| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | 258175 = | 10 (0.040) | 310 (1.140) | 179/298 | 0.0 | 94.0% | intergenic (+91/+74) | yhhJ/yhhI | inner membrane transport permease YhhJ/H repeat‑associated protein yhhI |
| ? | DH1 | 285831 = | 30 (0.110) | intergenic (‑52/‑372) | panM/livK | pantothenate synthesis PanD autocleavage accelerator/branched chain amino acid ABC transporter substrate‑binding protein | |||||
Only 100 of 327 total aligned reads displayed.
GGCGCATTTTTCACCATTGCGCTGCTGCGATTCAGGAAGACGATTGGGACAATGGCGTAAATACAATTGCCCGATGCGTAAGCTTATAGGGACTACGCATCGGTGCAATTTATTGAATTTTAGTTGTTTTTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTCAGGGCAAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGACTGACGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCTTTTCGCATCTTACGTCTT > DH1/258025‑258324 | taaaataacggcacaaagggcggaataattcactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatt < 3:501605‑M1/1‑1 (MQ=255) aaaataacggcacaaagggcggaataattcactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctgatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatt > 6:596978‑M1/150‑150 (MQ=255) aaaataacggcacaaagggcggaataattcactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatt > 8:566931‑M1/150‑150 (MQ=255) aaaataacggcacaaagggcggaataattcactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTg < 3:696932‑M1/2‑1 (MQ=255) aataacggcacaaagggctgaataattcactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGaa > 5:44011‑M1/148‑151 (MQ=255) aacggcacaaagggcggaataattcactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACTg > 1:55079‑M1/145‑151 (MQ=255) ttttCACCATTGCGCTGCTGCGATTCAGGAAGACGATTGGGACAATGGCGTAAATACAATTGCCCGATGCGTAAGCTTATAGGGACTACGCATCGGTGCAATTTATTGAATTTTAGTTGTTTTTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGAACTg < 1:807315/150‑1 (MQ=255) ggcacaaagggcggaataattcactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACTGAcc > 3:867963‑M1/142‑151 (MQ=255) acaaagggcggaataattcactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACTGAccccc < 3:134753‑M1/13‑1 (MQ=255) tGCGCTGCTGCGATTCAGGAAGACGATTGGGACAATGGCGTAAATACAATTGCCCGATGCGTAAGCTTATAGGGACTACGCATCGGTGCAATTTATTGAATTTTAGTTGTTTTTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGAACTGACCCCCAAAAc > 2:1027755/1‑151 (MQ=255) ggcggaataattctctatcattcaggggattatgctggacatttttcattctgtaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacgtgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCAAAAc > 2:559051‑M1/133‑150 (MQ=255) gctgaataattcactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCt > 5:833736‑M1/132‑151 (MQ=255) cactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTc < 5:956879‑M1/30‑1 (MQ=255) cactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCa > 4:261531‑M1/121‑151 (MQ=255) cactatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCa > 7:969736‑M1/121‑151 (MQ=255) ctatcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGt < 7:848784‑M1/33‑1 (MQ=255) atcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTa > 7:831749‑M1/117‑151 (MQ=255) tcattcaggggattatgctggacatttttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTa < 8:703279‑M1/35‑1 (MQ=255) 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ttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTAt < 3:943440‑M1/63‑1 (MQ=255) ttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTAt < 7:153066‑M1/63‑1 (MQ=255) ttcattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTAt < 4:755416‑M1/63‑1 (MQ=255) cattctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTc > 2:13878‑M1/87‑151 (MQ=255) attctctaatgttttaattttgtaattattgctgttaaaaaattaatcacctgccaaaagaaataaaaaagagaaagcctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTCa > 3:789745‑M1/86‑151 (MQ=255) 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gcctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGAAACTCAGTCCTGTATTCAGGGCAAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGACTGAGGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCTTTTCGCATCt > 7:116424‑M1/10‑151 (MQ=255) cctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTCAGGGCAAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGACTGACGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCTTTTCGCATCtt > 5:1027901‑M1/9‑151 (MQ=255) ctccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTCAGGGCAAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGACTGACGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCTTTTCGCATCtt < 6:33404‑M1/143‑1 (MQ=255) tccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTTTATTCACGGCAAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGACTGACGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCTTTTCGCATCTTAc < 6:736504‑M1/145‑1 (MQ=255) ccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTCAGGGCGAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGACTGACGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCTTTTCGCATCTTa > 2:754371‑M1/6‑149 (MQ=255) ccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTCAGGGCAAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGGCTGACGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCTTTTCGCATCTTa > 5:264651‑M1/6‑149 (MQ=255) ccgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTCAGGGCAAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGACTGACGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCTTTTCGCATCTTAc > 3:844952‑M1/6‑150 (MQ=255) cgatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTCAGGGCAAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGACTGACGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCTTTTCGCATCTTACGt < 3:252622‑M1/147‑1 (MQ=255) gatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTCAGGGCAAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGACTGACGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCTTTTCGCATCTTACGt < 4:150159‑M1/147‑1 (MQ=255) gatTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTCAGGGCAAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGACTGACGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCTTTTCGCATCTTACGTc < 5:800997‑M1/148‑1 (MQ=255) atTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTCAGGGCAAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGACTGACGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCTTTTCGCATCTTACGTCt < 1:313870‑M1/149‑1 (MQ=255) atTGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTCAGGGCAAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGACTGACGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCTTTTCGCATCTTACGTCt < 2:518059‑M1/149‑1 (MQ=255) | GGCGCATTTTTCACCATTGCGCTGCTGCGATTCAGGAAGACGATTGGGACAATGGCGTAAATACAATTGCCCGATGCGTAAGCTTATAGGGACTACGCATCGGTGCAATTTATTGAATTTTAGTTGTTTTTAGGCCGGATAAGGCGTTTATGAACTGACCCCCAAAACCTGGACAGTTTCAGTTAACCGGCTTTTTGATACTCAGTCCTGTATTCAGGGCAAGATTACGAAAGCCCGCTCCCCGCAAGGACTGACGCCAGATAGTTTCTGTCCATGGCTGCTTTTCGCATCTTACGTCTT > DH1/258025‑258324 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |