New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1534883 = | NA (NA) | 9 (0.120) | 7/162 | NT | NA | noncoding (1/75 nt) | REP118 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP118 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences |
? | NC_000913 | 1534913 = | NA (NA) | noncoding (31/75 nt) | REP118 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP118 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
GATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCC > NC_000913/1534786‑1534981 | gatgatGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGcc > 1:1496698/1‑100 (MQ=255) gatgatGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGcc > 1:1080651/1‑100 (MQ=255) ccgatctgattttgtttcatgccgaatgggcaattgaactctgaaaccgttgtctgatgcgcttcgcctgtcaggtctacaaccgggctaatgtatGCCg > 1:1238308‑M1/97‑100 (MQ=255) tgatgCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCgg < 2:784299/100‑1 (MQ=255) agcggtgattttgtttcatgccgaatgggcaattgaactctgaaaccgttgtctgatgcgcttcgcctgtcaggtctacaaccgggctaatgtatGCCgg > 2:1645709‑M1/96‑100 (MQ=255) gcggtgattttgtttcatgccgaatgggcaattgaactctgaaaccgttgtctgatgcgcttcgcctgtcaggtctacaaccgggctaatgtatGCCGGa < 2:554774‑M1/6‑1 (MQ=255) cggtgattttgtttcatgccgaatgggcaattgaactctgaaaccgttgtctgatgcgcttcgcctgtcaggtctacaaccgggctaatgtctGCCg < 2:1513333‑M1/4‑1 (MQ=255) cggtgattttgtttcatgccgaatgggcaattgaactctgaaaccgttgtctgatgcgcttcgcctgtcaggtctacaaccgggctaatgtatGCCGGAt > 1:944907‑M1/94‑100 (MQ=255) atgCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATGATTTATGTCAGGTTGCCGGAt < 2:489378/100‑1 (MQ=255) tgCGAAACATGGCTTTACCGGGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGa > 1:1186693/1‑98 (MQ=255) tccGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATg > 1:1613957/3‑100 (MQ=255) gCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATgc < 1:792774/100‑1 (MQ=255) cGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCGGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATgcg > 1:703769/1‑100 (MQ=255) cGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATgcg > 2:1294015/1‑100 (MQ=255) cGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATgcg > 1:2059814/1‑100 (MQ=255) gattttgtttcatgccgaatgggcaattgaactctgaaaccgttgtctgatgcgcttcgcctgtcaggtctacaaccgggctaatgtatgccgagatcgg < 2:1238301‑M1/11‑8 (MQ=255) aaCATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATgcggcg < 1:20781/100‑1 (MQ=255) aCATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGt > 1:1199313/1‑100 (MQ=255) cATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATATGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTa > 2:2099265/1‑100 (MQ=255) cATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTa > 1:734953/1‑100 (MQ=255) gCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACg > 2:839836/1‑100 (MQ=255) tttACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGcc < 1:1753468/100‑1 (MQ=255) tttACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGcc < 2:583978/100‑1 (MQ=255) ttACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGAGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCAGGATGCGGCGTAAACGACt > 2:2194933/1‑100 (MQ=255) tACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCtt > 1:2303643/1‑100 (MQ=255) aCCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTa < 2:2059796/100‑1 (MQ=255) ccGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTAt > 1:2249238/1‑100 (MQ=255) ccGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTAt > 2:1950019/1‑100 (MQ=255) gaattggcaattgaactctgaaaccgttgtctgatgcgtttcgcctgtcaggtctacaaccgggctaatgtatGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATcc > 2:1856832‑M1/74‑100 (MQ=255) gaatgggcaattgaactctgaaaccgttgtctgatgcgcttcgcctgtcaggtctacaaccgggctaatgtatGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATcc > 2:193939‑M1/74‑100 (MQ=255) gaatgggcaattgaactctgaaaccgttgtctgatgcgcttcgcctgtcaggtctacaaccgggctaatgtatGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATcc > 1:404624‑M1/74‑100 (MQ=255) tGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg < 2:1802936/100‑1 (MQ=255) tGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg < 1:638517/100‑1 (MQ=255) tGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCg > 1:2008370/1‑100 (MQ=255) ggATGGGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCTGCGTAAACGCCTTATCCgg < 2:1988920/100‑1 (MQ=255) ggATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATGCGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATCTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCgg < 2:2031166/100‑1 (MQ=255) atgggcaattgagctcggaatccggtgtctgatgcgcttcgcctgtcaggtcgacaaccgggctaatgtatGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCgg > 1:438891‑M1/72‑100 (MQ=255) gATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGc < 1:1648455/100‑1 (MQ=255) aTGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCa < 1:1761218/100‑1 (MQ=255) aTGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCa < 2:1417601/100‑1 (MQ=255) ggcaattgaactctgaaaccgttgtctgatgcgcttcgcctgtcaggtctacaaccgggctaatgtatGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCAt > 1:1423025‑M1/69‑100 (MQ=255) ggcaattgaactctgaaaccgttgtctgatgcgcttcgcctgtcaggtctacaaccgggctaatgtatGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCAt > 2:1107494‑M1/69‑100 (MQ=255) gcaattgaactctgaaaccgttgtctgatgcgcttcgcctgtcaggtctacaaccgggctaatgtatGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATa > 1:339563‑M1/68‑100 (MQ=255) gAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCaac < 1:2037154/100‑3 (MQ=25) gTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACa > 1:1357423/1‑100 (MQ=255) gTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACa > 1:1531870/1‑100 (MQ=255) ttAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACAt < 1:389160/100‑1 (MQ=255) aGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCaacctgac < 1:181020/100‑8 (MQ=21) gcgcTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAg < 1:768410/100‑1 (MQ=255) gcgcTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAg < 1:189752/100‑1 (MQ=255) gaactctgaaaccgttgtctgatgcgcttcgcctgtcaggtctacaaccgggctaatgtatGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAg > 1:723390‑M1/62‑100 (MQ=255) cgcTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCagatcggaag > 2:1101322/1‑91 (MQ=21) cTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGccc > 2:2111062/1‑100 (MQ=255) gTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGt > 2:1805134/1‑100 (MQ=255) tGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGtt < 1:1535170/100‑1 (MQ=255) tGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTa > 2:815478/1‑100 (MQ=255) tGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTa < 2:987131/100‑1 (MQ=255) tGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTa < 2:1886168/100‑1 (MQ=255) ggcggcGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAg < 2:1180276/100‑1 (MQ=255) cggcgTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGAc > 1:275472/1‑100 (MQ=255) ggcgTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGAcc < 1:1950035/100‑1 (MQ=255) ggcgTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGAcc < 1:2100325/100‑1 (MQ=255) ggcgTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCCTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGAcc < 1:499584/100‑1 (MQ=255) gcgTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGCAAATAATTTCTGTCAGGTTGCCGCCTGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTACTCCGGTTGTAGAc > 2:1821339/1‑98 (MQ=37) cgTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTg < 1:636264/100‑1 (MQ=255) ttGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACa > 2:1841537/1‑100 (MQ=255) gATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAgg > 2:2042992/1‑100 (MQ=255) gATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAgg > 2:842864/1‑100 (MQ=255) gATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAgg > 1:224040/1‑100 (MQ=255) aTACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGc > 1:444788/1‑100 (MQ=255) tACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGcn < 1:921103/100‑2 (MQ=255) cGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGaa > 2:1667745/1‑100 (MQ=255) cGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGaa > 2:1667960/1‑100 (MQ=255) 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1:304646/1‑100 (MQ=255) cGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACa > 2:2280795/1‑100 (MQ=255) ttatTTACGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCTTTGTCTGGGATAACTTAGCCCGGTTGTAGCCCTGACAGGCGCAGCGCATCAGACAACGGTTTc < 2:344941/98‑1 (MQ=25) aatTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCa < 1:2294800/100‑1 (MQ=255) atTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCag < 2:2249218/100‑1 (MQ=255) atTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGGAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCag < 2:92720/100‑1 (MQ=255) tttATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCaga < 2:989840/100‑1 (MQ=255) tttATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCaga < 2:986989/100‑1 (MQ=255) tATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGt < 2:219488/100‑1 (MQ=255) tGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTc < 1:185102/100‑1 (MQ=255) tGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTc > 1:1691905/1‑100 (MQ=255) tGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTc < 1:1640251/100‑1 (MQ=255) gTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCa > 1:998869/1‑100 (MQ=255) gTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCa < 1:2284555/100‑1 (MQ=255) tCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCaa > 2:152854/1‑100 (MQ=255) ggTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTg < 2:1496689/100‑1 (MQ=255) gTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGc < 1:849378/100‑1 (MQ=255) tGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGccc > 2:2361217‑M1/2‑100 (MQ=255) tGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGccc < 1:258534‑M1/99‑1 (MQ=255) tGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGccc > 1:225746‑M1/2‑100 (MQ=255) | GATGATGCGAAACATGGCTTTACCGTGGATGAGTTAGCGCTGGTGATGGCGGCGTTTGATACGCACCCGGAGGCGGGAAAATAATTTATGTCAGGTTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCATACATTAGCCCGGTTGTAGACCTGACAGGCGAAGCGCATCAGACAACGGTTTCAGAGTTCAATTGCCC > NC_000913/1534786‑1534981 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |