| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3898636 | NA (NA) | 20 (0.160) | 9/162 | NT | NA | noncoding (6/26 nt) | REP282 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP282 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 3898650 | NA (NA) | noncoding (20/26 nt) | REP282 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP282 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
GTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCT > NC_000913/3898551‑3898749 | gTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTcacaca > 1:1155106/1‑100 (MQ=255) tctcTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGCCTGTGGGGTGACTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGCGACCAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtccg < 2:2286999‑M2/100‑5 (MQ=255) ctctTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtccgg > 2:2570335‑M2/1‑95 (MQ=255) ctctTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtccgg > 2:3353152‑M2/1‑95 (MQ=255) ctTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtccggcc > 2:3570388‑M2/1‑93 (MQ=255) tCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTTTTTTTTTTTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCtt > 2:707319/1‑100 (MQ=255) tCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCtt > 2:1284534/1‑100 (MQ=255) tGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGACCAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTc < 2:2050531/100‑1 (MQ=255) gTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCt < 2:1706672/100‑1 (MQ=255) tctcCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCATACATCCGGCCTTATTTCtt < 1:1364515/100‑1 (MQ=255) tctcCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCtt < 2:2406229/100‑1 (MQ=255) ctcCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTa > 1:1466085/1‑100 (MQ=255) ctcCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTa < 2:356617/100‑1 (MQ=255) cctcTGCGGCAAGCTGACACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCTGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCCTAAg < 2:3311603/97‑1 (MQ=255) ccACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAg > 1:3556214/1‑100 (MQ=255) ccACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAg > 1:1251402/1‑100 (MQ=255) gCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTaa > 1:1980990/1‑100 (MQ=255) gCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCg < 2:3796522/100‑1 (MQ=255) gCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTg < 1:1389031/100‑1 (MQ=255) gCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTg < 1:505619/100‑1 (MQ=255) gagaCTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTa > 1:627186/1‑100 (MQ=255) gagaCTGTGGGGTGATTTTTCGTAATTATTTAAATCATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTATCCGAATCCTa < 2:3530230/100‑1 (MQ=255) aCTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAAtt > 1:837362/1‑100 (MQ=255) aCTGTGGGGTGATTTCTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAAtt > 2:362554/1‑100 (MQ=255) tgtgGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCt > 1:2260766/1‑100 (MQ=255) ggggTGATTTTTTTTTTTTTTTTAAATAATGAGAACAGGCCGGATCGTAATTCATACATCCGGCTTTATTTCTTGAGCTTAACCGAGTGCTAATTCt > 2:318408/1‑97 (MQ=255) ggggTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCg < 1:2854052/100‑1 (MQ=255) gggTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCgg < 1:1117504/100‑1 (MQ=255) gTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCa < 1:896889/100‑1 (MQ=255) gATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGc > 1:2823994/1‑100 (MQ=255) gATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGc > 1:1573161/1‑100 (MQ=255) tttttCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCgg < 2:2958933/100‑1 (MQ=255) ttttCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCggn < 2:3646874/100‑2 (MQ=255) tttCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCt < 2:3039555/100‑1 (MQ=255) tttCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCt < 1:967618/100‑1 (MQ=255) tccgatctATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCttt < 2:1600338/93‑1 (MQ=255) cGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGTGGCAGCGGCTTTa > 1:3043109/1‑100 (MQ=255) cGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTa < 1:1730415/100‑1 (MQ=255) gTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTa < 2:310813/99‑1 (MQ=255) aGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTAtaa < 1:2584965/100‑3 (MQ=255) gTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAg < 1:3409749/100‑1 (MQ=255) tATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCg < 2:2650079/100‑1 (MQ=255) tATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCGTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCg > 2:2835970/1‑100 (MQ=255) aTTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTagatcgga > 1:1600348/1‑93 (MQ=255) aTTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGa < 2:818616/100‑1 (MQ=255) ttAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGAtt < 2:3344185/100‑1 (MQ=255) ttAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGAtt < 1:2743342/100‑1 (MQ=255) tAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACAtccggcctgttctcattatttaaataactacgaaaaatcaccccacagtctcagcttgccgcag < 2:1975513‑M2/100‑65 (MQ=255) tAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTa > 2:1802009/1‑100 (MQ=255) tAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTa > 1:980322/1‑100 (MQ=255) tAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTa > 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1:1052156/1‑100 (MQ=255) ttCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAacac < 1:1018135/100‑1 (MQ=255) tCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACg < 1:2934559/100‑1 (MQ=255) tCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACg > 1:3011391/1‑100 (MQ=255) tCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACg < 2:1881524/100‑1 (MQ=255) tCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACg < 2:1735155/100‑1 (MQ=255) cacacaTGCGGACTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCAATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACgg > 2:2003701/1‑100 (MQ=255) cacacaTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACgg > 1:1501090/1‑100 (MQ=255) cacacaTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACgg > 2:126969/1‑100 (MQ=255) cacacaTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACg < 1:281062/99‑1 (MQ=255) caTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCGACACGGAAGc > 1:2028708/1‑100 (MQ=255) caTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGc > 1:1345626/1‑100 (MQ=255) aTCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCt < 1:577165/100‑1 (MQ=255) | GTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCT > NC_000913/3898551‑3898749 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |