New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3852834 = | 107 (1.140) | 19 (0.230) | 11/156 | NT | 18.2% | intergenic (‑50/+56) | ilvB/ivbL | acetolactate synthase 2 large subunit/ilvB operon leader peptide |
? | NC_000913 | 3852867 = | 77 (0.940) | intergenic (‑83/+23) | ilvB/ivbL | acetolactate synthase 2 large subunit/ilvB operon leader peptide |
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
GTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTGGTAGTAGTTTT > NC_000913/3852768‑3852965 | gtgCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTg < 1:1144536/100‑1 (MQ=255) gtgCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTg > 2:1956210/1‑100 (MQ=255) ggtcgtcgtgcgtgtggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaccaacacacgattccAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTg > 2:1793450‑M1/67‑100 (MQ=255) ggtcgtcgtgcgtgtggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTg < 2:991565‑M1/34‑1 (MQ=255) ggtcgtcgtgcgtgtggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTg > 1:991570‑M1/67‑100 (MQ=255) tgCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTgg < 1:930356/100‑1 (MQ=255) tgCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTgg < 2:450755/100‑1 (MQ=255) tcgtcgtgcgtgtggtggtggacgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTg > 2:1486876‑M1/65‑98 (MQ=255) gCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGa > 2:2527053/1‑100 (MQ=255) gCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGa > 2:2135893/1‑100 (MQ=255) gCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGa > 2:220779/1‑100 (MQ=255) gCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGa > 1:1312713/1‑100 (MQ=255) cgtcgtgcgtgtggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattcaAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGaa > 1:265358‑M1/64‑100 (MQ=255) cgtgcgtgtggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCg > 1:594048‑M1/61‑100 (MQ=255) gtgcgtgtggtggtggtcgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccAAAAACCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCg > 2:376948‑M1/60‑100 (MQ=255) aCTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCgtg < 1:294147/100‑1 (MQ=255) ttGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCgtgtg < 1:1536272/100‑1 (MQ=255) ttGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCgtgtg < 2:1592947/100‑1 (MQ=255) ccATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGtgttg > 1:2451178/1‑100 (MQ=255) ccATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGtgttg < 1:239568/100‑1 (MQ=255) tGCTCCTGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAT‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTc < 1:1697933/100‑1 (MQ=255) gCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTcc < 2:659564/100‑1 (MQ=255) gCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTcc < 1:45830/100‑1 (MQ=255) cTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCa < 2:2018042/100‑1 (MQ=255) tCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAg > 1:1488672/1‑100 (MQ=255) tCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAg > 1:2243218/1‑100 (MQ=255) tCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAg < 2:2221712/100‑1 (MQ=255) ccAGTCCTTTACTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTcc < 2:1009419/97‑1 (MQ=255) gaGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTc < 1:1907199/99‑1 (MQ=255) cAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTc < 2:2515640/100‑1 (MQ=255) aGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTcc < 1:1208497/100‑1 (MQ=255) gTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTccc < 1:1672883/100‑1 (MQ=255) gTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTccc > 1:892719/1‑100 (MQ=255) cgtcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccaaaaccccgccggcgcaaaccgggcggggatttGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCt > 1:2415961‑M2/76‑100 (MQ=255) ccTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTa < 1:1060966/100‑1 (MQ=255) ttttCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACg < 2:1778347/100‑1 (MQ=255) ttttCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACg < 2:2106512/100‑1 (MQ=255) tcggcaatgcgccgtagggactggaacaacacacgattccaaaaccccgccggcgcaaaccgggcggggttttGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTAc > 1:1281838‑M2/74‑100 (MQ=255) tattcttcTGGGCCGACTATCCGGGAGGGGCTTAAACGAAAAA‑CCCAGCACGGTTTGCGCCGGCGGGGATTTGGAATCGTGTGTTGTTCTAGtgctta > 2:862492/3‑93 (MQ=255) ttcttcTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGgc > 1:16405/1‑100 (MQ=255) cttctGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGgcgc < 2:1197781/100‑1 (MQ=255) ttctGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGgcg > 1:603900/1‑98 (MQ=255) ttctGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCa > 1:603907/1‑100 (MQ=255) tctGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCAt < 2:18986/100‑1 (MQ=255) ctGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCAtt > 1:2526056/1‑100 (MQ=255) tGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTg < 1:885066/100‑1 (MQ=255) gggCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGc > 1:423655/1‑100 (MQ=255) gggCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGc > 2:2325287/1‑100 (MQ=255) ggCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGcc > 2:2175711/1‑100 (MQ=255) ggCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGcc > 1:271690/1‑100 (MQ=255) gCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGcct < 2:2298087/100‑2 (MQ=255) aCTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCcga < 2:522276/97‑1 (MQ=255) tttCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGacc < 1:1124107/100‑1 (MQ=255) tttCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGacc < 1:2355000/100‑1 (MQ=255) tCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCACGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGGTCAAATCAATACAGAGCATTGCAGACGaacac > 2:1008455/1‑100 (MQ=255) ccGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGaccacc > 1:1133393/1‑100 (MQ=255) gggAGGTGCTTAGACGAAACT‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCCGCGGGGTTTGGGAAGCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGaccaccac < 1:118922/100‑1 (MQ=255) gggAGGTGCTTAAACTAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCATTCCTTACTGCAATGTTCCGACGaccacca < 2:111184/99‑1 (MQ=255) ggTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACcaca < 2:709880/100‑1 (MQ=255) ggTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACcaca < 1:1226319/100‑1 (MQ=255) gCTTAAACGAAAAA‑CCCCTCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCAcacgc > 1:1058705/1‑100 (MQ=255) gCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCAcacgc > 1:1997473/1‑100 (MQ=255) gCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCAcacgc > 1:1997427/1‑100 (MQ=255) cTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCAcacgca > 1:2579604/1‑100 (MQ=255) ttAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCAcacgcac > 1:1861246/1‑100 (MQ=255) tAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCAcacgcac > 2:597645/1‑99 (MQ=255) cgattccaaaaccccgccggcgcaaaccgggcggggtttttGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCAcacgcac > 2:376948‑M2/42‑100 (MQ=255) cgattccaaaaccccgccggcgcaaaccgggcggggttttGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCAcacgcacg > 1:594048‑M2/41‑100 (MQ=255) aaaCGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCacga > 1:1591979/1‑100 (MQ=255) aaCGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCacgac < 2:2579591/100‑1 (MQ=255) aaCGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCacgac > 1:2188960/1‑100 (MQ=255) aaCGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGAGTGTTGTTGCAGTCCCTGCGGCGCATTGCCGACGACCACCATCacac > 2:2128650/1‑93 (MQ=255) attccaaaaccccgccggcgcaaaccgggcggggttttGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCacgac > 2:2330901‑M2/39‑100 (MQ=255) aCGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGCCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCacgacg > 1:173084/1‑100 (MQ=255) aCGAAAAA‑CCCCGCCCGGGTTGCGCCCGCGGGGTTTTGGAAGCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCacga > 2:1551748/1‑98 (MQ=255) tccaaaaccccgccggcgcaaaccgggcggggttttGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCAcgacga > 2:2527636‑M2/37‑100 (MQ=255) gAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACgacgac > 2:1330509/1‑100 (MQ=255) caaaaccccgccggcgcaaaccgggcggggttttGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACgacgac > 1:1836601‑M2/35‑99 (MQ=255) caaaaccccgccggcgcaaaccgggcggggttttGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGccc > 2:417528‑M2/35‑100 (MQ=255) caaaaccccgccggcgcaaaccgggcggggttttGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGAcc < 2:991565‑M2/66‑1 (MQ=255) AAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGaccn > 2:603904‑M1/1‑99 (MQ=255) aaaccccgccggcgcaaaccgggcggggttttGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGACCAc > 1:1521165‑M2/33‑100 (MQ=255) aaaccccgccggcgcaaaccgggcggggttttGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGACCAc > 1:1140883‑M2/33‑100 (MQ=255) a‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTTCAGTCCCTGCGGGGTATTGGCGACGAGTACGACCACACGCacgacg > 2:1433609/1‑93 (MQ=255) A‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGACCACTg < 1:1623291‑M1/100‑1 (MQ=255) ccccgccggcgcaaaccgggcggggttttGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCCCGCGCACGACGACCACTgc > 2:2192617‑M2/30‑100 (MQ=255) ccccgccggcgcaaaccgggcggggttttGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGACCACTgc > 1:1198597‑M2/30‑100 (MQ=255) cccgccggcgcaaaccgggcggggttttGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGCCGACCACCACCACACGCACGACGACCACTgcg > 2:2428308‑M2/29‑100 (MQ=255) CCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGACCACTgcgg < 1:1884610‑M1/100‑1 (MQ=255) GCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGACCACTgcggcg > 1:985810‑M1/1‑100 (MQ=255) cgGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGACCACTgcgccatcc > 1:531279/1‑94 (MQ=255) cgGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGACCACTGCGGCGGAt < 1:1456075/100‑1 (MQ=255) ttGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGACCACTGCGGCGGATGgcg > 2:1479885/1‑100 (MQ=255) tGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGACCACTGCGGCGGATGgcgc < 1:1956220/100‑1 (MQ=255) gcCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGt > 1:1311887/1‑100 (MQ=255) ggcggggttttGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTgg > 1:1067874‑M2/12‑100 (MQ=255) ggcggggttttGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTgg > 2:2047947‑M2/12‑100 (MQ=255) ggggttttGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTGgtag < 1:505462‑M2/92‑1 (MQ=255) ggttttGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTGgtagta > 2:1285844‑M2/7‑100 (MQ=255) ggAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACAACCCCTGCGGCGGCAGGCGCAGTTGGCTGAAGtttt > 2:359201/1‑99 (MQ=255) | GTGCCCGAACTTGCCATGCTCCAGTCCTTTTCTTCTGGGCCGACTTTCCGGGAGGTGCTTAAACGAAAAA‑CCCCGCCCGGTTTGCGCCGGCGGGGTTTTGGAATCGTGTGTTGTTCCAGTCCCTACGGCGCATTGCCGACGACCACCACCACACGCACGACGACCACTGCGGCGGATGGCGCAGTTGGTAGTAGTTTT > NC_000913/3852768‑3852965 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |