| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4635629 | 155 (1.130) | 6 (0.050) | 4/166 | NT | 3.8% | coding (109/474 nt) | creA | putative periplasmic protein |
| ? | NC_000913 | = 4635693 | 161 (1.260) | coding (173/474 nt) | creA | putative periplasmic protein | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
GCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCGGTGGTATTAAAGGGGGATTG > NC_000913/4635532‑4635727 | cATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATc < 1:2033344/100‑1 (MQ=255) tGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACaa > 1:222283/1‑100 (MQ=255) tCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAAt < 2:3410117/100‑1 (MQ=255) tGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATCTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAAttgt > 2:2955080/1‑100 (MQ=255) gTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCTGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAAttgtt < 2:905359/100‑1 (MQ=255) tCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAAttgttg < 1:239581/100‑1 (MQ=255) tCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAAttgttg < 1:2131818/100‑1 (MQ=255) tCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAAttgttg < 1:1461511/100‑1 (MQ=255) tCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAAttgttg < 1:727992/100‑1 (MQ=255) tttAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTtgtg < 1:3505873/100‑1 (MQ=255) tttAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTtgtg < 1:381445/100‑1 (MQ=255) tttAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTtgtg < 1:2642331/100‑1 (MQ=255) tttAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTtgtg < 2:332268/100‑1 (MQ=255) tttAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTtgtg < 1:1085673/100‑1 (MQ=255) tAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTgg > 1:1531442/1‑99 (MQ=255) aGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAg < 2:147709/100‑1 (MQ=255) gCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACACAATTGTTGTGGAAGc > 2:2856459/1‑100 (MQ=255) gATAATGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTCGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCttt < 2:2448716/100‑1 (MQ=255) tAATGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTtga < 1:579353/100‑1 (MQ=255) tAATGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTtga < 1:3037475/100‑1 (MQ=255) aaTGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTtgat > 2:2527482/1‑100 (MQ=255) aTGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTtgatg > 1:173030/1‑100 (MQ=255) tGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGACTTtgatga > 2:1578600/1‑100 (MQ=255) tGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATcc < 1:1841166/100‑1 (MQ=255) tGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATcc > 2:2482886/1‑100 (MQ=255) tGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATcc < 1:1148044/100‑1 (MQ=255) ggggCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATccc > 1:451264/1‑100 (MQ=255) ggCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGa < 2:2105435/100‑1 (MQ=255) gCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGAt < 2:768803/100‑1 (MQ=255) ccATTGGCTCATGCAGAAGAGATTCGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGAtg < 2:3639086/100‑1 (MQ=255) cATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGAtgt > 2:2216926/1‑100 (MQ=255) aTTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGAtgtg < 2:3691259/100‑1 (MQ=255) ttGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGCTGATCCCGATGTGa > 2:3136816/1‑100 (MQ=255) gCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGaaaa < 1:3225450/100‑1 (MQ=255) cTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGaaaaa > 1:3388819/1‑100 (MQ=255) cATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATg > 2:2164707/1‑100 (MQ=255) aTGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGt > 1:1005410/1‑100 (MQ=255) tGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTc > 1:96037/1‑100 (MQ=255) gCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCa > 1:491198/1‑100 (MQ=255) cAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCAc > 1:906741/1‑100 (MQ=255) cAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCAc < 1:397116/100‑1 (MQ=255) cAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCAc < 1:1640520/100‑1 (MQ=255) agaagaGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCAcc < 2:3208135/100‑1 (MQ=255) agaagaGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCAcc > 1:1296008/1‑100 (MQ=255) agaagaGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCAcc > 2:1709443/1‑100 (MQ=255) aagaGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTg < 2:1531432/100‑1 (MQ=255) agagATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATGGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGt < 1:2679894/100‑1 (MQ=255) agagATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGt > 2:412904/1‑100 (MQ=255) agagATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGt < 1:2434012/100‑1 (MQ=255) gaTTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTan < 2:107373/100‑2 (MQ=255) gaTTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTAt < 1:2317860/100‑1 (MQ=255) gaTTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTAt > 2:1187117/1‑100 (MQ=255) aTTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTAtg < 1:2604410/100‑1 (MQ=255) tGGTTCGTTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTAtg < 2:527342/98‑1 (MQ=255) gTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAg > 1:2445220/1‑100 (MQ=255) gTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGAACACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAg > 2:2040463/1‑100 (MQ=255) ggTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGccgg > 1:1040629‑M2/1‑96 (MQ=255) ggTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGccgg < 2:3026141‑M2/100‑5 (MQ=255) ggTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGccgg < 1:211247‑M2/100‑5 (MQ=255) tCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGccgggn > 2:35724‑M2/1‑94 (MQ=255) tCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGccgggc > 2:297013‑M2/1‑94 (MQ=255) tCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGccgggc > 1:3328079‑M2/1‑94 (MQ=255) cGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGctcacataacaggtgacatttttcacatcgggatcatcaaaggcttccacaacaattttgtgatccgggcc < 2:2164516‑M1/100‑72 (MQ=255) cGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCg > 2:2701882/1‑100 (MQ=255) acCGTATTTAAAATGATCGGCTCGGATCACAAACTTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGaaaa > 2:2468683/1‑100 (MQ=255) ccGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAAc > 1:360681/1‑100 (MQ=255) tttAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCggtg < 1:3060280/100‑1 (MQ=255) tttAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCggtg > 1:2718401/1‑100 (MQ=255) tttAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCggtg > 2:177804/1‑100 (MQ=255) tttAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCggtg > 2:981176/1‑100 (MQ=255) ttAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCggtgg > 1:1233804/1‑100 (MQ=255) ttAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCggtgg > 1:3318935/1‑100 (MQ=255) ttAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCggtgg < 1:1175987/100‑1 (MQ=255) tAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCggtggt < 2:3311517/100‑1 (MQ=255) tAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCggtgg < 2:1231010/99‑1 (MQ=255) tAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCggtgg > 2:2567718/1‑99 (MQ=255) aaaaTGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCGGTGGTa > 2:328975/1‑100 (MQ=255) aaaTGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCGGTGGTAt < 2:2785323/100‑1 (MQ=255) aaaTGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCGGTGGTAt > 1:2814833/1‑100 (MQ=255) aaaTGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCGGTGGTAt > 2:666690/1‑100 (MQ=255) aaTGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCGGTGGTAtt > 1:3418176/1‑100 (MQ=255) gATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCGGTGGTATTaaa > 1:2910038/1‑100 (MQ=255) gATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCGGTGGTATTaaa < 2:3561510/100‑1 (MQ=255) tCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGccgggccgatcattttaaatacggtgt < 1:1660676‑M2/100‑28 (MQ=255) tCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCGGTGGTATTaaaag > 1:1969158/1‑98 (MQ=255) tCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCGGTGGTATTAAAgg > 2:2813336/1‑100 (MQ=255) tCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTGTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCGGTGGTATTAAAgg < 2:3378096/100‑1 (MQ=255) ggCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGccgggccgatcattttaaatacggtgtcg < 1:1489092‑M2/100‑30 (MQ=255) ggCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGccgggccgatcattttaaatacggtgtcg < 1:2034972‑M2/100‑30 (MQ=255) ggCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCGGTGGTATTAAAgggg < 1:2882169/100‑1 (MQ=255) gCCCGGctcacataacaggtgacatttttcacatcgggatcatcaaaggcttccacaacaattttgtgatccgggccgatcattttaaatacggtgtcga > 2:2020292‑M1/1‑6 (MQ=255) gCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGccgggccgatcattttaaatacggtgtcg < 1:755425‑M2/99‑30 (MQ=255) gCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCGGTGGTATTAAAggggg > 1:3460309/1‑100 (MQ=255) cccGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGCTGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCGGTGGTATTAAAggggg > 2:1564504/1‑99 (MQ=255) ccGGctcacataacaggtgacatttttcacatcgggatcatcaaaggcttccacaacaattttgtgatccgggccgatcattttaaatacggtgtcgacc < 1:3480546‑M1/100‑97 (MQ=255) cGGctcacataacaggtgacatttttcacatcgggatcatcaaaggcttccacaacaattttgtgatccgggccgatcattttaaatacggtgtcgaccg > 2:1733519‑M1/1‑3 (MQ=255) cGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCGGTGGTATTAAAGGGGGAtt < 1:3303644/100‑1 (MQ=255) cGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCGGTGGTATTAAAGGGGGAtt > 2:3778012/1‑100 (MQ=255) ggctcacataacaggtgacatttttcacatcgggatcatcaaaggcttccacaacaattttgtgatccgggccgatcattttaaatacggtgtcgaccga < 2:3553475‑M1/100‑99 (MQ=255) ggATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCGGTGGTATTAAAGGGGGATTg > 2:892869/1‑100 (MQ=255) | GCATTTGATCCTGTCTTTAAGCCTGATAATGCTGGGGCCATTGGCTCATGCAGAAGAGATTGGTTCGGTCGACACCGTATTTAAAATGATCGGCCCGGATCACAAAATTGTTGTGGAAGCCTTTGATGATCCCGATGTGAAAAATGTCACCTGTTATGTGAGCCGGGCGAAAACCGGTGGTATTAAAGGGGGATTG > NC_000913/4635532‑4635727 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |