| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | 258175 = | 13 (0.040) | 380 (1.090) | 200/298 | 0.0 | 95.5% | intergenic (+91/+74) | yhhJ/yhhI | inner membrane transport permease YhhJ/H repeat‑associated protein yhhI |
| ? | DH1 | 285831 = | 23 (0.070) | intergenic (‑52/‑372) | panM/livK | pantothenate synthesis PanD autocleavage accelerator/branched chain amino acid ABC transporter substrate‑binding protein | |||||
Only 100 of 398 total aligned reads displayed.
GGCGCATTTTTCACCATTGCGCTGCTGCGATTCAGGAAGACGATTGGGACAATGGCGTAAATACAATTGCCCGATGCGTAAGCTTATAGGGACTACGCATCGGTGCAATTTATTGAATTTTAGTTGTTTTTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTCAGGGCAAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGACTGACGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCTTTTCGCATCTTACGTCTT > DH1/258025‑258324 | taaaataacggcacaaagggcggaataattcactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatt < 3:284010‑M1/1‑1 (MQ=255) aaaataacggcacaaagggcggaataattcactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTg < 1:600672‑M1/2‑1 (MQ=255) aaataacggcacaaagggcggaataattcactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTg < 3:1154311‑M1/2‑1 (MQ=255) aaataacggcacaaagggcggaataattcactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaaggttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTg < 5:193745‑M1/2‑1 (MQ=255) aacggcacaaagggcggaataattcactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACt > 4:1196927‑M1/145‑150 (MQ=255) aacggcacaaagggcggaataattcactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACt > 4:239530‑M1/145‑150 (MQ=255) aacggcacaaagggcggaataattcactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACt > 5:409946‑M1/145‑150 (MQ=255) acaaagggcggaataattcactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACTGAccccc < 7:133277‑M1/13‑1 (MQ=255) agggcggaataattcactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCaaaa > 2:1281680‑M1/135‑151 (MQ=255) gggcggaataattcactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCAAAAc > 5:740686‑M1/134‑151 (MQ=255) ggaataattcactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTgg < 6:697858‑M1/22‑1 (MQ=255) aataattcactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGAc > 3:959017‑M1/128‑151 (MQ=255) ataattcactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGAc < 7:262788‑M1/24‑1 (MQ=255) 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aaagagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTCAGGGCAAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGACTGACGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCtt > 6:379886‑M1/19‑151 (MQ=255) agagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTCAGGGCAAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGACTGACGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCtttt < 2:245310‑M1/135‑1 (MQ=255) agagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTCAGGGCAAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGACTGACGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCtttt > 1:309757‑M1/17‑151 (MQ=255) gagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTCAGGGCAAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGACTGACGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCTTTTc > 5:522303‑M1/16‑151 (MQ=255) gagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTCAGGGCAAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGACTGACGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCTTTTc < 6:1021796‑M1/136‑1 (MQ=255) 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ccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTCAGGGCAAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGACTGACGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCTTTTCGCATCTTACg < 4:1032424‑M1/146‑1 (MQ=255) ccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTCAGGGCAAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGACTGACGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCTTTTCGCATCTTACg < 6:432699‑M1/146‑1 (MQ=255) | GGCGCATTTTTCACCATTGCGCTGCTGCGATTCAGGAAGACGATTGGGACAATGGCGTAAATACAATTGCCCGATGCGTAAGCTTATAGGGACTACGCATCGGTGCAATTTATTGAATTTTAGTTGTTTTTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTCAGGGCAAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGACTGACGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCTTTTCGCATCTTACGTCTT > DH1/258025‑258324 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |