| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3898636 | NA (NA) | 20 (0.160) | 9/162 | NT | NA | noncoding (6/26 nt) | REP282 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP282 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 3898650 | NA (NA) | noncoding (20/26 nt) | REP282 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP282 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
TGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGC > NC_000913/3898537‑3898734 | tggtCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGA < 1:915867‑M1/100‑1 (MQ=255) ggtCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAg > 2:2949708/1‑100 (MQ=255) ggtCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAg > 2:512884/1‑100 (MQ=255) aTTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTa < 2:1972868/100‑1 (MQ=255) aTTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTa < 1:2045884/100‑1 (MQ=255) ttGTCAGGGGTATCTCTTCCGCGGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGTGCGTa < 1:1561626/99‑1 (MQ=255) tGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAAt < 1:1196502/100‑1 (MQ=255) cAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTca < 1:307468/100‑1 (MQ=255) cAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTca < 1:1982527/100‑1 (MQ=255) gggTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTcaca > 2:2828264/1‑100 (MQ=255) gggTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTcaca > 2:3321820/1‑100 (MQ=255) ggTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTcacac > 2:3590594/1‑100 (MQ=255) gTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATCcacaca > 1:2496286/1‑100 (MQ=255) tATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtc > 1:2921404‑M2/1‑98 (MQ=255) tctcTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGCCTGTGGGGTGACTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGCGACCAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtccg < 2:2286999‑M2/100‑5 (MQ=255) tctcTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtccg > 1:1673697‑M2/1‑96 (MQ=255) ctctTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtccgg > 2:3353152‑M2/1‑95 (MQ=255) ctctTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtccgg > 2:2570335‑M2/1‑95 (MQ=255) ctctTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtccgg < 1:1740346‑M2/100‑6 (MQ=255) ctTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAtgtgtgaattacgctccggcc < 1:1147419‑M1/100‑22 (MQ=255) ctTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtccggcc > 1:549565‑M2/1‑93 (MQ=255) ctTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCGGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGTCCGGAtgtgtgaattacgctccggcc < 1:2330989‑M1/100‑22 (MQ=255) ttCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTTTTTTTTTTTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTGATTCACACAtccggc < 2:2321738‑M2/98‑7 (MQ=255) tCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAtgtgtgaattacgctccggcctg < 1:2180542‑M1/100‑24 (MQ=255) tCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAtgtgtgaattacgctccggcctg < 1:3196148‑M1/100‑24 (MQ=255) tCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAtgtgtgaattacgctccggcctg < 2:358515‑M1/100‑24 (MQ=255) tCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCtt > 2:1284534/1‑100 (MQ=255) ccGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAtgtgtgaattacgctccggcctgt < 2:2758434‑M1/100‑25 (MQ=255) cGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTAt > 1:1489461/1‑100 (MQ=255) gCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTAtt > 2:1018126/1‑100 (MQ=255) tGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGACCAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTc < 2:2050531/100‑1 (MQ=255) gTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCt > 1:795728/1‑100 (MQ=255) tctcCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCATACATCCGGCCTTATTTCtt < 1:1364515/100‑1 (MQ=255) ccACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAg > 1:3136472/1‑100 (MQ=255) ccACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAg > 1:3556214/1‑100 (MQ=255) cACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAtgtgtgaattacgctccggcctgttctcattatt < 1:766471‑M1/100‑35 (MQ=255) cTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCtt > 1:33132/1‑100 (MQ=255) gCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCg < 2:3796522/100‑1 (MQ=255) gCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTg < 1:1389031/100‑1 (MQ=255) gCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTg < 1:505619/100‑1 (MQ=255) gagaCTGTGGGGTGATTTTTCGTAATTATTTAAATCATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTATCCGAATCCTa < 2:3530230/100‑1 (MQ=255) gaCTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAAt < 1:3507159/100‑1 (MQ=255) gaCTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAAt > 1:286077/1‑100 (MQ=255) tgtgGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCt > 1:2260766/1‑100 (MQ=255) ggggTGATTTTTTTTTTTTTTTTAAATAATGAGAACAGGCCGGATCGTAATTCATACATCCGGCTTTATTTCTTGAGCTTAACCGAGTGCTAATTCt > 2:318408/1‑97 (MQ=255) ggggTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCg < 1:1891821/100‑1 (MQ=255) ggggTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCg < 2:2706111/100‑1 (MQ=255) gggTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCgg < 1:1117504/100‑1 (MQ=255) gggTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCg > 2:1575933/1‑99 (MQ=255) ttttCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCggn < 2:3646874/100‑2 (MQ=255) tttCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCt < 1:967618/100‑1 (MQ=255) tttCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCt < 2:3039555/100‑1 (MQ=255) cGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTa < 2:2734506/100‑1 (MQ=255) gTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTa < 2:310813/99‑1 (MQ=255) tAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATc < 1:2849613/100‑1 (MQ=255) gTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAg < 1:3408236/100‑1 (MQ=255) aTTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTagatcgga > 1:1600348/1‑93 (MQ=255) aTTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGa < 2:818616/100‑1 (MQ=255) 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aaaTAATGAGAACAGGTCGGAGCGTAATTCACACACGCGGCCTGATTTCTTAAGCTTAGCCGAGTGCTATTGCTGCGGCAGCGGGTTTATCAGCGATTAc < 2:1431059/100‑1 (MQ=255) aaaTAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTAc < 2:39251/100‑1 (MQ=255) aaaTAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATACGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTa > 2:1337145/1‑99 (MQ=255) aataatGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTAcc < 1:266766/100‑1 (MQ=255) aataatGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCAAACGtcaggcctgttctcattatttaaataactacgaaacatcaccccacagtctcagcgtgccgcagta < 2:2513347‑M2/100‑67 (MQ=255) ataatGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCa < 2:1712118/100‑1 (MQ=255) ataatGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTATTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGGGATTACCa > 2:2964310/1‑100 (MQ=255) taatGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtgga < 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2:3416648‑M2/100‑79 (MQ=255) aGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGATTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCTGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGa > 2:2089079/1‑100 (MQ=255) ggCCGGAtgtgtgaattacgctccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacagcggaag > 2:3570388‑M1/1‑7 (MQ=255) ggCCGGAGCGTAATTCACACAtccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacagcggaag < 1:3670629‑M2/100‑80 (MQ=255) ggCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAgaga > 2:2471933/1‑97 (MQ=255) ggCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCATTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGAt < 2:847568/100‑1 (MQ=255) ccGGAtgtgtgaattacgctccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacagcggaagag < 1:1075053‑M1/100‑96 (MQ=255) cGGAtgtgtgaattacgctccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacagcggaagaga < 1:909615‑M1/100‑97 (MQ=255) ggAtgtgtgaattacgctccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacagcggaagagat < 1:1328408‑M1/100‑98 (MQ=255) ggAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAg < 1:1284484/100‑1 (MQ=255) ggAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAg > 1:3812778/1‑100 (MQ=255) gAtgtgtgaattacgctccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcagtggagacagcggaagagata < 1:731030‑M1/100‑99 (MQ=255) gAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGc < 2:1534834/100‑1 (MQ=255) | TGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGC > NC_000913/3898537‑3898734 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |