| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | 258175 = | 13 (0.040) | 380 (1.090) | 200/298 | 0.0 | 95.5% | intergenic (+91/+74) | yhhJ/yhhI | inner membrane transport permease YhhJ/H repeat‑associated protein yhhI |
| ? | DH1 | 285831 = | 23 (0.070) | intergenic (‑52/‑372) | panM/livK | pantothenate synthesis PanD autocleavage accelerator/branched chain amino acid ABC transporter substrate‑binding protein | |||||
Only 100 of 758 total aligned reads displayed.
AACCTGTAACGAGGAAGGGGAATACTCCGGCCAGATCTTTTGCAGGTCAATCCGGTCTTGGTCGCTAAATTTTTCTAATCGAATGATGGTCAGCTTCATGGGTAACCCGTGTAAATCACAAAAGTGGAACCAGTGTAGCGAAATAATTTAATCGGAGGCTTTCTCTTTTTTATTTCTTTTGGCAGGTGATTAATTTTTTAACAGCAATAATT‑ACAAAATTAAAACATTAGAGAATGAAAAATGTCCAGCATAATCCCCTGAATGATAGTGAATTATTCCGCCCTTTGTGCCGTTATTTTAT > DH1/285681‑285981 | aagacgtaagatgcgaaaagcagccatggacagaaactatctggcgtcagtccttgcggggagcgggctttcgtaatcttgccctgaatacaggactgagtatcaaaaagccggttaactgaaactgtccaggttttgggggtcagttcaa < 2:275546‑M2/1‑1 (MQ=255) gacgtaagatgcgaaaagcagccatggacagaaactatctggcgtcagtccttgcggggagcgggctttcgtaatcttgccctgaatacaggactgagtatcaaaaagccggttaactgaaactgtccaggttttgggggtcagttcaATc < 3:1332144‑M2/3‑1 (MQ=255) cgtaagatgcgaaaagcagccatggacagaaactatctggcgtcagtccttgcggggagcgggctttcgtaatcttgccctgaatacaggactgagtatcaaaaagccggttaactgaaactgtccaggttttgggggtcagttcaATCgg > 4:694365‑M2/147‑151 (MQ=255) cgtaagatgcgaaaagcagccatggacagaaactatctggcgtcagtccttgcggggagcgggctttcgtaatcttgccctgaatacaggactgagtatcaaaaagccggttaactgaaactgtccaggttttgggggtcagttcaATCgg < 6:432699‑M2/5‑1 (MQ=255) aagctgcgaaaagcagccatcgacagaaactatcgggcggcagtccttgcggggagcgggctttcgtaatcttgccctgaatacaggactgagcatcaaaaagccggttaactgaaactgtccaggttttgggggtcagttcaATCGGa < 8:1118727‑M2/6‑1 (MQ=255) aagatgcgaaaagcagccatggacagaaactatctggcgtcagtccttgcggggagcgggctttcgtaatcttgccctgaatacaggactgagtatcaaaaagccggttaactgaaactgtccaggttttgggggtcagttcaATCGGAgg < 8:456041‑M2/8‑1 (MQ=255) aagatgcgaaaagcagccatggacagaaactatctggcgtcagtccttgcggggagcgggctttcgtaatcttgccctgaatacaggactgagtatcaaaaagccggttaactgaaactgtccaggttttgggggtcagttcaATCGGAgg > 7:685191‑M2/144‑151 (MQ=255) gAGGAAGGGGAATACTCCGGCCAGATCTTTTGCAGGTCAATCCGGTCTTGGTCGCTAAATTTTTCTAATCGAATGATGGTCAGCTTCATGGGTAACCCGTGTAAATCACAAAAGTGGAACCAGTGTAGCGAAATAATTTAATCtgtactgc < 5:1098954‑M2/151‑9 (MQ=255) 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tCTTTTGCAGGTCAATCCGGTCTTGGTCGCTAAATTTTTCTAATCGAATGATGGTCAGCTTCATGGGTAACCCGTGTAAATCACAAAAGTGGAACCAGTGTAGCGAAATAATTTAATCtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatg < 8:641551‑M2/151‑34 (MQ=255) ctatctggcgtcagtccttgcggggagcgggctttcgtaatcttgccctgaatacaggactgagtatcaaaaagccggttaactgaaactgtccaggttttgggggtcagttcaATCGGAGGCTTTCTCTTTTTTATTTCTTTTGGCAGGt > 8:1329217‑M2/115‑151 (MQ=255) tttGCAGGTCAATCCGGTCTTGGTCGCTAAATTTTTCTAATCGACTGATGGTCAGCTTCATGGGTAACCCGTGTAAATCACAAAAGTGGAACCAGTGTAGCGAAATAATTTAATCtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatgg > 3:48516‑M2/1‑115 (MQ=255) tttGCAGGTCAATCCGGTCTTGGTCGCTAAATTTTTCTAATCGAATGATGGTCAGCTTCATGGGTAACCCGTGTAAATCACAAAAGTGGAACCAGTGTAGCGAAATAATTTAATCGGAGGCTTTCTCTTTTTTATTTCTTTTGGCAGGt < 4:1152867/149‑1 (MQ=255) gCAGGTCAATCCGGTCTTGGTCGCTAAATTTTTCTAATCGAATGATGGTCAGCTTCATGGGTAACCCGTGTAAATCACAAAAGTGGAACCAGTGTAGCGAAATAATTTAATCtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatag > 2:663911‑M2/1‑112 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |