New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3299599 = | 70 (0.820) | 16 (0.210) | 8/158 | NT | 20.2% | coding (317/444 nt) | yhbP | UPF0306 family protein |
? | NC_000913 | 3299641 = | 64 (0.840) | coding (275/444 nt) | yhbP | UPF0306 family protein |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
AATTTGATTTCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGCTGACCGTTTACCGTTCCGGCAACCGCAGCCTGCG > NC_000913/3299542‑3299740 | ggtagcgttaattcgcggtgtgcagtttaaaggtgagatccgcaggctggaaggtgaGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCt > 1:1059012‑M1/58‑100 (MQ=255) ggtagcgttaattcgcggtgtgcagtttaaaggtgagatccgcaggctggaaggtgaGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCt > 2:202827‑M1/58‑100 (MQ=255) aaTTTGATTTCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCt < 1:1844870/100‑1 (MQ=255) aTTTGATTTCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTc > 2:533366/1‑100 (MQ=255) aTTTGATTTCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTc < 2:159975/100‑1 (MQ=255) tagcgttaattcgcggtgtgcagtttaaaggtgagatccgcaggctggaaggtgaGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCa > 1:1860477‑M1/56‑100 (MQ=255) agcgttaattcgcggtgtgcagtttaaaggtgagatccgcaggctggaaggtgaGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTcan > 1:2111919‑M1/55‑99 (MQ=255) gATTTCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCt > 2:862054/1‑100 (MQ=255) aTTTCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCtt > 1:2156533/1‑100 (MQ=255) aTTTCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCtt > 1:1688338/1‑100 (MQ=255) tttCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTc > 2:1150076/1‑100 (MQ=255) ttCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTcc < 1:535763/100‑1 (MQ=255) tCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCCCGAGGTCGCCTTCCTCACCTTCCa > 2:1354076/1‑100 (MQ=255) aattcgcggtgtgcagtttaaaggtgagatccgcaggctggaaggtgaGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCa > 2:755369‑M1/49‑100 (MQ=255) cATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAg < 1:2234249/100‑1 (MQ=255) aTCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGc > 1:1705284/1‑100 (MQ=255) aTCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGc < 1:1225149/100‑1 (MQ=255) aTCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGc < 2:2187086/100‑1 (MQ=255) tCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGcc > 2:308225/1‑100 (MQ=255) tCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGcc < 2:2318482/100‑1 (MQ=255) tCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGcc < 1:89764/100‑1 (MQ=255) tCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGcc > 2:1435738/1‑100 (MQ=255) gcggtgtgtagtttaaaggtgagatccgcaggctggaaggtgaGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCt > 2:1017194‑M1/44‑99 (MQ=255) gAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTg > 2:1153946/1‑100 (MQ=255) cggtgtgcagtttaaaggtgagatccgcaggctggaaggtgaGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCt > 2:1017300‑M1/43‑98 (MQ=255) aGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGc < 2:2238621/100‑1 (MQ=255) aGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGc < 2:144507/100‑1 (MQ=255) aGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGc > 1:624683/1‑100 (MQ=255) gCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCTTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCg < 2:1467557/100‑1 (MQ=255) gCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCg > 2:1704026/1‑100 (MQ=255) cggtgtgcagtttaaaggtgagatccgcaggctggcaaccg‑GAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCgg > 1:2102766‑M1/42‑100 (MQ=255) cGGGTTTCCCACACCGGGGCCGCCAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGa < 2:1605771/100‑1 (MQ=255) cGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGa < 1:1747798/100‑1 (MQ=255) ggATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGAt > 2:287550/1‑100 (MQ=255) aTTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGAtct > 1:1495050/1‑100 (MQ=255) aTTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGAtct > 1:971590/1‑100 (MQ=255) tCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCAc > 1:396063/1‑100 (MQ=255) cacaCCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCtt < 1:2046162/100‑1 (MQ=255) cGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAAc < 1:217854/100‑1 (MQ=255) cGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAAc < 1:234888/100‑1 (MQ=255) cGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAAc < 1:270601/100‑1 (MQ=255) ggCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGc < 2:513545/100‑1 (MQ=255) ggCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGc < 1:1401666/100‑1 (MQ=255) ggCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGc < 1:2256421/100‑1 (MQ=255) ccgcaggctggaaggtgaggaaagcgacctcgcgcgcaaggcgtacaatcgtcgctttc‑CGGTTGCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACcg > 1:2102766‑M2/60‑100 (MQ=255) cAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACcg > 1:1287458/1‑100 (MQ=255) gCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACcgcg > 2:154523/1‑100 (MQ=255) gCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACcgcg < 1:2328321/100‑1 (MQ=255) aggctggaaggtgaggaaagcgacctcgcgcgcaaggcgtacaatcgtcgctttccTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTACACACcgc > 2:1017194‑M2/57‑99 (MQ=255) cATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGa > 1:1225989/1‑100 (MQ=255) aTTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGaa > 1:688678/1‑100 (MQ=255) aTTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGaa > 1:476891/1‑100 (MQ=255) tggaaggtgaggaaagcgacctcgcgcgcaaggcgtacaatcgtcgctttccTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAAtt > 2:755369‑M2/53‑100 (MQ=255) gCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACg < 1:1811694/100‑1 (MQ=255) cAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGc > 2:1684398/1‑100 (MQ=255) ntgaggaaagcgacctcgcgcgcaaggcgtacaatcgtcgctttccTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCt > 1:2111919‑M2/47‑100 (MQ=255) tgaggaaagcgacctcgcgcgcaaggcgtacaatcgtcgctttccTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTa > 1:1860477‑M2/46‑100 (MQ=255) 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aaagcgacctcgcgcgcaaggcgtacaatcgtcgctttccTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGtt > 1:1384964‑M2/41‑100 (MQ=255) aaagcgacctcgcgcgcaaggcgtacaatcgtcgctttccTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGtt > 1:2036145‑M2/41‑100 (MQ=255) AAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGttt < 1:1975888‑M1/100‑1 (MQ=255) GCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTc > 1:660511‑M1/1‑100 (MQ=255) CGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCg < 1:2334921‑M1/100‑1 (MQ=255) GACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCgg < 2:448008‑M1/100‑1 (MQ=255) ACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGc > 2:323702‑M1/1‑100 (MQ=255) ACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGc < 2:505411‑M1/100‑1 (MQ=255) ACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGc > 2:2056296‑M1/1‑100 (MQ=255) ACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGc > 2:1413855‑M1/1‑100 (MQ=255) gTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGCTGACCg > 1:352477/1‑100 (MQ=255) aCGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGCTGACCGtt > 2:38268/1‑100 (MQ=255) cGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGCTGACCGttt > 2:2143445/1‑100 (MQ=255) cGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGCTGACCGttt > 1:1330535/1‑100 (MQ=255) 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1:1941026/1‑100 (MQ=255) cgcgAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGCTGACCGTTTACCGTTCCg > 1:1080675/1‑100 (MQ=255) cgAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGCTGACCGTTTACCGTTCCGGc < 1:308227/100‑1 (MQ=255) gtcgctttccTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGCTGACCGTTTACCGTTCCGGCAAcc > 1:717490‑M2/11‑100 (MQ=255) gtcgctttccTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGCTGACCGTTTACCGTTCCGGCAAcc < 1:1435746‑M2/90‑1 (MQ=255) ccgatctcTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAATCTGCACTCCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGCTGACCGTTTACCGTTCCGGCAACCGc < 2:2035256‑M2/92‑1 (MQ=255) ccgatctcTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGCTGACCGTTTACCGTTCCGGCAACCGc < 2:2032373‑M2/92‑1 (MQ=255) ctttccTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGCTGACCGTTTACCGTTCCGGCAACCGCAg < 2:205425‑M2/94‑1 (MQ=255) ctttccTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGCTGACCGTTTACCGTTCCGGCAACCGCAg < 2:928495‑M2/94‑1 (MQ=255) ttccTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGCTGACCGTTTACCGTTCCGGCAACCGCAGcc < 2:1827618‑M2/96‑1 (MQ=255) cTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGCTGACCGTTTACCGTTCCGGCAAccgcagatcgg > 1:2035274‑M2/2‑95 (MQ=255) cTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGCTGACCGTTTACCGTTCCGGCAAccgcagatcgg > 1:2032391‑M2/2‑95 (MQ=255) cTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGCTGACCGTTTACCGTTCCGGCAACCGCAGCCtgn < 1:684683‑M2/99‑2 (MQ=255) tCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGCTGACCGTTTACCGTTCCGGCAACCGCAGCCTGc > 2:1355262/1‑99 (MQ=255) tCACCCTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGCTGACCGTTTACCGTTCCGGCAACCGCAGCCTGCg < 2:129299/100‑1 (MQ=255) | AATTTGATTTCATCGAGCCGGATTTCCCACACCGGGGCCGACAGCATTCTGGCAACCGGAAAGCGACGATTGTACGCCTTGCGCGCGAGGTCGCTTTCCTCACCTTCCAGCCTGCGGATCTCACCTTTAAACTGCACACCGCGAATTAACGCTACCGTTTTCGGCTGACCGTTTACCGTTCCGGCAACCGCAGCCTGCG > NC_000913/3299542‑3299740 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |