| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3852834 = | 107 (1.140) | 19 (0.230) | 11/156 | NT | 18.2% | intergenic (‑50/+56) | ilvB/ivbL | acetolactate synthase 2 large subunit/ilvB operon leader peptide |
| ? | NC_000913 | 3852867 = | 77 (0.940) | intergenic (‑83/+23) | ilvB/ivbL | acetolactate synthase 2 large subunit/ilvB operon leader peptide | |||||
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
CTGCGCCGGTAAAGCGCTTACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGACCA > NC_000913/3852736‑3852933 | cTGCGCCGGTAAAGCGCTTACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGaaa > 1:88996/1‑100 (MQ=255) tGCGCCGGTAAAGCGCTTACGCGTAGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGaaaa > 1:360757/1‑100 (MQ=255) gcgcCGGTAAAGCGCTTACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGaaaaa > 2:486648/1‑100 (MQ=255) cgcCGGTAAAGCGCTTACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑c < 1:72979/100‑1 (MQ=255) cgcCGGTAAAGCGCTTACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑c > 1:1211794/1‑100 (MQ=255) tactaccaactgcgccatccgccgcagtggtcgtcgtgcgtgtggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAA‑cc > 2:1285844‑M1/95‑100 (MQ=255) gcCGGTAAAGCGCTTACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑cc > 2:985805/1‑100 (MQ=255) gcCGGTAAAGCGCTTACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑cc < 2:805567/100‑1 (MQ=255) gcCGGTAAAGCGCTTACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑cc < 2:1190907/100‑1 (MQ=255) gcCGGTAAAGCGCTTACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑cc < 1:1866119/100‑1 (MQ=255) ncGGTAAAGCGCTTACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑ccc > 2:531017/2‑100 (MQ=255) ccGGTAAAGCGCTTACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCAAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTCAACGAAAAA‑ccc > 1:1108983/1‑100 (MQ=255) ctaccaactgcgccatccgccgcagtggtcgtcgtgcgtgtggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAA‑cccc < 1:505462‑M1/8‑1 (MQ=255) accaactgcgccatccgccgcagtggtcgtcgtgcgtgtggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAA‑Ccccgc < 1:2033962‑M1/10‑1 (MQ=255) accaactgcgccatccgccgcagtggtcgtcgtgcgtgtggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAA‑Ccccgc > 1:351084‑M1/91‑100 (MQ=255) accaactgcgccatccgccgcagtggtcgtcgtgcgtgtggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAA‑Ccccgc < 1:473918‑M1/10‑1 (MQ=255) ccaactgcgccatccgccgcagtggtcgtcgtgcgtgtggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAA‑Ccccgcc > 2:2047947‑M1/90‑100 (MQ=255) ccaactgcgccatccgccgcagtggtcgtcgtgcgtgtggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAA‑Ccccgcc > 1:1067874‑M1/90‑100 (MQ=255) aGCGCTTACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCgg > 2:2100186/1‑100 (MQ=255) aGCGCTTACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCgg < 2:2600654/100‑1 (MQ=255) aGCGCTTACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCACGCCCgg > 1:1169994/1‑100 (MQ=255) gcgcTTACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGt < 1:977790/100‑1 (MQ=255) ggttACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCCACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGttt < 2:1061389/98‑1 (MQ=255) cTTACGCTTCGATCTTTTGCCCGACCTTTCCATGCTCCAGTCCTTTTCATCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTg < 2:640954/100‑1 (MQ=255) ttACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTgc < 1:42903/100‑1 (MQ=255) tACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTgcg < 1:1490576/100‑1 (MQ=255) cgcgTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGcc > 1:1042631/1‑100 (MQ=255) cgcgTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGcc > 1:1299737/1‑100 (MQ=255) gcgTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCcg < 2:830149/100‑1 (MQ=255) cGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCcggcgg < 1:851706/100‑1 (MQ=255) cgcagtggtcgtcgtgcgtgtggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCggg > 1:973139‑M1/73‑100 (MQ=255) cgcagtggtcgtcgtgcgtgtggtggtggtcggcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCggg > 2:2428308‑M1/73‑100 (MQ=255) gcagtggtcgtcgtgcgtgtggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCgggg > 1:1198597‑M1/72‑100 (MQ=255) gcagtggtcgtcgtgcgcggggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCgggg > 2:2192617‑M1/72‑100 (MQ=255) gtggtcgtcgtgcgtgtggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGttt > 1:1521165‑M1/69‑100 (MQ=255) gtgCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTg > 2:1956210/1‑100 (MQ=255) gtgCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTg < 1:1144536/100‑1 (MQ=255) ggtcgtcgtgcgtgtggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaccaacacacgattccAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTg > 2:1793450‑M1/67‑100 (MQ=255) tgCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTgg < 2:1674023/100‑1 (MQ=255) tgCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTgg < 2:450755/100‑1 (MQ=255) gtcgtcgtgcgtgtggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTg > 1:1836601‑M1/66‑99 (MQ=255) tcgtcgtgcgtgtggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGa > 2:2527636‑M1/65‑100 (MQ=255) tcgtcgtgcgtgtggtggtggacgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTg > 2:1486876‑M1/65‑98 (MQ=255) gCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGa > 1:1312713/1‑100 (MQ=255) gCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGa > 2:220779/1‑100 (MQ=255) gCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGa > 2:2527053/1‑100 (MQ=255) gCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGGGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGa > 2:2132113/1‑100 (MQ=255) gtcgtgcgtgtggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAAt > 2:2330901‑M1/63‑100 (MQ=255) cgtgcgtgtggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCg > 1:594048‑M1/61‑100 (MQ=255) gtgcgtgtggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCg > 2:376948‑M1/60‑100 (MQ=255) ttGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCgtgtg < 2:1592947/100‑1 (MQ=255) ttGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCgtgtg < 1:1536272/100‑1 (MQ=255) tGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCgtgtgt > 1:552551/1‑100 (MQ=255) ccATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGtgttg > 1:2451178/1‑100 (MQ=255) ccATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGtgttg < 1:239568/100‑1 (MQ=255) cATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAC‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGtgttgt < 1:1685529/100‑1 (MQ=255) gCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTcc < 2:659564/100‑1 (MQ=255) gCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTcc < 1:45830/100‑1 (MQ=255) tCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAg > 1:1488672/1‑100 (MQ=255) tCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAg > 1:2243218/1‑100 (MQ=255) tCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAg < 2:2221712/100‑1 (MQ=255) ccAGTCCTTTACTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTcc < 2:1009419/97‑1 (MQ=255) gaGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTc < 1:1907199/99‑1 (MQ=255) aGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTcc < 1:1208497/100‑1 (MQ=255) gTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTccc > 1:892719/1‑100 (MQ=255) gTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTccc < 1:1672883/100‑1 (MQ=255) ttttCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACg < 2:2106512/100‑1 (MQ=255) cttctGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGgcgc < 2:1197781/100‑1 (MQ=255) ttctGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAT‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCa < 2:25078/100‑1 (MQ=255) ttctGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCa > 1:603907/1‑100 (MQ=255) tctGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCAt < 2:18986/100‑1 (MQ=255) ctGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCAtt > 1:2526056/1‑100 (MQ=255) gggCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGc > 2:2325287/1‑100 (MQ=255) gggCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGc > 1:423655/1‑100 (MQ=255) ggCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGcc > 2:2175711/1‑100 (MQ=255) ggCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGcc > 1:271690/1‑100 (MQ=255) gCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCcg > 2:1968393/1‑100 (MQ=255) gCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGGGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCcg > 2:205032/1‑100 (MQ=255) cGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCcgac > 1:1968659/1‑100 (MQ=255) agggactggaacaacacacgattccAAAT‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCcgacg > 1:2415961‑M1/26‑100 (MQ=255) aCTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCcga < 2:522276/97‑1 (MQ=255) tttCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGacc < 1:2355000/100‑1 (MQ=255) tCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCACGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGGTCAAATCAATACAGAGCATTGCAGACGaacac > 2:1008455/1‑100 (MQ=255) ccGGGAGGTGCTTAAACGAAACA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGaccacc < 1:599473/100‑1 (MQ=255) ccGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGaccacc > 1:1133393/1‑100 (MQ=255) cGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGACCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGAGCATTGCCGACGaccacca > 2:505458/1‑100 (MQ=255) gggAGGTGCTTAGACGAAACT‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCCGCGGGGTTTGGGAAGCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGaccaccac < 1:118922/100‑1 (MQ=255) gggAGGTGCTTAAACTAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCATTCCTTACTGCAATGTTCCGACGaccacca < 2:111184/99‑1 (MQ=255) ggTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACcaca < 1:1226319/100‑1 (MQ=255) gCTTAAACGAAAAA‑CCCCTCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCAcacgc > 1:1058705/1‑100 (MQ=255) gCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCAcacgc > 1:1997473/1‑100 (MQ=255) cTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCAcacgca > 1:2579604/1‑100 (MQ=255) tAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCAcacgcac > 2:597645/1‑99 (MQ=255) aaaCGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCacga > 1:1591979/1‑100 (MQ=255) aaCGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCacgac > 1:1140787/1‑100 (MQ=255) aaCGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCacgac > 1:2188960/1‑100 (MQ=255) aCGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGCCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCacgacg > 1:173084/1‑100 (MQ=255) cGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCAcgacga > 1:1633153/1‑100 (MQ=255) AAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGaccn > 2:603897‑M1/1‑99 (MQ=255) AAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGACCa > 2:1335474‑M1/1‑100 (MQ=255) | CTGCGCCGGTAAAGCGCTTACGCGTCGATGTTGTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGACCA > NC_000913/3852736‑3852933 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |