| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4515778 | 107 (1.140) | 8 (0.090) | 6/166 | NT | 7.5% | coding (900/2325 nt) | fecA | TonB‑dependent outer membrane ferric citrate transporter and signal transducer; ferric citrate extracelluar receptor; FecR‑interacting protein |
| ? | NC_000913 | = 4515794 | 99 (1.130) | coding (884/2325 nt) | fecA | TonB‑dependent outer membrane ferric citrate transporter and signal transducer; ferric citrate extracelluar receptor; FecR‑interacting protein | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
TGCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCC > NC_000913/4515695‑4515892 | cACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAgc > 2:1250251‑M2/1‑98 (MQ=255) cACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAAAGCAgc < 1:2592161‑M2/100‑3 (MQ=255) aCCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAgcg > 2:792287‑M2/1‑97 (MQ=255) ccTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAgcgc < 2:1811198‑M2/100‑5 (MQ=255) ccTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAgcgc < 1:1427624‑M2/100‑5 (MQ=255) cATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGt > 2:312935/1‑100 (MQ=255) cATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGt > 1:1971471/1‑100 (MQ=255) aTCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCTGAGTAGAGCAGCGCGGTg < 1:785056/100‑1 (MQ=255) aTCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGt > 2:1106743/1‑99 (MQ=255) ccGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGcc < 1:1319378/100‑1 (MQ=255) ccGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGcc > 2:1796794/1‑100 (MQ=255) ggCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTTTTCTATGCGGGTAGCGCTGTGCACGCGCCAGTCACTGCCGAGCGTGCCGGTGTAGAGCAGCGCGGTGcc < 2:561933/98‑1 (MQ=255) cgcATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCaaa < 1:1324394/99‑1 (MQ=255) tatTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCg > 2:1233766/1‑99 (MQ=255) tatTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGt < 1:1391551/100‑1 (MQ=255) tatTTGCTTTTCAGCACCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGt < 2:392066/100‑1 (MQ=255) tttGCTTTTCGGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTCCCCGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTg < 2:1714450/100‑1 (MQ=255) tttGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTg < 2:619182/100‑1 (MQ=255) tttGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTg < 1:1144584/100‑1 (MQ=255) tatGCCTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCCGTGCTCGCGCCAGTCGCTGCCGCGCGTGCTGGAGTAGAGCTGCGCGGTGCCAACACCGGTg < 2:117707/98‑1 (MQ=255) ttGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGt < 2:547140/100‑1 (MQ=255) gCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTcc > 1:874323/1‑100 (MQ=255) cTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCg > 1:1933241/1‑100 (MQ=255) ttCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCtg > 1:184594/1‑100 (MQ=255) tCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCtgt < 1:660134/100‑1 (MQ=255) tCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCtgt < 1:1340793/100‑1 (MQ=255) gCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCGGTCACTGCCGCGCGTGCCGGCGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTgc > 2:1960140/1‑99 (MQ=255) gCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTgcc > 1:1769209/1‑100 (MQ=255) gCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTgcc > 1:1871606/1‑100 (MQ=255) caacAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCGCGAGCCGGTCTCTGCGGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGGGGTACCAAACCCGTAGTACGCTGTgcc > 2:1283252/4‑99 (MQ=255) aTCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTgtcgc < 1:654713/100‑1 (MQ=255) tCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGGGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTgccgc > 1:1165431/1‑99 (MQ=255) cAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTTCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGccc < 1:2288539/100‑1 (MQ=255) cAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTgccgcca < 1:1344934/100‑2 (MQ=255) aGGTCGTCGATGCGGGAGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCcca > 1:1281705/1‑100 (MQ=255) ggTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCccac < 2:462796/100‑1 (MQ=255) tcgtcgATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCccacca > 1:103628/1‑100 (MQ=255) cgtcgATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCAt > 1:1653218/1‑100 (MQ=255) gtcgATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGCGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATc > 1:2506592/1‑100 (MQ=255) gtcgATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATc > 1:1026515/1‑100 (MQ=255) gtcgATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATc > 1:1920504/1‑100 (MQ=255) tcgATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCa < 1:439018/100‑1 (MQ=255) cgATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAg < 2:622205/100‑1 (MQ=255) cgATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAg < 1:857239/100‑1 (MQ=255) gATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAg < 2:955010/99‑1 (MQ=255) aTGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGt < 2:547770/100‑1 (MQ=255) tGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGTCGGAGTATAGCAGCGAGGTGCCAACACCGTTGTCCGCTGTGCGGACCACCATCAgg > 1:957840/1‑98 (MQ=255) gCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTtg < 1:2489091/100‑1 (MQ=255) gggTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAATACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTtgtg < 1:1831246/100‑1 (MQ=255) gggTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTtgtg < 2:27806/100‑1 (MQ=255) ggTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGc > 1:516736/1‑100 (MQ=255) gTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCg < 1:2465913/100‑1 (MQ=255) tGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGt < 1:546712/100‑1 (MQ=255) ggCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGtc < 2:2138049/100‑1 (MQ=255) ggCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGtc < 1:1233771/100‑1 (MQ=255) gcgcTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGtct > 1:1879625/1‑100 (MQ=255) cgcTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGtctc < 2:187501/100‑1 (MQ=255) cgcTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGtctc > 2:2566797/1‑100 (MQ=255) cgcTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGtctc < 2:887090/100‑1 (MQ=255) cgcTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGtct < 1:1388774/99‑1 (MQ=255) tgCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCg < 1:77129/100‑1 (MQ=255) tgCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCg < 1:1811207/100‑1 (MQ=255) gCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGCGCAGCTCGGTGCCAAAACCGTTCTCCGCTGTGCCGCCCACCATCACGTCGTGCGTCTCTTTCgg > 2:1713654/1‑100 (MQ=255) cTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCggg < 1:1745601/100‑1 (MQ=255) cTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCggg < 1:2507830/100‑1 (MQ=255) cTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCggg < 1:1668991/100‑1 (MQ=255) cTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCggg > 2:2492191/1‑100 (MQ=255) tCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAgcgcggcagtgactggcgcgagcacagcgccacccgcatcgacgacctgatgctgaaaagcaa < 1:862260‑M2/100‑64 (MQ=255) gcCAATCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCggg < 2:207065/95‑1 (MQ=255) cAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGtttt < 2:283116/100‑1 (MQ=255) cAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGtttt > 2:2558870/1‑100 (MQ=255) aGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTtg > 2:2369516/1‑100 (MQ=255) gTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTtgt < 1:2369529/100‑1 (MQ=255) tCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGTGGTGCTAAAACCGTTGGCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTtgtg < 2:1751171/100‑1 (MQ=255) tCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTtgtg < 2:1732578/100‑1 (MQ=255) cACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGa < 2:1378126/100‑1 (MQ=255) cACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGa > 1:2128773/1‑100 (MQ=255) aCTGCCGCGCGTGCCGGAGAAGAGCCGCGCGGTGCCAAAACCGTCGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGaa > 1:1458808/1‑100 (MQ=255) cTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAgcgcggcagtgactggcgcgagcacagcgccacccgcatcgacgacctgatgctgaaaagcaaatatgcgccgga < 1:1925507‑M2/100‑76 (MQ=255) tGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGGCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAaga < 2:2158876/100‑1 (MQ=255) gCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAgcgcggcagtgactggcgcgagcacagcgccacccgcatcgacgacctgatgctgaaaagcaaatatgcgccggatg < 1:1036897‑M2/100‑78 (MQ=255) gCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAgcgcggcagtgactggcgcgagcacagcgccacccgcatcgacgacctgatgctgaaaagcaaatatgcgccggatg < 1:1427932‑M2/100‑78 (MQ=255) gCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAagag < 2:2543559/100‑1 (MQ=255) gCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAagag > 1:2581060/1‑100 (MQ=255) gCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAagag > 1:2047728/1‑100 (MQ=255) cgcgcgTGCCGGAGTAGAGCAgcgcggcagtgactggcgcgagcacagcgccacccgcatcgacgacctgatgctgaaaagcaaatatgcgccggatgag < 1:1933512‑M2/100‑80 (MQ=255) cgcgcgTGCCGGAGTAGAGCAgcgcggcagtgactggcgcgagcacagcgccacccgcatcgacgacctgatgctgaaaagcaaatatgcgccggatgag < 1:1669061‑M2/100‑80 (MQ=255) cgatcttGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGt < 2:1002943/94‑1 (MQ=255) gTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGgc < 1:2038560/100‑1 (MQ=255) tGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGtagatcg > 1:1002948/1‑94 (MQ=255) ccGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGgctga > 1:150267/1‑100 (MQ=255) ccGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGgctga > 1:1565763/1‑100 (MQ=255) ccGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCACCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAACAGGTTGGgctga > 2:1805222/1‑100 (MQ=255) ggAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGgctgagc < 1:1547289/100‑1 (MQ=255) tAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGAc < 2:1500289/100‑1 (MQ=255) agagCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCTCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGTCTGAGCTGAca < 2:863209/100‑2 (MQ=255) gagCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCt > 2:1100234/1‑100 (MQ=255) gcagcGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTc > 1:1672935/1‑100 (MQ=255) cagcGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTcc < 2:1281699/100‑1 (MQ=255) cagcGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGCGCTGAGCTGACCTTcn < 2:2217111/100‑2 (MQ=255) | TGCACCTCATCCGGCGCATATTTGCTTTTCAGCATCAGGTCGTCGATGCGGGTGGCGCTGTGCTCGCGCCAGTCACTGCCGCGCGTGCCGGAGTAGAGCAGCGCGGTGCCAAAACCGTTGTCCGCTGTGCCGCCCACCATCAGGTTGTGCGTCTCTTTCGGGTTGTTTTGTGAAGAGGTTGGGCTGAGCTGACCTTCC > NC_000913/4515695‑4515892 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |