| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1811350 | 45 (0.550) | 8 (0.110) | 7/166 | NT | 15.5% | coding (417/1392 nt) | ydjN | putative transporter |
| ? | NC_000913 | = 1811371 | 45 (0.590) | coding (438/1392 nt) | ydjN | putative transporter | |||||
TGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCG > NC_000913/1811253‑1811449 | tGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑ggg < 1:2149968/100‑1 (MQ=255)tGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑ggg < 1:2151981/100‑1 (MQ=255)tGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑ggg < 2:347020/100‑1 (MQ=255) gACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑Gggt > 2:436336/1‑100 (MQ=255) ccATCGTTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑Gggt < 2:18397/98‑1 (MQ=255) tgTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCATCCTGTTTGGTTGGACCGCTGATGGTCTGGTTCA‑‑GGGTTGTGCAg > 2:306800/2‑100 (MQ=255) gaaCGCTTTTGTTAACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGAGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGa > 1:1513498/3‑100 (MQ=255) gTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGa > 1:887064/1‑100 (MQ=255) aCGCTTTTGTTCACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGCTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑TGGTGGTGCAGaaa < 2:1382061/100‑1 (MQ=255) cGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAAc < 1:572806/100‑1 (MQ=255) gCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGGGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAgtttc < 1:1810248/99‑5 (MQ=255) gCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACt < 1:1201143/100‑1 (MQ=255) cTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTg > 1:2144689/1‑100 (MQ=255) tttGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCa < 1:2175158/100‑1 (MQ=255) tttACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGtggtgcagtttctgcaccac < 1:981883‑M1/100‑21 (MQ=255) tttACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTc > 1:1289762‑M2/1‑99 (MQ=255) ttAGCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAGCCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGTTTCTGCAccacc < 2:1564148/100‑5 (MQ=255) tACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGtggtgcagtttctgcaccaccc < 1:708419‑M1/100‑23 (MQ=255) tACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTctg < 2:330515‑M2/100‑4 (MQ=255) aCCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAATGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTctga > 1:1576728‑M2/1‑96 (MQ=255) ccACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTctgaa < 2:573416‑M2/100‑6 (MQ=255) ccACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTctgaa > 2:840694‑M2/1‑95 (MQ=255) cACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTctgaac > 2:983163‑M2/1‑94 (MQ=255) aCGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACg > 2:1929705/1‑100 (MQ=255) aCGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACAGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACg < 2:17253/100‑1 (MQ=255) cTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑Gacgtgcagtttctgcaccaccctgaaccaga < 2:257844‑M1/100‑32 (MQ=255) cTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCa > 2:207267/1‑100 (MQ=255) tGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCC‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCAt > 2:1935963/1‑100 (MQ=255) tGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑Gacgtgcagtttctgcaccaccctgaaccagac < 1:264743‑M1/100‑33 (MQ=255) gATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑Gacgtgcagtttctgcaccaccctgaaccagacc < 2:1273446‑M1/100‑34 (MQ=255) gATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑Gacgtgcagtttctgcaccaccctgaaccagacc < 2:1273465‑M1/100‑34 (MQ=255) gATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑CGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCAtt < 2:1480854/100‑1 (MQ=255) aTTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCAt > 1:267580/1‑98 (MQ=255) tGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGaa < 2:564412/100‑1 (MQ=255) gcggcgCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGaaa > 2:1851817/1‑100 (MQ=255) cggcgCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑Gacgtgcagtttctgcaccaccctgaaccagaccttcag > 1:344474‑M1/1‑62 (MQ=255) gcTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAAc > 2:14570/1‑100 (MQ=255) cTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑Gacgtgcagtttctgcaccaccctgaaccagaccttcagccgtc < 2:344475‑M1/100‑44 (MQ=255) cTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACt > 1:1000550/1‑100 (MQ=255) tGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTa < 2:825876/100‑1 (MQ=255) tCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGt > 1:842493/1‑100 (MQ=255) gtgCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTa < 1:1063952/100‑1 (MQ=255) gtgCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTa > 2:1109684/1‑100 (MQ=255) tgCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTaa > 1:638012/1‑100 (MQ=255) gCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAATGTCTGGGTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAAGGCCCTTGAACGTAGCTATGTTGCTaa > 2:445231/1‑99 (MQ=255) gCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTaaa > 1:979226/1‑100 (MQ=255) tGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGt > 1:867770/1‑100 (MQ=255) ggTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGtc < 2:630088/100‑1 (MQ=255) tCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGtctc < 1:1929718/100‑1 (MQ=255) cACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTctct > 1:831046/1‑100 (MQ=255) aCCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCtctgatct < 1:388446/100‑1 (MQ=255) gtttggtttgACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGc < 1:982010/100‑1 (MQ=255) gtttggtttgACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGc < 1:1867710/100‑1 (MQ=255) gtttgACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGCGTTcc > 2:1922317/1‑100 (MQ=255) tttgACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGCGTTCCg > 2:1647296/1‑100 (MQ=255) ttgACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGCGTTCCGc > 2:321833/1‑100 (MQ=255) gACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTctgaaccagaccttcagccgtcaaaccaaacaggttggtgaccagcacaccgaccag < 2:344475‑M2/100‑58 (MQ=255) gCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGCGTTCCGCAGCTgg > 1:2009398/1‑100 (MQ=255) cTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTctgaaccagaccttcagccgtcaaaccaaacaggttggtgaccagcacaccgaccagcgccg > 1:344474‑M2/1‑38 (MQ=255) cTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGCGTTCCGCAGCTGGt < 1:1330554/100‑1 (MQ=255) gAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGCGTTCCGCAGCTGGTCt < 2:867769/100‑1 (MQ=255) gAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGCGTTCCGCAGCTGGTCt < 1:436335/100‑1 (MQ=255) ggTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTctgaaccagaccttcagccgtcaaaccaaacaggttggtgaccagcacaccgaccagcgccgcaatc < 2:1273446‑M2/100‑68 (MQ=255) ggTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTctgaaccagaccttcagccgtcaaaccaaacaggttggtgaccagcacaccgaccagcgccgcaatc < 2:1273465‑M2/100‑68 (MQ=255) ggTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGt > 1:1387168/1‑100 (MQ=255) gTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTctgaaccagaccttcagccgtcaaaccaaacaggttggtgaccagcacaccgaccagcgccgcaatca < 1:264743‑M2/100‑69 (MQ=255) tCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTctgaaccagaccttcagccgtcaaaccaaacaggttggtgaccagcacaccgaccagcgccgcaatcag < 2:257844‑M2/100‑70 (MQ=255) tCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTcc < 1:573415/100‑1 (MQ=255) tCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTcc < 2:1821750/100‑1 (MQ=255) ggTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCttt > 1:1368046/1‑100 (MQ=255) gTTCA‑‑Gacgtgcagtttctgcaccaccctgaaccagaccttcagccgtcaaaccaaacaggttggtgaccagcacaccgaccagcgccgcaatcagcgtg > 2:983163‑M1/1‑6 (MQ=255) ttCA‑‑Gacgtgcagtttctgcaccaccctgaaccagaccttcagccgtcaaaccaaacaggttggtgaccagcacaccgaccagcgccgcaatcagcgtgg < 2:573416‑M1/100‑96 (MQ=255) ttCA‑‑Gacgtgcagtttctgcaccaccctgaaccagaccttcagccgtcaaaccaaacaggttggtgaccagcacaccgaccagcgccgcaatcagcgtgg > 2:840694‑M1/1‑5 (MQ=255) tCA‑‑Gacgtgcagtttctgcaccaccctgaaccagacattcagccgtcaaaccaaacaggttggtgaccagcacaccgaccagcgccgcaatcagcgtggt > 1:1576728‑M1/1‑4 (MQ=255) cA‑‑Gacgtgcagtttctgcaccaccctgaaccagaccttcagccgtcaaaccaaacaggttggtgaccagcacaccgaccagcgccgcaatcagcgtggta < 2:330515‑M1/100‑98 (MQ=255) cA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATcc > 1:1985498/1‑100 (MQ=255) cA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATcc < 2:694249/100‑1 (MQ=255) a‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATccc < 1:330514/100‑1 (MQ=255) tgggTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATccc < 1:1897381/99‑1 (MQ=255) gggTGGTGCAGAAACTGCACCAccctgaaccagaccttcagccgtcaaaccaaacaggttggtgaccagcacaccgaccagcgccgcaatcagcgtggta < 1:708419‑M2/100‑79 (MQ=255) gacgtgcagtttctgcaccaccctgaaccagaccttcagccgtcaaaccaaacaggttggtgaccagcacaccgaccagcgccgcaatcagcgtggtaaa > 1:1289762‑M1/1‑1 (MQ=255) | TGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCA‑‑GGGTGGTGCAGAAACTGCACGTCTGAACGCCATTGAAAGTAACTATGTTGGTAAAGTCTCTGATCTGAGCGTTCCGCAGCTGGTCTTGTCCTTTATCCCG > NC_000913/1811253‑1811449 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |