| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4629147 | 133 (0.970) | 14 (0.110) | 7/168 | NT | 9.9% | coding (1376/1668 nt) | ettA | energy‑dependent translational throttle A |
| ? | NC_000913 | = 4629161 | 128 (0.990) | coding (1362/1668 nt) | ettA | energy‑dependent translational throttle A | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
CAGGGCGTTTTCCAGCGCGCGCAGGGTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGCCAACGTAGGCGCGGCTTGGCA > NC_000913/4629062‑4629258 | cagGGCGTTTTCCAGCGCGCGCAGGGTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGa > 1:3246199/1‑100 (MQ=255) gggCGTTTTCCAGCGCGCGCAGGGTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCATCAGCTTCGCCAGAtg < 1:3758726‑M2/100‑3 (MQ=255) gggCGTTTTCCAGCGCGCGCAGGGTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGAtg < 1:1034241‑M2/100‑3 (MQ=255) ggCGTTTTCCAGCGCGCGCAGGGTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGAtgc < 2:1455807‑M2/100‑4 (MQ=255) ggCGTTTTCCAGCGCGCGCAGGGTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGAtgc > 1:3438436‑M2/1‑97 (MQ=255) gCGTTTTCCAGCGCGCGCAGGGTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGAtgca < 2:2269014‑M2/100‑5 (MQ=255) gCGTTTTCCAGCGCGCGCAGGGTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGAtgca > 1:3818609‑M2/1‑96 (MQ=255) gctttccAGCCCGCGCAGGGTTTCGATATCCAGCTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTTCAGCAGCTTCGCCAGAtgcag > 2:1265238‑M2/3‑94 (MQ=255) gTTTTCCAGCGCGCGCAGGGTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAga > 1:1441218/1‑100 (MQ=255) gTTTTCCAGCGCGCGCAGGGTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTGGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAga < 2:1087409/100‑1 (MQ=255) ccAGCGCGCGCAGGGTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGAcc > 1:2021168/1‑100 (MQ=255) ccAGCGCGCGCAGGGTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGAcc > 2:511101/1‑100 (MQ=255) aGCGCGCGCAGGGTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACcgc > 2:2099747/1‑100 (MQ=255) cgcgcgcAGGGTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCgcgc < 2:515562/100‑1 (MQ=255) cgcgcAGGGTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTc < 2:2668081/100‑1 (MQ=255) gcAGGGTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTcacc < 1:652325/100‑1 (MQ=255) gggTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCaccacc > 2:288516/1‑100 (MQ=255) gggTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCaccacc < 2:2547282/100‑1 (MQ=255) gggTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCaccacc < 1:909539/100‑1 (MQ=255) ggTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCg > 2:1594699/1‑100 (MQ=255) gTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCgg < 2:788789/100‑1 (MQ=255) gTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCgg > 2:3013650/1‑100 (MQ=255) gTTTCGATATCCAGGTCGTCGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCgg > 2:3508677/1‑100 (MQ=255) tttCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGga > 1:2076585/1‑100 (MQ=255) ttCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGgag < 1:180624/100‑1 (MQ=255) ttCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGgag < 2:3133026/100‑1 (MQ=255) ttCGAGATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCGGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGgag < 2:2018931/100‑1 (MQ=255) tCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGgaga < 2:2420469/100‑1 (MQ=255) gATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGt < 2:1379319/100‑1 (MQ=255) atatCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGtt > 1:1202620/1‑100 (MQ=255) tatCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTc < 2:456122/100‑1 (MQ=255) tCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCAc < 2:3215754/100‑1 (MQ=255) ccAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCAcc < 2:152168/100‑1 (MQ=255) caaGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCAcc > 1:2584395/3‑100 (MQ=255) aGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCaa < 1:3013672/100‑1 (MQ=255) gTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCaag > 2:2312748/1‑98 (MQ=255) gttggttgGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGt < 1:201802/100‑1 (MQ=255) gttggtggGGTCGTCGATCAGCATCATGTTTCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGt < 1:703487/100‑1 (MQ=255) ttggttggTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGtt < 1:785641/100‑1 (MQ=255) ggttggttCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGATCACCAAcgcg > 2:3536106/1‑96 (MQ=255) gttggttTGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTa > 2:2588179/1‑99 (MQ=255) gttggttCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTAc > 2:1704510/1‑100 (MQ=255) gttggttCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTAc < 2:2465751/100‑1 (MQ=255) tggttCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCCCCGGAGAGTTCCCCAACGCGTTTAccc < 2:3633663/100‑1 (MQ=255) tggttCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTAccc < 1:3122512/100‑1 (MQ=255) ggttCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCt > 1:2907064/1‑100 (MQ=255) gttCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTg > 1:1659413/1‑100 (MQ=255) ttCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGa > 2:300680/1‑100 (MQ=255) cgtcgAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATc < 2:2377774/100‑1 (MQ=255) tcgAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCaa > 2:2051088/1‑100 (MQ=255) tcgAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCaa > 2:2160754/1‑100 (MQ=255) cgAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAAc < 1:2699786/100‑1 (MQ=255) gAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAAcc < 2:2302295/100‑1 (MQ=255) gcagcagcaTGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAAcccc < 1:1734345/100‑1 (MQ=255) gcagcagcaTGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAAcccc > 2:274052/1‑100 (MQ=255) ctgctgcaGGTTGGCGGCAACATGCTGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAAccc > 2:258137/6‑98 (MQ=37) gcagcaTGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCttt < 2:3355994/100‑1 (MQ=255) agcaTGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTttaa < 1:2986210/100‑1 (MQ=255) agcaTGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTttaa > 2:113978/1‑100 (MQ=255) agcaTGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTttaa > 1:3559243/1‑100 (MQ=255) caTGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTttaaag < 1:1090559/100‑1 (MQ=255) caTGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTttaaag < 2:1492579/100‑1 (MQ=255) caTGTTGCCACCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTttaaag < 1:2422091/100‑1 (MQ=255) gTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTTACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTttaaagtta > 1:1350901/1‑100 (MQ=255) gTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTttaaagtta > 2:2951779/1‑100 (MQ=255) gTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTttaaagtta > 1:424056/1‑100 (MQ=255) ttGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTttaaagttaa > 2:1952029/1‑100 (MQ=255) tGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGGGTTTACTCTGATCAACCACTttaaagttaaa > 2:3757688/1‑100 (MQ=255) tGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTttaaagttaaa < 2:216991/100‑1 (MQ=255) gccAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGAtgcaggttggcggcaacatgctgctgctcgacgaaccaaccaacgacctggatatcgaaaccctgcgcgcgctgg < 1:2226749‑M2/100‑76 (MQ=255) gccAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGAtgcaggttggcggcaacatgctgctgctcgacgaaccaaccaacgacctggatatcgaaaccctgcgcgcgctg < 1:1778130‑M2/99‑75 (MQ=255) gccAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCgg > 1:1185179/1‑100 (MQ=255) gccAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCgg > 1:3090006/1‑100 (MQ=255) ccAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGAtgcaggttggcggcaacatgctgctgctcgacgaaccaaccaacgacctggatatcgaaaccctgcgcgcgctgga < 1:955113‑M2/100‑77 (MQ=255) ccAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGc < 1:3770651/100‑1 (MQ=255) ccAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGc > 1:3464924/1‑100 (MQ=255) cAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGcc < 1:334579/100‑1 (MQ=255) cAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGcc < 2:3342228/100‑1 (MQ=255) aaCCTGCAGCAGCTTCGCCAGAtgcaggttggcggcaacatgctgctgctcgacgaaccaaccaacgacctggatatcgaaaccctgcgcgcgctggaaa < 1:1993288‑M2/100‑79 (MQ=255) aaCCTGCAGCAGCTTCGCCAGAtgcaggttggcggcaacatgctgctgctcgacgaaccaaccaacgacctggatatcgaaaccctgcgcgcgctggaaa < 1:1993264‑M2/100‑79 (MQ=255) ccTGCAGCAGCTTCGCCAGAtgcaggttggcggcaacatgctgctgctcgacgaaccaaccaacgacctggatatcgaaaccctgcgcgcgctggaaaac < 2:1713898‑M2/100‑81 (MQ=255) ccTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGCCAAc > 2:3066652/1‑100 (MQ=255) ccTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGCCAAc < 1:3501960/100‑1 (MQ=255) cTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGCCAACg > 1:1851321/1‑100 (MQ=255) gcagcaGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGCCAACGTa > 1:3534922/1‑100 (MQ=255) gcagcaGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGCCAACGTa < 1:2483023/100‑1 (MQ=255) agcagcTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGCCAACGTAgg > 2:3775180/1‑100 (MQ=255) gcTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGCCAACGTAGGcgcg < 1:254507/100‑1 (MQ=255) gcTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGCCAACGTAGGcgcg > 2:434867/1‑100 (MQ=255) cTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGCCAACGTAGGCGCgg < 1:3595332/100‑1 (MQ=255) ttCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGCCAACGTAGGcgcg < 2:621653/98‑1 (MQ=255) ttCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGCCAACGTAGGCGCGGc > 1:561105/1‑100 (MQ=255) tCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGCCAACGTAGGCGCGGCt > 1:2798171/1‑100 (MQ=255) cGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGCCAACGTAGGCGCGGCtt < 1:2830695/100‑1 (MQ=255) gtcAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGCCAACGTAGGCGCGGCTTg > 2:1278013/3‑100 (MQ=255) ccAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGCCAACGTAGGCGCGGCTTgg < 1:45579/100‑1 (MQ=255) ccAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGCCAACGTAGGCGCGGCTTgg < 2:1413458/100‑1 (MQ=255) ccAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGCCAACGTAGGCGCGGCTTgg < 2:3166833/100‑1 (MQ=255) cAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGCCAACGTAGGCGCGGCTTGGc < 1:2631163/100‑1 (MQ=255) aGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGCCAACGTAGGCGCGGCTTGGCa < 1:1223183/100‑1 (MQ=255) | CAGGGCGTTTTCCAGCGCGCGCAGGGTTTCGATATCCAGGTCGTTGGTTGGTTCGTCGAGCAGCAGCATGTTGCCGCCAACCTGCAGCAGCTTCGCCAGATGCAGACGACCGCGCTCACCACCGGAGAGTTCACCAACGCGTTTACCCTGATCAACCCCTTTAAAGTTAAAGCGGCCAACGTAGGCGCGGCTTGGCA > NC_000913/4629062‑4629258 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |