| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | 258175 = | 10 (0.040) | 310 (1.140) | 179/298 | 0.0 | 94.0% | intergenic (+91/+74) | yhhJ/yhhI | inner membrane transport permease YhhJ/H repeat‑associated protein yhhI |
| ? | DH1 | 285831 = | 30 (0.110) | intergenic (‑52/‑372) | panM/livK | pantothenate synthesis PanD autocleavage accelerator/branched chain amino acid ABC transporter substrate‑binding protein | |||||
Only 100 of 628 total aligned reads displayed.
AACCTGTAACGAGGAAGGGGAATACTCCGGCCAGATCTTTTGCAGGTCAATCCGGTCTTGGTCGCTAAATTTTTCTAATCGAATGATGGTCAGCTTCATGGGTAACCCGTGTAAATCACAAAAGTGGAACCAGTGTAGCGAAATAATTTAATCGGAGGCTTTCTCTTTTTTATTTCTTTTGGCAGGTGATTAATTTTTTAACAGCAATAATTACAAAATTAAAACATTAGAGAATGAAAAATGTCCAGCATAATCCCCTGAATGATAGTGAATTATTCCGCCCTTTGTGCCGTTATTTTAT > DH1/285681‑285981 | gtacggAGGAAGGGGAATACTCCGGCCAGATCTTTTGCAGGTCTATGGTGTCTTGGTCGCTAAATTTTTCTTATCGAATGATGGTCAGCTTGTTGTGTAACCCGTGTAAATCACAAAAGTGGAACGAGTGTAGGGAAATAATTTAATctg < 1:524489/145‑3 (MQ=255) aagatgcgaaaagcagccatggacagaaactatctggcgtcagtccttgcggggagcgggctttcgtaatcttgccctgaatacaggactgagtatcaaaaagccggttaactgaaactgtccaggttttgggggtcagttcaATCGGAg < 8:84706‑M2/7‑1 (MQ=255) aaGGGGAATACTCCGGCCAGATCTTTTGCAGGTCAATCCGGTCTTGGTCGCTAAATTTTTCTAATCGAATGATGGTCAGCTTCATGGGTAACCCGTGTAAATCACAAAAGTGGAACCAGTGTAGCGAAATAATTTAATCGGAGGCTTtctc > 5:326271/1‑151 (MQ=255) aaaagcagccatggacagaaactatctggcgtcagtccttgcggggagcgggctttcgtaatcttgccctgaatacaggactgagtatcaaaaagccggttaactgaaactgtccaggttttgggggtcagttcaATCGGAGGCTTTctct > 2:1060961‑M2/136‑151 (MQ=255) ggggAATACTCCGGCCAGATCTTTTGCAGGTCAATCCGGTCTTGGTCGCTAAATTTTTCTAATCGAATGATGGTCAGCTTCATGGGTAACCCGTGTAAATCACAAAAGTGGAACCAGTGTAGCGAAATAATTTAATCtgtactgcacccat > 2:386855‑M2/1‑137 (MQ=255) aagcagccatggacagaaactatctggcgtcagtccttgcggggagcgggctttcgtaatcttgccctgaatacaggactgagtatcaaaaagccggttaactgaaactgtccaggttttgggggtcagttcaATCGGAGGCTTTCTCttt < 6:273534‑M2/18‑1 (MQ=255) cgaATACTCCGGCCAGATCTTTTGCAGGTCAATCCGGTCTTGGTCGCTAAATTTTTCTAATCGAATGATGGTCAGCTTCATGGGTAACCCGTGTAAATCACAAAAGTGGAACCAGTGTAGCGAAATAATTTAATCtgtactgcacccattt > 6:348019‑M2/2‑135 (MQ=255) agcagccatggacagaaactatctggcgtctgtccttgcggggagcgggctttcgtaatcttgccctgaatacaggactgagtatcaaaaagccggttaactgaaactgtccaggttttgggggtcagttcaATCGGAGGCTTTCTCtttt < 5:925586‑M2/19‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |