| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4628749 | 104 (0.870) | 6 (0.050) | 4/164 | NT | 5.2% | noncoding (55/150 nt) | RIP354 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 3 REP sequences and 1 IHF site | RIP354 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 3 REP sequences and 1 IHF site |
| ? | NC_000913 | = 4628768 | 125 (1.130) | noncoding (74/150 nt) | RIP354 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 3 REP sequences and 1 IHF site | RIP354 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 3 REP sequences and 1 IHF site | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
CCTGCACGGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCGCGCCGCATCCGGCATTT > NC_000913/4628650‑4628848 | ccTGCACGGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGAT > 2:2563947‑M1/1‑100 (MQ=255)ccTGCACGGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGAT > 1:2857105‑M1/1‑100 (MQ=255)ccTGCACGGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGAT > 2:18781‑M1/1‑100 (MQ=255) cTGCACGGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATg < 2:1194351/100‑1 (MQ=255) tGCACGGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGc > 1:1568808/1‑100 (MQ=255) tGCACGGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGc > 1:222765/1‑100 (MQ=255) cGGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACg < 2:122835/100‑1 (MQ=255) gggTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGc < 1:227438/100‑1 (MQ=255) aCCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTAcc > 2:2341900/1‑100 (MQ=255) cccGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACcg > 2:2331069/1‑100 (MQ=255) cccGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACcg > 2:1334928/1‑100 (MQ=255) cccGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACcg > 2:587641/1‑100 (MQ=255) cccGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACcg > 2:2730911/1‑100 (MQ=255) cccGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCAGATGCGACGCTTACcg > 2:1903016/1‑100 (MQ=255) cACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCt > 2:1696384/1‑100 (MQ=255) aaaTTGAGGATGCTAAGGCTGTTATAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTatc > 1:412057‑M2/1‑97 (MQ=255) aaTTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTatca > 1:1867923‑M2/1‑96 (MQ=255) aTTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTatcag > 1:1698703‑M2/1‑95 (MQ=255) aTTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTatcag > 1:1698628‑M2/1‑95 (MQ=255) aTTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTatcag < 1:2248108‑M2/100‑6 (MQ=255) ttGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATCCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTatcagg < 2:2074919‑M2/100‑7 (MQ=255) tGAGGATTCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTatcaggc > 1:187467‑M2/1‑93 (MQ=255) tGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGTATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTatcaggc > 1:1934972‑M2/1‑93 (MQ=255) tGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATaagacgcggtaatcgtcgcatcaggc < 1:2182506‑M1/100‑27 (MQ=255) tGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATaagacgcggtaagcgtcgcatcaggc < 1:2981642‑M1/100‑27 (MQ=255) tGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATaagacgcggtaagcgtcgcatcaggc < 1:723499‑M1/100‑27 (MQ=255) aGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCt < 1:680738/100‑1 (MQ=255) ggATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATaagacgcggtaagcgtcgcatcaggcatt < 2:1553008‑M1/100‑30 (MQ=255) gATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTAc < 2:2482173/100‑1 (MQ=255) tGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATaagacgcggtaagcgtcgcatcaggcattgag < 1:778384‑M1/100‑33 (MQ=255) tGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAg > 2:1095539/1‑100 (MQ=255) tGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAg > 1:2611995/1‑100 (MQ=255) gCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGt > 1:550506/1‑100 (MQ=255) tAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGttt > 2:1599493/1‑100 (MQ=255) tAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGttt > 1:3207211/1‑100 (MQ=255) tAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGttt < 2:3140573/100‑1 (MQ=255) tAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGttt < 2:448198/100‑1 (MQ=255) aaGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGtttt < 1:1951294/100‑1 (MQ=255) aaGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGCGTTCACGCCGACTCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTAATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGttt < 1:1457220/99‑1 (MQ=25) aGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTa < 1:1997317/100‑1 (MQ=255) ggCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTAc > 2:2806012/1‑100 (MQ=255) gCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACa > 1:2044921/1‑100 (MQ=255) tgttgtAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAAc < 1:1272218/100‑1 (MQ=255) tgtAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTa > 2:681299/1‑100 (MQ=255) gtAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTAt > 2:3073993/1‑100 (MQ=255) tAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTAtt > 2:3241301/1‑100 (MQ=255) aGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTg > 1:1506310/1‑100 (MQ=255) aCCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGaa > 2:901656/1‑100 (MQ=255) ccGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGaaa > 1:281456/1‑100 (MQ=255) cGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCTTACAGTTTTACAACGTATTGAAAt < 2:400023/100‑1 (MQ=255) cGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGaaan < 2:2769632/100‑2 (MQ=255) ggAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAAtt > 2:3066081/1‑100 (MQ=255) cGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTgg > 1:1650086/1‑100 (MQ=255) ggTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGt > 2:1780514/1‑100 (MQ=255) gtgtTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGtt > 1:650814/1‑100 (MQ=255) gtgtTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGtt > 1:1312076/1‑100 (MQ=255) tgtTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGttn < 1:2444628/100‑2 (MQ=255) ttCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTg < 2:1622460/100‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTa > 1:2347482/1‑100 (MQ=255) cACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTa > 1:858368/1‑100 (MQ=255) aCGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAg > 1:2992600/1‑100 (MQ=255) cgccgcATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGTTGCGACGCTCACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAgg < 2:2282216/100‑1 (MQ=255) cgccgcATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAg > 1:2084098/1‑99 (MQ=255) cgccgcATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCACGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAgg > 1:2413572/1‑100 (MQ=255) gcATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCgg < 2:950451/100‑1 (MQ=255) gcATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCgg > 2:1189323/1‑100 (MQ=255) cATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGa < 2:858364/100‑1 (MQ=255) cGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATaa > 1:194582/1‑99 (MQ=255) cGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATAAg < 1:2600452/100‑1 (MQ=255) gCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTatcaggcattgagcaccgaatgccggatgcggcgtgaacaccgtttccggtctacaac < 1:151207‑M2/100‑59 (MQ=255) gCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATAAGGc < 2:748473/100‑1 (MQ=255) cATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATAAGGCg < 2:2857080/100‑1 (MQ=255) cATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATAAGGCg > 1:3122893/1‑100 (MQ=255) ttCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGt < 2:328178/99‑1 (MQ=255) cGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTcg > 2:1231930/1‑100 (MQ=255) cGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTcg > 1:546313/1‑100 (MQ=255) ggTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTcgc > 1:2982596/1‑100 (MQ=255) gCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCGcgcc < 1:1192551/100‑1 (MQ=255) gCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCGcgcc > 1:1613852/1‑100 (MQ=255) cTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTatcaggcattgagcaccgaatgccggatgcggcgtgaacaccgtttccggtctacaacagccttagca < 1:778384‑M2/100‑69 (MQ=255) cTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCGcgccg < 2:1861799/100‑1 (MQ=255) cAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCGCGCCGCa < 2:245332/100‑1 (MQ=255) aaTGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTatcaggcattgagcaccgaatgccggatgcggcgtgaacaccgtttccggtctacaacagccttagcatcc < 2:1553008‑M2/100‑72 (MQ=255) aTGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCGCGCCGCATc > 1:1880974/1‑100 (MQ=255) gCCTGATaagacgcggtaagcgtcgcatcaggcattgagcaccgaatgccggatacggcgtgaacaccgtttccggtctacaacagccttagcatcctca > 1:1934972‑M1/1‑7 (MQ=255) gCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTatcaggcattgagcaccgaatgccggatgcggcgtgaacaccgtttccggtctacaacagccttagcatcctca < 1:723499‑M2/100‑75 (MQ=255) gCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCGCGCCGCAtac > 1:305415/1‑97 (MQ=255) ccTGATaagacgcggtaagcgtcgcatcaggcattgagcaccggatgccggatgcggcgtgaacaccgtttccggtctacaacagccttagcatcctcaa < 2:2074919‑M1/100‑95 (MQ=255) ccTGATaagacgcggtaagcgtcgcatcaggcattgagcaccgaatgccggatgcggcgtgaacaccgtttccggtctacaacagccttagcatcctcaa > 2:1621382‑M1/1‑6 (MQ=255) cTGATaagacgcggtaagcgtcgcatcaggcattgagcaccgaatgccggatgcggcgtgaacaccgtttccggtctacaacagccttagcatcctcaat > 1:1698628‑M1/1‑5 (MQ=255) cTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCGCGCCGCATCCGGc > 2:745074/1‑100 (MQ=255) cTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCGCGCCGCATCCGGc < 1:600778/100‑1 (MQ=255) tGATaagacgcggtaagcgtcgcatcaggcattgagcaccgaatgccggatgcggcgtgaacaccgtttccggtctacaacagccttagcatcctccatt > 1:2382038‑M1/1‑4 (MQ=255) tGATaagacgcggtaagcgtcgcatcaggcattgagcaccgaatgccggatgcggcgtgaacaccgtttccggtctacaacagccttagcatcctcaatt > 1:1867923‑M1/1‑4 (MQ=255) tGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCGCGCCGCATCCGGc < 1:1183463/99‑1 (MQ=255) gATaagacgcggtaagcgtcgcatcaggcattgagcaccgaatgccggatgcggcgtgaacaccgtttccggtctataacagccttagcatcctcaattt > 1:412057‑M1/1‑3 (MQ=255) aTaagacgcggtaagcgtcgcatcaggcattgagcaccgaatgccggatgcggcgtgaacaccgtttccggtctacaacagccttagcatcctcaatttc < 1:3122159‑M1/100‑99 (MQ=255) aTGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCGCGCCGCATCCGGCAtt > 1:2911060/1‑100 (MQ=255) aTGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCGCGCCGCATCCGGCAtt > 1:2912198/1‑100 (MQ=255) tGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCGCGCCGCATCCGGCAttt < 2:2863925/100‑1 (MQ=255) | CCTGCACGGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAGTTTTACAACGTATTGAAATTGCTGGTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCGCGCCGCATCCGGCATTT > NC_000913/4628650‑4628848 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |