc < 1:1008954‑M1/99‑1 (MQ=255) GCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACCATTGCCGGATgcg > 1:2637134‑M1/1‑100 (MQ=255) | GAAGCCAGTTAAGTGTAGTTCGAAATTTATACAGATGAGAGGCGGCCTGATAAGACGCGCGAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACTGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGAGGGTGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGCAAGCGTCGCATCAGGCAGTCGGCACCATTGCCGGATGCG > NC_000913/4325762‑4325960 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |