| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4325861 = | 148 (1.420) | 201 (2.660) | 78/130 | NT | 69.8% | noncoding (60/583 nt) | REP325 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP325 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 4374507 | 66 (0.870) | noncoding (10/99 nt) | RIP329 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences and 1 IHF site | RIP329 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences and 1 IHF site | |||||
Only 100 of 414 total aligned reads displayed.
ATGCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGCAATTTTAATG > NC_000913/4374408‑4374606 | gCATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgc > 2:2793526‑M2/1‑98 (MQ=255) cATATGAATAATTAAAGGTTATGGAACTGGCAAAGATTAAACTTCCCATTTTAATGACAGGGTGCTGTACTTGCGTTTGTTTCGCTTGCCGTATGCAGCg > 1:584029/1‑100 (MQ=255) cATATGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTACCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGCTGCAgc < 1:232154‑M2/99‑3 (MQ=255) tatGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgta > 1:674192‑M2/1‑95 (MQ=255) atGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaa < 2:1125742‑M2/100‑7 (MQ=255) tGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaa > 2:773902‑M2/1‑93 (MQ=255) tGAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaa < 1:1565613‑M2/100‑8 (MQ=255) gAATAATTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaac < 1:1886704‑M2/100‑9 (MQ=255) aatTAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgcct > 2:2469342‑M2/1‑88 (MQ=255) ttAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgcctta < 1:2823453‑M2/100‑15 (MQ=255) ttAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgcctta > 2:1857632‑M2/1‑86 (MQ=255) tAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttat < 2:2390348‑M2/100‑16 (MQ=255) tAAAGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttat < 1:1114488‑M2/100‑16 (MQ=255) aaaGGTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatc < 2:2357482‑M2/100‑17 (MQ=255) ggTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCTGATGCAgcgtaaacgccttatccgg < 2:2709496‑M2/100‑20 (MQ=255) ggTTATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccgg < 1:706093‑M2/100‑20 (MQ=255) gTTATGCAACGGGCAAAGATTATACTTCCTAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggc > 1:1351360‑M2/1‑80 (MQ=255) ttATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcc > 2:2684995‑M2/1‑79 (MQ=255) tATGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcct < 2:472549‑M2/100‑23 (MQ=255) aTGCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggccta > 1:1999271‑M2/1‑77 (MQ=255) gCAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacg < 1:1447841‑M2/100‑26 (MQ=255) cAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacgg < 2:1740586‑M2/100‑27 (MQ=255) cAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacgg < 1:625724‑M2/100‑27 (MQ=255) cAACGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacgg > 2:2199316‑M2/1‑74 (MQ=255) aCGGGCAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGtt > 2:2620346/1‑100 (MQ=255) cAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgc < 2:1830164‑M2/100‑34 (MQ=255) cAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgc < 1:2364633‑M2/100‑34 (MQ=255) cAAAGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgc < 1:2560799‑M2/100‑34 (MQ=255) aaaGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGc < 2:2498478/100‑1 (MQ=255) aaGATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgg < 1:1059252‑M2/100‑36 (MQ=255) gATTAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCaaa < 2:2093433/100‑1 (MQ=255) ttAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTAGTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgacttatccggcctacggagggtgcggga < 1:1751220‑M2/98‑38 (MQ=255) tAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatt > 2:856031‑M2/1‑60 (MQ=255) tAAACTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatt > 2:1247342‑M2/1‑60 (MQ=255) aaaCTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaattt < 2:158980‑M2/100‑42 (MQ=255) aaaCTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaattt < 2:2856926‑M2/100‑42 (MQ=255) aaCTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttg < 1:378607‑M2/100‑43 (MQ=255) aaCTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttg < 2:1008512‑M2/100‑43 (MQ=255) aaCTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttg > 2:170050‑M2/1‑58 (MQ=255) cTTCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCAttc < 1:891087/100‑1 (MQ=255) tCCCAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtagg > 1:1081540‑M2/1‑54 (MQ=255) ccAGTTTAATGACAGGGTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTatccggcaagagcaacaaacgcaagtacagcaacc < 2:1569934‑M2/100‑36 (MQ=255) cAGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcct < 1:621531‑M2/100‑50 (MQ=255) aGTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCAttcaatttc < 1:7819/100‑1 (MQ=255) gTTTAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCAttcaatttca < 1:1199131/100‑1 (MQ=255) tttAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgat > 2:1672001‑M2/1‑48 (MQ=255) tAATGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataa > 1:563119‑M2/1‑46 (MQ=255) aggACAGGCTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCa > 2:1961636/3‑100 (MQ=255) tGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcggggatttgtagacc < 1:1000322‑M2/91‑49 (MQ=255) tGACAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagac < 1:1842602‑M2/100‑58 (MQ=255) cAGGTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagacgcg > 1:323051‑M2/1‑40 (MQ=255) ggTTGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGt < 1:839207/100‑1 (MQ=255) ttGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagacgcgcaag > 1:1164828‑M2/1‑36 (MQ=255) tGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagacgagcaagc < 2:2827384‑M2/100‑66 (MQ=255) tGCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAgg < 1:226042/100‑1 (MQ=255) gCTGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagacgcgcaagcg < 1:205285‑M2/100‑67 (MQ=255) tGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagacgcgcaagcgtc < 1:2178898‑M2/100‑69 (MQ=255) tGTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTatccggctagagcaacacacgcaagtacagcagactgtcattaaactgggaagtt < 1:1968831‑M2/100‑56 (MQ=255) gTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagacgcgcaagcgtcg < 2:2576137‑M2/100‑70 (MQ=255) gTACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagacgcgcaagcgtcg < 2:1073446‑M2/100‑70 (MQ=255) tACTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagacgcgcaagcgtcgc > 1:2735865‑M2/1‑30 (MQ=255) atcttGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagacgcgcaagcgtcgc > 1:1486599‑M2/3‑30 (MQ=255) cTTGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATa < 2:619644/100‑1 (MQ=255) tGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagacgcgcaagcgtcgcagat < 2:1486605‑M2/100‑75 (MQ=255) tGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAg < 2:2736680/100‑1 (MQ=255) tGCGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAg > 2:665022/1‑100 (MQ=255) cGTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagacgcgcaagcgtcgcatcagg > 2:929298‑M2/1‑24 (MQ=255) gTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagacgcgcaagcgtcgcatcaggc > 1:2469776‑M2/1‑23 (MQ=255) gTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagacgcgcaagcgtcgcatcaggc > 2:532685‑M2/1‑23 (MQ=255) gTTTGTTGCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagacgcgcaagcgtcgcatcaggc > 2:1522366‑M2/1‑23 (MQ=255) tttGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTa > 2:2001267/1‑100 (MQ=255) tttGTTGCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTa > 2:1330038/1‑100 (MQ=255) ttgttgCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagacgcgcaagcgtcgcatcaggcag > 1:1541433‑M2/1‑21 (MQ=255) tgttgCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagacgcgcaagcgtcgcattaggcagt < 1:811652‑M2/100‑81 (MQ=255) tgttgCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCAATTCAATTTAAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAg > 1:987641/1‑99 (MQ=255) ttgCTCTTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGa > 2:1301148/1‑100 (MQ=255) tgCTCTTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagacgcgcaagcgtcgcatcaggcagtcgg < 2:2514592‑M2/100‑84 (MQ=255) 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ctTGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagacgcgcaagcgtcgcatcaggcagtcggcacc > 2:875687‑M2/1‑13 (MQ=255) ctTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTatccggcaagagcaacaaacgcaagtacagcaacctgtcattaaactgggaagtttaatctttgcccgttgc < 1:2408078‑M2/98‑73 (MQ=255) ttGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTatccggcaagagcaacaaacgcaagtacagcaacctgtcattaaactgggaagtttaatctttgcccgttgcata < 2:1212628‑M2/100‑76 (MQ=255) ttGCCGGACGCAGCGTAAACGCCTTatccggcaagagcaacaaacgcaagtacatcaacctgtcattaaactgggaagtttaatctttgcccgctgcata < 1:1303230‑M2/100‑76 (MQ=255) tGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagacgcgcaagcgtcgcatcaggcagttggcactgt < 1:1686005‑M2/100‑90 (MQ=255) tGCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagacgcgcaagcgtcgcatcaggcagatcggaagag < 2:2050495‑M2/100‑90 (MQ=255) tGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTatccggcaagagcaacaaacgcaagtacagcaacctgtcattaaactgggaagtttaatctttgcccgttgcataa < 2:2225677‑M2/100‑77 (MQ=255) tGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTatccggcaagagcaacaaacgcaagtacagcaacctgtcattaaactgggaagtttaatctttgcccgttgcataa < 2:1401208‑M2/100‑77 (MQ=255) tGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAATCCATTCAATTTCAATGCACGATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGAATCAGGc > 2:566942/1‑100 (MQ=255) gCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagacgcgcaagcgtcgcatcaggcagtcggcaccatt < 2:2135288‑M2/100‑91 (MQ=255) gCCGGATGCAgcgtaaacgccttatccggcctacggagggtgcgggaatttgtaggcctgataagacgcgcaagcgtcgcataaggcagtcggcacgatt < 1:265730‑M2/100‑91 (MQ=255) gCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTatccggcaagagcaacaaacgcaagtacagcaacctgtcattaaactgggaagtttaatctttgcccgttgcataac < 2:2918517‑M2/100‑78 (MQ=255) gATGCAgcgtaaacgccttcgccggcctacggggggggcgggaatttgtaggcctgataagacgcgcaggcgtcgcatcaggcagtcggcaccattgccg > 1:1225184‑M2/1‑6 (MQ=255) aTGCAGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAGTTCATTGCAAAGCCATTCAATTTCAATCCACGATGTAGTCCTGATAAGCGTAGCGACTCAGGCAAtttt > 1:495347/1‑100 (MQ=37) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |