| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 732470 = | 48 (0.590) | 10 (0.130) | 5/168 | NT | 19.4% | coding (2888/4194 nt) | rhsC | Rhs protein with putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | 732512 = | 38 (0.490) | coding (2930/4194 nt) | rhsC | Rhs protein with putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
GGCTGACAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGCGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGTGAA > NC_000913/732413‑732609 | ggtcgtaaagatagcgactttcgaccagcggctctgcatattgtgtccgcgtgtagtGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCa > 1:1388562‑M1/58‑100 (MQ=255) gtcgtaaagatagcggctttcgaccagcggctctgcatattgtgtccgcgtgtagtGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCAc > 1:2136397‑M1/57‑100 (MQ=255) gtcgtaaagatagcgactttcgaccagcggctctgcatattgtgtccgcgtgtagtGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCAc > 1:543203‑M1/57‑100 (MQ=255) gtcgtaaagatagcgactttcgaccagcggctctgcatattgtgtccgcgtgtagtGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCAc > 2:1958528‑M1/57‑100 (MQ=255) gCTGACAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGCGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCAc < 1:214991/100‑1 (MQ=32) gCTGACAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGCGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCAc < 1:2095534/100‑1 (MQ=32) tcgtaaagatagcggctttcgaccagcggctctgcatattgtgtccgcgtgtagtGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACt > 1:381337‑M1/56‑100 (MQ=255) cTGACAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGCGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACt < 1:856386/100‑1 (MQ=33) tGACAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGCGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTa > 2:191774/1‑100 (MQ=32) aCAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGCGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTa > 2:593995/1‑98 (MQ=32) cAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGCGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTacac > 1:1040861/1‑100 (MQ=31) cAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGCGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTacac > 2:1165465/1‑100 (MQ=31) agagAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGCGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTaca > 1:145651/1‑98 (MQ=11) agatagcgactttcgaccagcggctctgcatattgtgtccgcgtgtagcGCACCCACCGGTACCATAACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACAcg > 2:77013‑M1/50‑99 (MQ=255) ccGCACGGATGATGAGCGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGt > 1:308178/1‑100 (MQ=11) ccGCACGGATGATGAGCGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGt > 1:2160151/1‑100 (MQ=11) cACGGATGATGAGCGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGc > 2:599961/1‑100 (MQ=32) cACGGATGATGAGCGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGc < 1:2227530/100‑1 (MQ=32) gatgatGAGCGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATc < 1:850990/100‑1 (MQ=32) gatgatGAGCGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATc > 1:1125178/1‑100 (MQ=32) cgtgtagtgcaccagccggtgctgactgtcgttatggtaccggtgggtgcGCTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCt > 2:77013‑M2/51‑99 (MQ=255) atgaGCGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTa < 1:1821577/100‑1 (MQ=33) tgaGCGCACCCACCGGTACCATTACGACCGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTAc < 1:2133160/100‑1 (MQ=17) tgaGCGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTAc > 1:654227/1‑100 (MQ=33) agtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtaccggtgggtgcACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGCCGCTATCTTTACGa > 1:381337‑M2/46‑100 (MQ=255) gtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtaccggtgggtgcACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGAc > 1:543203‑M2/45‑100 (MQ=255) gtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtaccggtgggtgcACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGAc > 2:1958528‑M2/45‑100 (MQ=255) gtgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtaccggtgggtgcACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGCCGCTATCTTTACGAc > 1:2136397‑M2/45‑100 (MQ=255) tgcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtaccggtgggtgcACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGAcc > 1:1388562‑M2/44‑100 (MQ=255) cgcACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGAc < 2:202289/99‑1 (MQ=32) gcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtaccggtgggtgcACTACACGCGGATACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGCCGCTATCTTTACGAccc > 2:1957447‑M2/43‑100 (MQ=255) gcaccagccggtgctgactgtcgtaatggtaccggtgggtgcACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGCCGCTATCTTTacgcc > 2:1803547‑M2/43‑96 (MQ=255) GCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGAccc > 2:702599‑M1/1‑100 (MQ=255) caccagccggtgctgactgtcgtaatggtaccggtgggtgcACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCg > 2:379085‑M2/42‑100 (MQ=255) ACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGc > 2:1932056‑M1/1‑100 (MQ=255) CCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGc < 2:1251450‑M1/99‑1 (MQ=255) caccGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTgg > 1:625411/1‑100 (MQ=32) accGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTggg < 1:2020865/100‑1 (MQ=33) ccGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGc < 2:2148405/100‑1 (MQ=33) ggTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTTCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGccc > 1:751053/1‑99 (MQ=12) tACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCa < 1:600617/100‑1 (MQ=33) gctgactgtcgtaatggtaccggctggtgcACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAg > 2:740817‑M2/31‑100 (MQ=255) ccATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAgg > 1:1467073/1‑100 (MQ=33) cATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCTGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTCTACGACCCGCTGGGCCGCAggg > 2:659505/1‑100 (MQ=12) ttACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACGATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGt < 2:446906/99‑1 (MQ=17) tACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCAATCTTTACGACCCGCTAGGCCGCAGGGTgg > 2:473127/1‑100 (MQ=16) gcgtgtagtgCACCAGCCGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCa > 1:2228909/10‑100 (MQ=11) cGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCa > 1:57812/1‑100 (MQ=32) gtgtcgtgCACCAGCCGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTCACGACCCGATGGGCCGCAGAGAGGCaaa > 2:1641528/8‑100 (MQ=11) tagtgCACCAGCCGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACg > 1:875748/5‑100 (MQ=11) gTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACg > 1:435933/1‑100 (MQ=32) tCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACgg > 2:2064455/1‑100 (MQ=32) agtgCACCAGCCGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACgg > 2:478112/4‑100 (MQ=11) agtgCACCAGCCGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACgg > 1:992377/4‑100 (MQ=11) gtgCACCAGCCGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACggg > 1:1331380/3‑100 (MQ=255) cAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACggg > 2:1825917/1‑100 (MQ=33) cAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACggg > 1:215900/1‑100 (MQ=33) aGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGt < 1:2045672/100‑1 (MQ=32) aGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGt < 1:599961/100‑1 (MQ=32) gCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGt < 2:623659/99‑1 (MQ=32) gCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTa > 1:507025/1‑100 (MQ=35) ccGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATgg < 2:626992/100‑1 (MQ=35) cGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATggc > 1:1359321/1‑100 (MQ=35) gtcTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATggcg < 2:976518/98‑1 (MQ=38) ggCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATggcg > 2:1985659/1‑100 (MQ=35) gCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATggcgg > 1:1685111/1‑100 (MQ=38) tGGTTCACTACACGCGGACACAATGTGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGgcggcg < 2:2018296/100‑1 (MQ=255) tGGTGCACTACACCCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAACCGGGTATGgcggcg < 2:935681/100‑1 (MQ=255) ggtgcACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGgcggcg > 2:848797‑M2/6‑99 (MQ=255) ggtgcACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGt > 2:931046‑M2/6‑100 (MQ=255) gtgcACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCCCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGt > 1:2148596‑M2/5‑99 (MQ=255) tgcACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGTGa > 1:547211‑M2/4‑100 (MQ=255) tgcACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGTGa > 2:798538‑M2/4‑100 (MQ=255) gcACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGTGaa > 2:1711857‑M2/3‑100 (MQ=255) | GGCTGACAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGCGCACCCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGTGAA > NC_000913/732413‑732609 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |