| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 774622 | 70 (0.820) | 16 (0.200) | 11/166 | NT | 19.5% | intergenic (+20/‑130) | ybgE/ybgC | putative inner membrane protein in cydABX‑ybgE operon/acyl‑CoA thioester hydrolase |
| ? | NC_000913 | = 774648 | 67 (0.840) | intergenic (+46/‑104) | ybgE/ybgC | putative inner membrane protein in cydABX‑ybgE operon/acyl‑CoA thioester hydrolase | |||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
AGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGC > NC_000913/774523‑774720 | aGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAA < 2:1553954‑M1/100‑1 (MQ=255) gTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAAt < 2:1371024/100‑1 (MQ=255) cTTTGGCAAGGTATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGTGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTAt < 1:227593/100‑1 (MQ=255) cTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTAt < 2:48364/100‑1 (MQ=255) tttGGCAAGGGATTTTTTGCCCGTTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATg > 2:1382867/1‑100 (MQ=255) ttgtgaaGGGTTTTGTTGGGCGTTGTTTGCCGATATGGTTATCAGTGTGGGGCTTATCTGCTTGTTCTTTTAAATGAGAATTCTCTTTAAAAAAt < 2:1276093/90‑1 (MQ=255) ttGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATgg < 1:538110/100‑1 (MQ=255) ttGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATgg < 2:702367/100‑1 (MQ=255) ggCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGc > 1:1769741/1‑100 (MQ=255) ggCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTACTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGc > 1:1291889/1‑100 (MQ=255) gggATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGc < 2:796192/98‑1 (MQ=255) gggATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTc < 1:94969/100‑1 (MQ=255) gggATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCAGTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGACTTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGc > 2:1271955/1‑98 (MQ=255) ggATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTcc > 2:1644774/1‑100 (MQ=255) gATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCa < 1:1496469/100‑1 (MQ=255) ttttGCCCATTGCTTGCCGTTATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGcc < 1:586771/100‑1 (MQ=255) ttttGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAattatgggcctggagcggcc < 2:263364‑M1/100‑21 (MQ=255) tgtccATTTCTTGGCGCTCTTCTTCTCATTGGCGCGCTGGATCTCTGCTTGTTGTAGACAGGACTTGTCTTTAAGAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCAt < 2:282257/97‑1 (MQ=255) tGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAtttatgggcctggagcggcccat < 1:1236004‑M1/100‑24 (MQ=255) tGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAtttatgggcctggagcggcccat < 1:51636‑M1/100‑24 (MQ=255) tGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAtttatgggcctggagcggcccat < 1:2087552‑M1/100‑24 (MQ=255) cccccttcctgcCCATATTGTTCTCAATGTCGGGCTCATTTTCTTCTTCCTTTAATCCACAATTCCCTTTAAAAAATTATGGTCCGATCCAGGCCCa < 2:1634586/88‑1 (MQ=255) ccATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATaaa > 1:887449/1‑100 (MQ=255) aTTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAtttatgggcctggagcggcccataattt < 1:1047017‑M1/100‑29 (MQ=255) ttgcttgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAttt > 2:1244141‑M2/1‑97 (MQ=255) tgcttgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAtttatgggcctggagcggcccataattttt < 1:2055295‑M1/100‑31 (MQ=255) tgcttgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAtttatgggcctggagcggcccataattttt < 2:1819505‑M1/100‑31 (MQ=255) tgcttgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttt > 2:2110066‑M2/1‑96 (MQ=255) gcttgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAttttt < 1:252706‑M2/100‑6 (MQ=255) cttgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAattatgggcctggagcggcccataatttttta < 1:1099143‑M1/100‑33 (MQ=255) cttgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAttttta > 1:599706‑M2/1‑94 (MQ=255) ttgcTGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTAc < 2:355715/100‑1 (MQ=255) tgcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACg < 1:506081/100‑1 (MQ=255) gcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAtttatgggcctggagcggcccataattttttaaag < 1:1566587‑M1/100‑36 (MQ=255) gcCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAtttatgggcctggagcggcccataattttttaaag < 1:757442‑M1/100‑36 (MQ=255) ccGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTATAAAtttatgggcctggagcggcccttaattttttaaag < 2:1473301‑M1/99‑36 (MQ=255) ccGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCt < 2:1390296/100‑1 (MQ=255) ccGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCt > 1:918470/1‑100 (MQ=255) cGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAtttatgggcctggagcggcccataattttttaaagag < 1:759199‑M1/100‑38 (MQ=255) gATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAtttatgggcctggagcggcccataattttttaaagaga < 2:635969‑M1/100‑39 (MQ=255) ttttGTTAACAGTGTCGTGATGCTTTTCTTCTTCTTATAAATCAGAATTCTCTTTAAAAATTTATGGGCCTGGAGCGGCCCATAATTTTTTaaac < 2:1145147/93‑4 (MQ=2) ttCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACt < 2:1217789/100‑1 (MQ=255) ctcATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAATtttttaaagagaattctgatt > 1:107349‑M2/1‑79 (MQ=255) ctcATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTg < 2:706076/100‑1 (MQ=255) ctcATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTg > 1:671224/1‑100 (MQ=255) ctcATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTg > 2:2141898/1‑100 (MQ=255) tcATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACttn < 2:1592166/99‑2 (MQ=255) tcATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTg < 2:849505/99‑1 (MQ=255) tcATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGc < 1:443078/100‑1 (MQ=255) cATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGcc > 1:2268446/1‑100 (MQ=255) cATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGcc < 2:2360494/100‑1 (MQ=255) aTTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGccc > 2:163282/1‑100 (MQ=255) ttGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCt < 2:1775810/100‑1 (MQ=255) tggTCGGGCTGATGTTGTTCTTCTTTTAGATCAGAATTCTCTTTAAGAAATTCTGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTATCTTGCCCt < 2:2073883/98‑1 (MQ=255) gTCGGGCTGCTTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAACTTATGGGACGATTAAAGCCCATAAATTTTTACACTCCCTTAACTTACCCTc > 2:2217095/1‑99 (MQ=255) gTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCa > 2:1565459/1‑100 (MQ=255) gTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCa > 2:1450459/1‑100 (MQ=255) gggCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTc < 1:1870743/100‑1 (MQ=255) gggCTGATTTTCTTCATCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCAtt < 2:1395552/99‑1 (MQ=255) ggCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCAATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTcc > 1:1677767/1‑100 (MQ=255) gCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTccc < 1:149532/100‑1 (MQ=255) tGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCaa > 1:1499609/1‑100 (MQ=255) gATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCaca > 2:681688/1‑98 (MQ=255) gATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCaaa > 2:1202100/1‑100 (MQ=255) aTTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAAc < 2:1769727/100‑1 (MQ=255) tttCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCt < 2:1254403/100‑1 (MQ=255) ttcttcttcTTTTAAATCAGAATTCTCTTTCTAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTc < 2:869183/100‑1 (MQ=255) tcttTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATTGGCCGCTCCAGGCCCATAATTTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATcgc > 2:1020433/1‑99 (MQ=255) tcttTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATcgcg > 2:1611006/1‑100 (MQ=255) tttAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATcgcgcgc > 2:762137/1‑100 (MQ=255) ttAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATcgcgcgcg < 2:436441/100‑1 (MQ=255) aaTCAGAATTCTCTTTAAAAAattatgggcctggagcggcccataattttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgag > 1:107349‑M1/1‑21 (MQ=255) cAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTAtagt > 2:682925/1‑100 (MQ=255) aGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTAtagta > 2:220673/1‑100 (MQ=255) gAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTAtagtag < 1:762139/100‑1 (MQ=255) gAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTAtagtag > 1:1914019/1‑100 (MQ=255) aTTCTCTTTAAAAAACTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTagca < 1:2350693/100‑1 (MQ=255) ctctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcg < 1:759199‑M2/100‑64 (MQ=255) ctctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTagcagcn < 1:1210036/100‑2 (MQ=255) ctctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTagcag < 2:1056355/98‑1 (MQ=255) tctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcgg < 1:2005548‑M2/100‑65 (MQ=255) ctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggc < 1:1566587‑M2/100‑66 (MQ=255) ctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGtt < 2:1231233/100‑1 (MQ=255) ctTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGtt < 1:1176091/100‑1 (MQ=255) ctTTAAAAAATTAAGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttataaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcgg < 2:1473301‑M2/99‑65 (MQ=255) tttAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGttt < 2:1217003/100‑1 (MQ=255) ttAAAAAATTATGGGCCGCCCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTa > 1:654487/1‑100 (MQ=255) tAAAAAtttatgggcctggagcggcccataattttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggcaag < 1:808661‑M1/100‑95 (MQ=255) aaaaatttatgggcctggagcggcccataattttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggcaagc < 2:953092‑M1/100‑96 (MQ=255) aaaaatttatgggcctggagcggcccataattttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggcaagc < 1:252706‑M1/100‑96 (MQ=255) aaaaaaTTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTaaa > 1:661678/1‑100 (MQ=255) aaaaaaTTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTaaa > 1:11555/1‑100 (MQ=255) aaaatttatgggcctggagcggcccataattttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggcaagca > 2:2110066‑M1/1‑4 (MQ=255) aaaaaTTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggcaagca < 2:1819505‑M2/100‑71 (MQ=255) aaaaaTTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggcaagca < 1:2055295‑M2/100‑71 (MQ=255) aaaaaTTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTaaaa < 1:183774/100‑1 (MQ=255) aaatttatgggcctggagcggcccataattttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggcaagcaa > 2:1244141‑M1/1‑3 (MQ=255) aatttatgggcctggagcggcccataattttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggcaagcaa > 2:1932105‑M1/1‑2 (MQ=255) aaaTTATGGGCTGCTCCGGGCCCGTAAATTTTTACGATCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAACCCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAACAGc > 2:442967/1‑100 (MQ=255) aaaTTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAAtttttaaagagaattctgatttaaaagaagaagaaaatcagcccgacaatgagaacaatatcggcaagcaat < 1:1047017‑M2/100‑73 (MQ=255) | AGGTTCTTTGGCAAGGGATTTTTTGCCCATTGCTTGCCGATATTGTTCTCATTGTCGGGCTGATTTTCTTCTTCTTTTAAATCAGAATTCTCTTTAAAAAATTATGGGCCGCTCCAGGCCCATAAATTTTTACGCTCCCTTAACTTGCCCTCATTCCCAAACCTCAATCGCGCGCGTATAGTAGCAGCGTTTAAAAGC > NC_000913/774523‑774720 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |