| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3895222 = | 90 (0.960) | 23 (0.280) | 13/154 | NT | 22.9% | intergenic (+4/+50) | chrR/adeP | chromate reductase, Class I, flavoprotein/adenine permease, high affinity; adenine:H+ symporter |
| ? | NC_000913 | 3895257 = | 77 (0.950) | intergenic (+39/+15) | chrR/adeP | chromate reductase, Class I, flavoprotein/adenine permease, high affinity; adenine:H+ symporter | |||||
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
CCGCAAACCGGAGAAGTGATTGATCAGGGTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAACAGCAGCGCAACGA > NC_000913/3895123‑3895321 | ggacgtctgcgtgatttaagcccgtgcgtaatcatcgttgcgctgctgtttatcctgaagattgtctttatcgacgctcactaaaatcgatagcgcgtta > 1:2562582‑M1/100‑100 (MQ=255)ggacgtctgcgtgatctaagcccgtgcgtaatcatcgttgcgctgctgtttatcctgaagattgtctttatcgacgctcactaaaatcgatagcgcgtta < 1:2594649‑M1/1‑1 (MQ=255) cGCAAACCGGAGAAGTGATTGATCAGGGTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 2:1061436‑M1/1‑100 (MQ=255) cGCAAACCGGAGAAGTGATTGATCAGGGTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA < 1:1676175‑M1/100‑1 (MQ=255) cGCAAACCGGAGAACTGATTGATCAGGGTACGCGGGACCACTTGACCGGGAAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA < 2:1772583‑M1/100‑1 (MQ=255) gCAAACCGGAGAAGTGATTGATCAGGGTACGCTGGACCACCTGACCGTGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAA > 2:1104922‑M1/1‑100 (MQ=255) gCAAACCGGAGAAGTGATTGATCAGGGTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAA < 2:357693‑M1/100‑1 (MQ=255) acgtctgcgtgatctaagcccgtgcgtaatcatcgttgcgctgctgtttatcctgaagattgtctttatcgacgctcactaaaatcgatagcgcgttaaa > 2:1302025‑M1/98‑100 (MQ=255) cgtctgcgtgatctaagcccgtgcgtaatcatcgttgcgctgctgtttatcctgaagattgtctttatcgacgctcactaaaatcgatagcgcgttaaaa < 2:2235350‑M1/4‑1 (MQ=255) ctgcgtgatctaagcccgtgcgtaatcatcgttgcgctgctgtttatcctgaagattgtctttatcgacgctcactaaactcgatagcgcgttAAAAAcc > 2:1589662‑M1/94‑100 (MQ=255) ngcgtgatctaagcccgtgcgtaatcatcgttgcgctgctgtttatcctgaagattgtctttatcgacgctcactaaaatcgatagcgcgttAAAAAccc < 1:1017205‑M1/8‑1 (MQ=255) gcgtgatctaagcccgtgcgtaatcatcgttgcgctgctgtttatcctgaagattgtctttatcgacgctcactaaaatcgatagcgcgttAAAAACCCg < 2:2041949‑M1/9‑1 (MQ=255) gcgtgatctaagcccgtgcgtaatcatcgttgcgctgctgtttatcctgaagattgtctttatcgacgctcactaaaatcgatagcgcgttAAAAACCCg > 1:581530‑M1/92‑100 (MQ=255) gtgatctaagcccgtgcgtaatcatcgttgcgctgctgtttatcctgaagattgtctttatcgacgctcactaaaatcgatagcgcgttAAAAACCCGcc > 1:1735870‑M1/90‑100 (MQ=255) gTGATTGATCAGGGTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCaa > 2:1860823/1‑100 (MQ=255) gTGATTGATCAGGGTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCaa > 2:2499793/1‑100 (MQ=255) gTGATTGATCAGGGTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCaa > 1:155924/1‑100 (MQ=255) tgattgatCAGGGTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAAt > 1:1844559/1‑100 (MQ=255) gattgatCAGGGTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATc > 2:2538717/1‑100 (MQ=255) gattgatCAGGGTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATc > 2:873153/1‑100 (MQ=255) gattgatCAGGGTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATACAGCGAGTTAAGATATAAATAAAAAACCCGCCAGCAATc > 2:2303796/1‑100 (MQ=255) gcccgtgcgtaatcatcgttgcgctgctgtttatcctgaagattgtctttatcgacgctcactaaaatcgatagcgcgttAAAAACCCGCCAGCAATcat > 2:1261396‑M1/81‑100 (MQ=255) tgatCAGGGTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATcatg < 2:1389078/100‑1 (MQ=255) gatCAGGGTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGCTCTAAATAAAAAAACAGCCAGCAATcatg > 2:1013984/1‑99 (MQ=255) atCAGGGTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATcatgca < 1:2485404/100‑1 (MQ=255) gggTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggc > 1:849435‑M2/1‑96 (MQ=255) ggTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcg < 1:311249‑M2/100‑6 (MQ=255) ggTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcg > 1:2041141‑M2/1‑95 (MQ=255) gTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcgg < 1:13983‑M2/100‑7 (MQ=255) gTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcgg > 1:2496855‑M2/1‑94 (MQ=255) aatgatcgttgcgctgctgtttatcctgaagattgccttgatcgacgctcactaaaatcgatagcgcgttAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCggg > 2:404154‑M1/71‑100 (MQ=255) aatcatcgttgcgctgctgtttatcctgaagattgtctttatcgacgctcactaaaatcgatagcgcgttAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCggg > 1:2235363‑M1/71‑100 (MQ=255) aatcatcgttgcgctgctgtttatcctgaagattgtctttatcgacgctcactaaaatcgatagcgcgttAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCggg > 1:2260863‑M1/71‑100 (MQ=255) atcatcgttgcgctgctgtttatcctgaagattgtctttatcgacgctcactaaaatcgatagcgcgttAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGt > 1:2149470‑M1/70‑100 (MQ=255) aCGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGCGAGCTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcgggt < 2:968121‑M2/100‑9 (MQ=255) tcatcgttgcgctgctgtttatcctgaagattgtctttatcgacgctcactaaaatcgatagcgcgttAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCggg > 2:1642145‑M1/69‑98 (MQ=255) cGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcgggtt < 1:2368276‑M2/100‑10 (MQ=255) cGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcgggtt < 1:1130163‑M2/100‑10 (MQ=255) cGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcgggtt < 2:565221‑M2/100‑10 (MQ=255) gCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcgggttt > 2:1974061‑M2/1‑90 (MQ=255) cTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAtgcatgattgctggcgggtttt < 1:1860204‑M1/100‑23 (MQ=255) cTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcgggtttt < 1:1910705‑M2/100‑12 (MQ=255) cTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcgggtttt > 2:189967‑M2/1‑89 (MQ=255) atcgttgcgctgctgtttatcctgaagattgtctttatcgccgctcactaaaatcgatagcgcgttAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGtttt > 1:116687‑M1/67‑100 (MQ=255) tcgttgcgctgctgtttatcctgaagattgtctttatcgacgctcactaaaatcgatagcgcgttAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGttttt > 1:1092373‑M1/66‑100 (MQ=255) tGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcgggttttt < 1:1208631‑M2/100‑13 (MQ=255) ggACCACCTGTCCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAACAATCCGCCAtgcatgattgctggcgggtttttt < 2:1708310‑M1/100‑25 (MQ=255) ggACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTa > 1:391506/1‑100 (MQ=255) gACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTaa < 1:1467410/100‑1 (MQ=255) atcaccTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAAc > 1:1765531/3‑100 (MQ=255) caccTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAAcgc > 1:736395/1‑100 (MQ=255) accTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAAcgcg > 1:894203/1‑100 (MQ=255) ccTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAtgcatgattgctggcgggttttttatttag < 1:782393‑M1/100‑31 (MQ=255) ccTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACgcgc < 2:1963881/100‑1 (MQ=255) ccTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACgcgc > 1:2363208/1‑100 (MQ=255) cTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCt < 1:465180/100‑1 (MQ=255) cTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCt > 2:1440124/1‑100 (MQ=255) tGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTa > 2:1355559/1‑100 (MQ=255) gACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTAt < 1:1307792/100‑1 (MQ=255) cGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGa < 1:1646266/100‑1 (MQ=255) gggCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGAt < 2:922871/100‑1 (MQ=255) cAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGAtttt < 1:622160/100‑1 (MQ=255) aTTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAg < 2:153980/100‑1 (MQ=255) aTTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAg < 1:632090/100‑1 (MQ=255) ttGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGt < 1:501551/100‑1 (MQ=255) gACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGa < 1:1043016/100‑1 (MQ=255) aCCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcgggttttttatttagatcttaactcgctgaa < 1:1061441‑M2/100‑36 (MQ=255) ccGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGc > 2:2354244/1‑100 (MQ=255) ccGCATTTGGTGAGTTTATTAAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATAATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGc > 2:2107904/1‑100 (MQ=255) cGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACTCGCCAtgcatgattgctggcgggttttttatttagatcttaactcgctgaata < 2:1956972‑M1/100‑49 (MQ=255) gCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAATATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGt < 1:442242/100‑1 (MQ=255) aTTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCg < 1:550078/100‑1 (MQ=255) tttGGTGAGTTTATTCAGCGAGGTAAGGTCGAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGa < 2:952379/100‑1 (MQ=255) tGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATa < 2:1763731/100‑1 (MQ=255) tGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATa < 1:21823/100‑1 (MQ=255) tGGTGAGTGTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGAtn < 1:641065/100‑2 (MQ=255) tGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAg < 2:2282239/100‑1 (MQ=255) gTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACa > 1:659779/1‑100 (MQ=255) gTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATAGATTTTAATGAGCGGCGATAAAGACa > 2:615006/1‑100 (MQ=255) tttATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACaa > 2:816422/1‑100 (MQ=255) tCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTc < 1:2096138/100‑1 (MQ=255) actaaaatcgatagcgcgttAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAg > 1:1343444‑M1/21‑100 (MQ=255) aGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCTCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAg > 2:1825860/1‑100 (MQ=255) aGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAg < 1:2022080/100‑1 (MQ=255) gCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAgg < 1:98589/100‑1 (MQ=255) gAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGAt > 2:1205275/1‑100 (MQ=255) aGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGAt < 2:2138427/99‑1 (MQ=255) ttAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATaaa > 1:82733/1‑100 (MQ=255) gATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAAcagc > 1:1546152/1‑100 (MQ=255) gATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAAcagc > 1:928699/1‑100 (MQ=255) aTCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAAcagca > 1:2441372/1‑100 (MQ=255) tCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAAcagcag < 2:69770/100‑1 (MQ=255) aaataaaAAGCCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAACAGCAgcgc < 2:1715872/100‑1 (MQ=255) aaataaaAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAACAGCAgcgc > 1:1345912/1‑100 (MQ=255) aataaaAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcgggttttttatttagatcttaactcgctgaataaactcaccaaatgcggtcaattgcccggtcaggtgg < 1:842123‑M2/100‑74 (MQ=255) ataaaAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcgggttttttatttagatcttaactcgctgaataaactcaccaaatgcggtcaattgcccggtcaggtggt < 1:2517236‑M2/100‑75 (MQ=255) ataaaAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcgggttttttatttagatcttaactcgctgaataaactcaccaaatgcggtcaattgcccggtcaggtgg < 1:474076‑M2/99‑74 (MQ=255) ataaaAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAACAGCAGCGCaa > 2:313905/1‑100 (MQ=255) taaaAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAACAGCAGCGCAAc < 1:2538730/100‑1 (MQ=255) aaaaaaCCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAACAGCAGCGCAACg < 2:285930/100‑1 (MQ=255) | CCGCAAACCGGAGAAGTGATTGATCAGGGTACGCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAACAGCAGCGCAACGA > NC_000913/3895123‑3895321 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |