| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2700643 | 38 (0.440) | 7 (0.090) | 4/168 | NT | 15.6% | coding (356/381 nt) | acpS | holo‑[acyl‑carrier‑protein] synthase 1 |
| ? | NC_000913 | = 2700650 | 40 (0.490) | coding (349/381 nt) | acpS | holo‑[acyl‑carrier‑protein] synthase 1 | |||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
TTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTT > NC_000913/2700544‑2700742 | ttAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCAC < 2:1525356‑M1/100‑1 (MQ=255) tAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGcaca > 2:752926/1‑100 (MQ=255) aaGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTGCTTACCAGTTAGGGGGTTTTACTTTCTAAAGAGAACGGACTTATTTTTAATCTTCAATGATTACCATGGcaca > 2:1374583/1‑98 (MQ=255) aaGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑g < 1:959823/100‑1 (MQ=255) aGTTAAAAAGTAAAACCCCGTTTTCTTACCAGTTCGTGGTTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑g < 1:1894898/99‑1 (MQ=255) tttaaaaagtaaaacccccgaactggtaaggaacgggggttttactttttaaAGAGAAAGATATTATTTTTAACTTTCAATCATTATCGTCGCAAAA‑Gc > 1:2140015‑M2/53‑99 (MQ=255) gTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTATCTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑Gc > 2:354261/1‑99 (MQ=255) gTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCa > 1:702338/1‑100 (MQ=255) TTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCAt < 1:735275‑M1/100‑1 (MQ=255) tAAAAAGTAGAGGCACAGTTCCTTACTAGTTTGGGAGGTTTACTTTTTAAAGAAGACGGTATTATTTTTACATTTTAATAATGAATGTTGCACaaagat > 2:1992939/1‑95 (MQ=255) TAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATa < 2:46962‑M1/100‑1 (MQ=255) AAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAg > 2:222366‑M1/1‑100 (MQ=255) AAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAg > 1:1761642‑M1/1‑100 (MQ=255) aaaagtaaaacccccgaactggtaaggaacgggggttttactttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGt > 1:1428250‑M2/49‑100 (MQ=255) AAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTg > 1:877847‑M1/1‑100 (MQ=255) AAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGc > 1:1079681‑M1/1‑100 (MQ=255) AAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGc < 1:2269519‑M1/100‑1 (MQ=255) agtaaaacccccgaactggtaaggaacgggggttttacattttaaAGAAAAAGGTATTATTTTGAAATTTAACTAATTACCGTGGCACAA‑GCATAg > 2:478622‑M2/46‑96 (MQ=255) gtaaaacccccgaactggtaaggaacgggggttttactttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCg > 1:297289‑M2/45‑100 (MQ=255) gtaaaacccccgaactggtaaggaacgggggttttactatttaaAATCAACAGTATTATTTTTAACGTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGt > 2:1463764‑M2/45‑96 (MQ=255) TAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGc > 1:752066‑M1/1‑100 (MQ=255) TAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGc > 1:125769‑M1/1‑100 (MQ=255) AAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCt < 1:1171758‑M1/100‑1 (MQ=255) AAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCt > 1:2252983‑M1/1‑100 (MQ=255) aatcccccgttCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACtatgcttgtgccacgg < 2:999947‑M1/97‑17 (MQ=255) aaCCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACtatgcttgtgccacgg < 2:423059‑M1/99‑17 (MQ=255) aaCCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACtatgcttgtgccacgg < 1:717269‑M1/99‑17 (MQ=255) aaCCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACtatgcttgtgccacgg < 1:348104‑M1/99‑17 (MQ=255) CCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCt < 2:1137953‑M1/100‑1 (MQ=255) CCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCt > 2:754065‑M1/1‑100 (MQ=255) CGTTCCTTACCAGTTCGGGGGATTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGcc < 2:841936‑M1/100‑1 (MQ=255) gTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACTA‑TGCTTgtgccacggtaattatt > 1:1292239‑M2/1‑83 (MQ=255) GTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAATAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTg > 2:2379977‑M1/1‑97 (MQ=255) GTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCa > 1:1840247‑M1/1‑100 (MQ=255) tCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACTATGCTTtgccacggtaattattga > 1:1469228‑M2/1‑82 (MQ=255) tCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCa > 2:2050161/1‑98 (MQ=255) tCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGc < 2:702336/100‑1 (MQ=255) aCCAGTTCGGGGTTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTATCTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCATCGTTAc < 2:580739/100‑1 (MQ=255) aCCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTAc > 2:2053325/1‑100 (MQ=255) aCCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTAc > 2:1931045/1‑100 (MQ=255) ccAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACa > 1:1114835/1‑100 (MQ=255) ccAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACa > 2:1646303/1‑100 (MQ=255) gaGTTCAGGGGTGTTAATATACAAAGAGAACCGGAATATTTTTCGCTTTAAATAATTACCGTGGAACAA‑CCATAGTACCGCTCATGTGCAAGCGTTACAt < 2:352304/99‑1 (MQ=255) aGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATg < 2:740903/100‑1 (MQ=255) gTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGc < 2:181129/100‑1 (MQ=255) ttCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCa > 2:602219/1‑100 (MQ=255) cgggggttttactttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCata > 2:1547124‑M2/20‑100 (MQ=255) cgggggttttactttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCat > 1:849506‑M2/20‑99 (MQ=255) gggggttttactttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCatat > 2:2038349‑M2/19‑100 (MQ=255) gggttttactttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATAttt > 2:2373943‑M2/17‑100 (MQ=255) ggTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACTATGCTTtgccacggtaattattgaaagttaaaaataatac > 1:1810235‑M2/1‑66 (MQ=255) gttttactttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGc < 2:2176127‑M2/86‑1 (MQ=255) gttttactttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGc < 1:1581551‑M2/86‑1 (MQ=255) tttttttttttaaAGAGAACGGCATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTTCa < 2:48146‑M2/87‑1 (MQ=255) ttttactttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCa < 2:1323429‑M2/87‑1 (MQ=255) ttttactttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCa < 1:1321744‑M2/87‑1 (MQ=255) actttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GGATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGc > 2:1607711‑M2/10‑100 (MQ=255) ctttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGcc < 2:1033566‑M2/92‑1 (MQ=255) ctttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCCTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCAGACTGCGTTACATGCATATTTGCa > 2:1658263‑M2/9‑95 (MQ=255) cTTTTTAAAGAGAACGGTATTATCTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCGCCA‑GCATTGTTCCGCTCATCTGCCACCGTTACATGCATCTTTCCAACAcc > 2:1982403/1‑100 (MQ=255) tttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCCACGc > 2:2017265‑M2/8‑98 (MQ=255) tttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACg > 2:565235‑M2/8‑97 (MQ=255) tttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGccc < 2:1884654‑M2/93‑1 (MQ=255) tttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAg > 1:171891‑M2/6‑100 (MQ=255) taaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCt < 1:2181096‑M2/97‑1 (MQ=255) taaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCt > 2:1326391‑M2/4‑100 (MQ=255) taaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCt < 1:226138‑M2/97‑1 (MQ=255) agagAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCtttt > 1:1411067/1‑100 (MQ=255) gagaACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGTCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTc < 2:923148/100‑1 (MQ=255) gaACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCg < 1:1342598/100‑1 (MQ=255) gaACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCg < 1:654717/100‑1 (MQ=255) aCGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGcc > 1:1297300/1‑100 (MQ=255) gTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACaagcatagtgccacggtaattattgaaagttaaaaataataccgttctctttaaaaagtaaaacc > 1:1810235‑M1/1‑35 (MQ=255) gTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGt < 2:2149978/100‑1 (MQ=255) attattTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGttt < 2:2024813/100‑1 (MQ=255) ttattTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGtttt > 1:70109/1‑100 (MQ=255) tattTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCGCAGCTTTTCCGCCAGTTTTa < 2:1454257/100‑1 (MQ=255) attTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTaa < 1:1937619/100‑1 (MQ=255) ttAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGcc < 2:1689181/100‑1 (MQ=255) ttAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGcc < 1:1931061/100‑1 (MQ=255) tAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCt > 1:1599724/1‑100 (MQ=255) aaCTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTc > 1:1727636/1‑100 (MQ=255) aCTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGTCAGTTTTAATGCCTc > 2:1832229/1‑99 (MQ=255) aCTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCg > 1:811029/1‑100 (MQ=255) 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acaA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGt < 2:1171752/100‑1 (MQ=255) caA‑GCATAGTTCCGCTCATCTTTCATCGTTACATGCATATGGGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGtt < 1:1388480/100‑1 (MQ=255) | TTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAA‑GCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTT > NC_000913/2700544‑2700742 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |