New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | DH1 | = 100792 | 105 (0.320) | coding (691/1020 nt) | gpsA | glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+)) |
Only 100 of 642 total aligned reads displayed.
AGCAATCCGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCAGTCGCGTAACCGCCGTTTTGGCATGATGCTCGGTCAGGGCATGGATGTACAAAGCGCGCAGGAGAAGATTG > DH1/100642‑100942 | aGCAATCCGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTg < 8:642614/151‑1 (MQ=255) aTCCGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGcggc > 1:301877‑M2/1‑147 (MQ=255) tattgccattggtgcggggatgtccgacggtatcggttttggtgcgaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCCTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTgcggcg < 2:896828‑M1/50‑1 (MQ=255) tattgccattggtgcggggatgtccgacggtatcggttttggtgcgaatgcgagtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCCTGGGCTGGCTCAAATGTCGCGGCTTGGGgctgcg < 1:886885‑M1/50‑1 (MQ=255) cGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGcggcgct > 3:1156977‑M2/1‑144 (MQ=255) cGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCACTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGcggcgct > 1:998585‑M2/1‑144 (MQ=255) ggATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGcggcgctg < 4:427710‑M2/151‑9 (MQ=255) gccattggtgcggggatgtccgacggtatcggttttggtgcgaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTgg < 6:621348‑M1/54‑1 (MQ=255) cattggtgcggggatgtccgccgggatcggttttggtgcgaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGt > 5:285888‑M1/96‑151 (MQ=255) ttCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGcggcgctgctcc < 3:383318‑M2/151‑13 (MQ=255) tCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGcggcgctgatcac < 5:873645‑M2/151‑14 (MQ=255) tggtgcggggatgtccgacggtatcggttttggtgcgaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGcc < 6:47568‑M1/59‑1 (MQ=255) tggtgcggggatgtccgacggtatcggttttggtgcgaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGcc < 3:787352‑M1/59‑1 (MQ=255) 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atcggttttggtgcgaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGAGCCTGCCACCTTTATGGGc < 7:1149433‑M1/80‑1 (MQ=255) tcggttttggtgcgaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCCCCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCAt < 1:1035041‑M1/82‑1 (MQ=255) gTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGcggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtg < 8:1186039‑M2/151‑40 (MQ=255) gAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGcggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtctt < 7:1101441‑M2/151‑42 (MQ=255) aaaaCGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGcggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttgg > 1:167888‑M2/1‑108 (MQ=255) 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gaatgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGc > 5:1373446‑M1/57‑151 (MQ=255) atgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGCGCATGGCGGGGCTTGGCg < 6:1387175‑M1/96‑1 (MQ=255) tgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGAt < 6:823141‑M1/98‑1 (MQ=255) tgcgcgtacggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgCGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGAt < 7:1270824‑M1/98‑1 (MQ=255) aTTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGcggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgcggcgctgggtg < 2:857549‑M2/151‑58 (MQ=255) 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tggctgAAATGTCGCGTCTTGGTGcggcgctgatcacccgtgggctggcggaaatgtcgcgtcttggtgcggcgctgggtgccgaccctgccacctttatgggcatggcggggcttggggatctggtgcttacctgtaccgacaaccagtc < 1:1308989‑M2/151‑128 (MQ=255) ggctgAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCAGTCGCGTAACCGCCGTTTTGGCATGATGCTCGGTCAGGGCATGGATGTa < 4:723159/151‑1 (MQ=255) gctgAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCAGTCGCGTAACCGCCGTTTTGGCATGATGCTCGGTCAGGGCATGGATGTAc > 8:1108712/1‑151 (MQ=255) gAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCAGTCGCGTAACCGCCGTTTTGGCATGATGCTCGGTCAGGGCATGGATGTACaaa < 5:437316/151‑1 (MQ=255) gAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCAGTCGCGTAACCGCCGTTTTGGCATGATGCTCGGTCAGGGCATGGATGTACaaa < 6:1193610/151‑1 (MQ=255) aaaTGTCGCGTCTTGGTGcggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgcggcgctgggtgccgaccctgccacctttatgggcatggcggggcttggcgatctggtgcttacctgtaccgacaaccagtcgcgtac < 3:958108‑M2/151‑134 (MQ=255) aTGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCAGTCGCGTAACCGCCGTTTTGGCATGATGCTCGGTCAGGGCATGGATGTACAAAgcg < 3:682948/151‑1 (MQ=255) tGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCAGTCGCGTAACCGCCGTTTTGGCATGATGCTCGGTCAGGGCATGGATGTACAAAgcgc > 2:3410/1‑151 (MQ=255) gTCGCGTCTTGGTGcggcgctgatcacccgtgggctggctgaaatgtcgcgtcttggtgcggcgctgggtgccgaccctgccacctttatgggcatggcggggcttggcgatctggtgcttacctgtaccgacaaccagtcgcgtaaccg > 7:744853‑M2/1‑14 (MQ=255) gcgTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCAGTCGCGTAACCGCCGTTTTGGCATGATGCTCGGTCAGGGCATGGATGTACAAAgcgcgc > 1:40811/1‑149 (MQ=255) 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tGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCAGTCGCGTAACCGCCGTTTTGGCATGATGCTCGGTCAGGGCATGGATGTACAAAGCGCGCAGGagaa < 8:208727/150‑1 (MQ=255) ggTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCAGTCGCGTAACCGCCGTTTTGGCATGATGCTCGGTCAGGGCATGGATGTACAAAGCGCGCAGGagaaga < 6:1231100/151‑1 (MQ=255) | AGCAATCCGGATTTCATTGGCGTGCAGCTTGGCGGCGCGGTGAAAAACGTTATTGCCATTGGTGCGGGGATGTCCGACGGTATCGGTTTTGGTGCGAATGCGCGTACGGCGCTGATCACCCGTGGGCTGGCTGAAATGTCGCGTCTTGGTGCGGCGCTGGGTGCCGACCCTGCCACCTTTATGGGCATGGCGGGGCTTGGCGATCTGGTGCTTACCTGTACCGACAACCAGTCGCGTAACCGCCGTTTTGGCATGATGCTCGGTCAGGGCATGGATGTACAAAGCGCGCAGGAGAAGATTG > DH1/100642‑100942 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |