New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4266888 = | NA (NA) | 5 (0.060) | 5/164 | NT | NA | noncoding (1/97 nt) | RIP318 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences and 1 IHF site | RIP318 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences and 1 IHF site |
? | NC_000913 | 4266918 = | NA (NA) | noncoding (31/97 nt) | RIP318 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences and 1 IHF site | RIP318 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences and 1 IHF site |
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
TACGCGCCTGACTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGTCTCACTCTGTTG > NC_000913/4266819‑4267017 | taCGCGCCTGACTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGcc > 2:1767344/1‑100 (MQ=255) aCGCGCCTGACTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCa > 1:1375922/1‑100 (MQ=255) ccagaggcacgacctttataagagcatgaaagaacatcaacttattgaatttttaggattttattgGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAAt > 1:2001557‑M1/67‑100 (MQ=255) gcCTGACTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAAt > 1:1341920/1‑98 (MQ=255) ccTGACTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATaaa > 1:2323158/1‑100 (MQ=255) cTGACTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATaaaa < 1:943414/100‑1 (MQ=255) tGACTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAAt < 1:2506072/100‑1 (MQ=255) tGACTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAAt < 1:2391447/100‑1 (MQ=255) tGACTTCAAGGGGCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAAt < 1:2115595/100‑1 (MQ=255) aCTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATcc < 1:1190985/100‑1 (MQ=255) aCTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATcc < 1:1702784/100‑1 (MQ=255) aCTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATcc < 1:2379937/100‑1 (MQ=255) aCTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATcc < 2:251853/100‑1 (MQ=255) tCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGGGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTaa < 2:2330292/100‑1 (MQ=255) ncAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGGTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTCAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTaa > 2:1563367/2‑100 (MQ=255) aaGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATGGCTCTGTAATATTTGAGTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTaaaa < 2:2350500/100‑1 (MQ=255) aaGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCCaaaa > 2:2540009/1‑100 (MQ=255) aGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTaaaaa < 2:1413717/100‑1 (MQ=255) tCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCa < 2:2231318/100‑1 (MQ=255) tCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCa < 2:735900/100‑1 (MQ=255) gcgATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAAt > 1:689526/1‑100 (MQ=255) gcgATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATACGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAAt > 2:2279317/1‑100 (MQ=255) gcgATGAAAGACGTGGATTAATCGTTCTGTAATTTTTAATTGGGTGTGACGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAAt < 2:1043533/100‑1 (MQ=37) aTGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGTTTTATCTGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAg > 2:2471692/1‑100 (MQ=255) gAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGtt > 1:1846781/1‑100 (MQ=255) aCGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGt < 2:370756/100‑1 (MQ=255) cGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGtt > 1:956899/1‑100 (MQ=255) cGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGtt > 2:1768353/1‑100 (MQ=255) agaacatcaacttattgaatttttaggattttattgtacggataaggcattcacgccgcatccggcCAATAACATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGt > 1:282039‑M2/67‑99 (MQ=255) gTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTc < 1:287287/100‑1 (MQ=255) gTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTc > 1:2534194/1‑100 (MQ=255) tGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCt < 1:480001/100‑1 (MQ=255) tAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTACCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCAt < 2:767578/100‑1 (MQ=255) aaTCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATg < 1:1296302/100‑1 (MQ=255) aaTCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATg < 1:1069740/100‑1 (MQ=255) aTCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGc > 1:459424/1‑100 (MQ=255) tCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGct < 2:1170328/100‑1 (MQ=255) cGTTCTGTAATATTTGATTTTATCTCCCTGATGCCGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAGCATCCCAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGctc < 2:2581282/100‑1 (MQ=255) gTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGctct < 2:1274142/100‑1 (MQ=255) gTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGctct > 2:1892669/1‑100 (MQ=255) gTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGctct < 2:2440862/100‑1 (MQ=255) gTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGctct < 2:633404/100‑1 (MQ=255) ttCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCtt < 1:1570249/100‑1 (MQ=255) tCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTta > 1:1084047/1‑100 (MQ=255) tCTGTAATATTTGATTGGCTGTGCCGTATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGTCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTta < 2:2558257/100‑1 (MQ=255) tGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTtata > 1:2210028/1‑100 (MQ=255) gTAATATTTTATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCTAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATaa < 2:2533140/100‑1 (MQ=255) gTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATaa > 1:1832549/1‑100 (MQ=255) gTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATaa > 1:1351270/1‑100 (MQ=255) tAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATaaa > 2:1040699/1‑100 (MQ=255) atatTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAgg > 2:1075997/1‑100 (MQ=255) atatTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAgg > 1:1724033/1‑100 (MQ=255) atatTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAgg < 2:1001126/100‑1 (MQ=255) atatTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAgg < 2:2070698/100‑1 (MQ=255) tatTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGt < 2:1979466/100‑1 (MQ=255) tttGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCg < 2:2075517/100‑1 (MQ=255) aTTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGcc < 2:374288/100‑1 (MQ=255) tGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCctc < 2:1927661/100‑1 (MQ=255) ttattggccggataaggcattcacgccgcatccggcCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCctct > 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ATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTAc > 2:736727‑M1/1‑100 (MQ=255) TGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACg > 1:468945‑M1/1‑100 (MQ=255) TGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACg > 2:2036416‑M1/1‑100 (MQ=255) TGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACg > 1:4932‑M1/1‑100 (MQ=255) TGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACg < 2:2349661‑M1/100‑1 (MQ=255) cggcgTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGtt < 1:1030177/100‑1 (MQ=255) ggcgTGAATGCCTTATCCGGTCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGttt > 2:1594882/1‑100 (MQ=255) 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2:2444363/100‑1 (MQ=255) tGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAg < 1:1822716/100‑1 (MQ=255) gCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGt > 1:101490/1‑100 (MQ=255) gCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGt > 2:1629012/1‑100 (MQ=255) ccTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGtc > 1:1969413/1‑100 (MQ=255) ccTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGtc > 2:2258944/1‑100 (MQ=255) ttATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGtctc > 2:1742716/1‑100 (MQ=255) tATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGTCTCa > 1:2596899/1‑100 (MQ=255) tATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGTCTCa > 1:413464/1‑100 (MQ=255) cggcCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGTCTCActct < 1:51161‑M2/96‑1 (MQ=255) cCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGATCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGTCTCACTCTGtt > 2:1678453‑M2/2‑100 (MQ=255) cAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGTCTCACTCTGTTg < 2:433435/100‑1 (MQ=255) cAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGTCTCACTCTGTTg < 2:1393800/100‑1 (MQ=255) | TACGCGCCTGACTTCAAGGGTCGCGATGAAATACGTGGATTAATCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATAAAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGGCGGATGTACGTTTGTCATGAGTCTCACTCTGTTG > NC_000913/4266819‑4267017 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |