| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | 100748 = | 128 (0.360) | 276 (0.830) | 156/284 | 0.7 | 70.9% | coding (647/1020 nt) | gpsA | glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+)) |
| ? | DH1 | = 100792 | 105 (0.320) | coding (691/1020 nt) | gpsA | glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+)) | |||||
Only 100 of 644 total aligned reads displayed.
ATCTCCAGCAGCTGCTGCACTGCGGCAAAAGTTTCCGCGTTTACAGCAATCCGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCAGTCGCGTAACCGCCGTTTTGGCATGAT > DH1/100598‑100898 | gcaatccggatttcattggcgtgcagcttggcggcgcggtgaaaaacgttattgccattggtgcggggatgtccgacggtatcggttttggtgcgaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgc < 6:1047848‑M1/1‑1 (MQ=255) ctcCAGCAGCTGCTGCACTGCGGCAAAAGTTTCCGCGTTTACAGCAATCCGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACgg > 5:410595/1‑151 (MQ=255) ctcCAGCAGCTGCTGCACTGCGGCAAAAGTTTCCGCGTTTACAGCAATCCGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACgg > 8:479618/1‑151 (MQ=255) ccAGCAGCTGCTGCACTGCGGCAAAAGTTTCCGCGTTTACAGCAATCCGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGgc < 8:683806/150‑1 (MQ=255) cagcagCTGCTGCACTGCGGCAAAAGTTTCCGCGTTTACAGCAATCCGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGTGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGgcgc > 6:80045/1‑151 (MQ=255) cggatttcattggcgtgcagcttggcggcgcggtgaaaaacgttattgccattggtgcggggatgtccgacggtatcggttttggtgcgaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCt < 7:849702‑M1/7‑1 (MQ=255) cggatttcattggcgtgcagcttggcggcgcggtgaaaaacgttattgccattggtgcggggatgtccgacggtatcggttttggtgcgaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCt > 2:71655‑M1/145‑151 (MQ=255) ggatttcattggcgtgcagcttggcggcgcggtgaaaaacgttattgccattggtgcggggatgtccgacggtatcggttttggtgcgaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTg < 8:1052674‑M1/8‑1 (MQ=255) cagcTGCTGCACTGCGGCAAAAGTTTCCGCGTTTACAGCAATCCGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTgc > 5:1305757/1‑150 (MQ=255) cagcTGCTGCACTGCGGCAAAAGTTTCCGCGTTTACAGCAATCCGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGAGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGCGTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTg > 3:1165241/1‑150 (MQ=255) agcTGCTGCACTGCGGCAAAAGTTTCCGCGTTTACAGCAATCCGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGAt > 3:533930/1‑151 (MQ=255) ttcattggcgtgcagcttggcggcgcggtgaaaaacgttattgccattggtgcggggatgtccgacggtatcggttttggtgcgaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGcgctgctcc < 4:28175‑M1/12‑5 (MQ=255) ttcattggcgtgcagcttggcggcgcggtgaaaaacgttattgccattggtgcggggatgtccgacggtatcggttttggtgcgaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGcgctgctcc < 3:383318‑M1/12‑5 (MQ=255) tcattggcgtgcagcttggcggcgcggtgaaaaacgttattgccattggtgcggggatgtccgacggtatcggttttggtgcgaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCAc < 5:879782‑M1/13‑1 (MQ=255) gctgcACTGCGGCAAAAGTTTCCGCGTTTACAGCAATCCGGATTTCATTGTCGTGCAGCTTGGCGGGGCGGTGAAAAACGTTATTGGCATTGGTGCGGGGATGTCCGAAGGTATCTGTTTTGGTGAGAATTCTCGTACTGCGCTGATCAcc > 7:392407/1‑151 (MQ=255) tgcACTGCGGCAAAAGTTTCCGCGTTTACAGCAATCCGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCg > 7:216668/1‑151 (MQ=255) gcACTGCGGCAAAAGTTTCCGCGTTTACAGCAATCCGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCAccc < 8:1145604/149‑1 (MQ=255) ggcgtgcagcttggcggcgcggtgaaaaacgttattgccattggtgcggggatgtccgacggtatcggttttggtgcgaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTg < 7:1302437‑M1/18‑1 (MQ=255) ggcgtgcagcttggcggcgcggtgaaaaacgttattgccattggtgcggggatgtccgacggtatcggttttggtgcgaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTg > 3:1247371‑M1/134‑151 (MQ=255) cACTGCGGCAAAAGTTTCCGCGTTTACAGCAATCCGGATTTCATTGGCGGGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTg < 8:1335965/151‑1 (MQ=255) aCTGCGGCAAAAGTTTCCGCGTTTACAGCAATCCGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTgg > 7:1090637/1‑151 (MQ=255) gCGGCAAAAGTTTCCGCGTTTACAGCAATCCGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGggct < 8:540022/151‑1 (MQ=255) gcagcttcgcggcgcggtgaaaaacggtattgccattggtgcggggatgtccgacggtatcgggtttggtgcgaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGggct > 7:728476‑M1/129‑150 (MQ=255) agcttggcggcgcggtgaaaaacgttattgccattggtgcggggatgtccgacggtatcggttttggtgcgaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGggctggc < 2:337191‑M1/25‑1 (MQ=255) gcttggcggcgcggtgaaaaagcttcttgccattggtgcggtgatgtccgacggtatcggttttggggcgaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGggctggct > 2:121057‑M1/126‑151 (MQ=255) cAAAAGTTTCCGCGTTTACAGCAATCCGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGggctggct < 2:844331/151‑1 (MQ=255) cAAAAGTTTCCGCGTTTACAGCAATCCGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGggctggct > 6:447289/1‑151 (MQ=255) tgggggcgcggtgaaaaacgttattgccattggtgcggggatgtccgacggtatcggttttggtgcgaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGa > 5:80798‑M1/123‑150 (MQ=255) aaGTTTCCGCGTTTACAGCAATCCGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGaa < 8:167643/151‑1 (MQ=255) cggcgcggtgaaaaacgttattgccattggtgcggggatgtccgacggtatcggttttggtgcgaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATg < 6:885166‑M1/32‑1 (MQ=255) ggcgcggtgaaaaacgttattgccattggtgcggggatgtccgacggtatcggttttggtgcgaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGt > 7:516538‑M1/119‑151 (MQ=255) gcgcggtgaaaaacgttattgccattggtgcggggatgtccgacggtctcggttttggtgcgaatgcgcttacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTc > 5:572028‑M1/118‑151 (MQ=255) gTTTACAGCAATCCGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGAGGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGATATGTCGCGtg > 8:338421/1‑150 (MQ=255) 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ccGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGcggcgctgatcaccccaggtctggctgaaatgtcgcgtcatggtccggcgctgggtgccgacactgccacctt < 1:502626‑M2/151‑74 (MQ=255) gACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGcggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatggcgcgtcttggtgcggcgctgggtgccgaccctgccaccgtt < 8:797437‑M2/150‑75 (MQ=255) tgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAAc < 5:694113‑M1/122‑1 (MQ=255) gggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGAGTCTTGGTGCTGCGCTGCTTGCCGACCCTGCCACCTTAATGGGCATGGCGGGGCTTGGAGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAAcc < 4:811611‑M1/123‑1 (MQ=255) ggctggctgaactgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCa > 2:634303‑M1/28‑151 (MQ=255) ggctggctgaaatggcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCa > 4:533911‑M1/28‑151 (MQ=255) aTCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTAGCGTCTTGGTGcggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgcggcgctgggtgccgaccctgccacctttatgggc < 6:355906‑M2/150‑81 (MQ=255) tggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACATCCAGTc < 7:559795‑M1/127‑1 (MQ=255) ggtttggTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGGGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGcggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgcggcgctgggtgccgaccctgccacctttatgggcatggc > 8:187839‑M2/3‑66 (MQ=255) tttGGTGCGAATGCGCGTACGACGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGcggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgcggcgctgggtgccgaccctgccacctttatgggcatggcg > 6:1269176‑M2/1‑64 (MQ=255) ttGGGGCGATTGCGCGTACGGCGCGGATCACCCGTGGGCTGGCTGAACTGTCGCGTCTTGGTGcggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgcggcgctgggtgccgaccctgccacctttatgggcatggcgg > 4:752250‑M2/1‑63 (MQ=255) aaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGCCCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTCTACCGACAACCAGTCGCGTa < 2:89063‑M1/132‑1 (MQ=255) aaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCAGTCGCGTaa > 4:389931‑M1/19‑151 (MQ=255) ggcGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGcggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgcggcgctgggtgccgaccctgccacctttatgggcatggcggggctt > 3:818645‑M2/2‑59 (MQ=255) gcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCAGTCGCGTAaccgccgg < 7:301616‑M1/140‑2 (MQ=255) gtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGGCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCAGTCGCGTAACCGCCGttt > 5:213878‑M1/10‑151 (MQ=255) gcgcGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCAGTCGCGTAACCGCCGtttt < 1:1240227/150‑1 (MQ=255) cttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCAGTCGCGTAACCGCCGTTTTg < 8:1184126‑M1/144‑1 (MQ=255) ttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCAGTCGCGTAACCGCCGTTTTgg < 5:1005553‑M1/145‑1 (MQ=255) gcgTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGcggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgcggcgctgggtgccgaccctgccacctttatgggcatggcggggcttggcgatctg > 1:178925‑M2/1‑50 (MQ=255) ggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCAGTCGCGTAACCGCCGTTTTGGCa > 7:1174783‑M1/5‑151 (MQ=255) gCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCAGTCGCGTAACCGCCGTTTTGGCatga > 1:1144458‑M1/2‑151 (MQ=255) | ATCTCCAGCAGCTGCTGCACTGCGGCAAAAGTTTCCGCGTTTACAGCAATCCGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCAGTCGCGTAACCGCCGTTTTGGCATGAT > DH1/100598‑100898 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |