New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | DH1 | = 3970042 | 510 (1.210) | 34 (0.090) | 31/282 | 36.2 | 6.6% | intergenic (‑128/‑86) | fimA/ECDH1_RS19620 | type‑1 fimbrial protein, A chain/hypothetical protein |
? | DH1 | = 3970338 | 476 (1.200) | intergenic (+22/+58) | ECDH1_RS19620/fimE | hypothetical protein/tyrosine recombinase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
GAACAACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/3969884‑3970042 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttggggccaAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTC < DH1/3970338‑3970189 cAACACCGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAACTCGACATGGGCCGGCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATT < 6:1506602/150‑1 cAACAACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATT < 8:236378/150‑1 GAACAACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATT < 7:204071/151‑1 AACAACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGGTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTT < 7:1042014/151‑1 AACAACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAATCTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTT > 8:1105022/1‑151 ACAACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTTAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCGCCAAAAGATGAAACATTTG > 4:274842/1‑151 ACAACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAACCATTTG > 3:1519196/1‑151 ACAACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTG < 6:985514/151‑1 ACAACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTG > 5:248149/1‑151 CAACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGG > 4:1632229/1‑151 CAACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGG > 5:724716/1‑151 CAACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGG > 6:1521257/1‑151 CAACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGG > 5:31049/1‑151 AACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGG > 4:1652110/1‑151 AACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGG < 4:889219/151‑1 AACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAAATTTTGGG > 6:309307/1‑151 AACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTCTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGG > 1:330145/1‑151 ACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGG > 6:1216328/1‑151 ACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGG > 1:371562/1‑151 ACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGG < 3:1468181/151‑1 CGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGC < 5:1323347/151‑1 CGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGC > 7:451574/1‑151 CGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGC > 2:854206/1‑151 CGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATCAAACATTTGGGGC > 3:665651/1‑151 GATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCC > 2:1162450/1‑151 GATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGACAACACTGCACAGTTATCCCCCAAAAGATGAAACATATGGGGCC > 4:210620/1‑151 ATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCC > 8:1492296/1‑150 ATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCC > 8:597849/1‑150 ATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCC > 2:651067/1‑150 AGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCC > 1:493554/1‑151 GTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCA < 3:393199/151‑1 TTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCA < 6:149548/150‑1 TTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATA < 6:16725/150‑1 TTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAA > 7:708501/1‑150 CATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAT > 2:206307/1‑150 GCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGT > 5:1229720/1‑151 TTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGT > 4:1450027/1‑151 TTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTT > 3:1350105/1‑151 TTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTT < 7:1218113/150‑1 AAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCT > 7:1277057/1‑151 AACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCA > 7:143748/1‑149 ATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATA < 5:1278868/151‑1 TTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGAGGAAACATTTGGGCCCAAACTGACCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTACTCAAGCATA > 3:203669/1‑150 ACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAA > 1:327914/1‑150 TGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAAC > 7:259078/1‑151 GCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGAC > 2:1506099/1‑151 AGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACA > 1:984556/1‑150 TCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAA < 4:1369903/150‑1 GTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAA > 3:791176/1‑149 GTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAA > 8:392327/1‑149 GTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCAT < 4:1304963/149‑1 AGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTA < 8:143818/151‑1 GTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTAT < 5:1176237/151‑1 TTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATT > 4:1391716/1‑151 TGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATAGTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATT > 3:1410014/1‑151 CCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGT < 5:432935/151‑1 CAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGT > 3:544769/1‑150 AACACTGCACAATTTTCCCCCAAAAGATTAAACATTTGGGGCCAAACAGTGCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAA < 1:1247344/151‑1 GCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAAT < 6:950585/151‑1 ACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTT < 3:846869/151‑1 ACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTT < 8:259082/151‑1 AGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTC > 2:1251288/1‑150 TTTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAA > 5:164452/1‑148 TTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCT > 6:223073/1‑151 TGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCT > 5:1016508/1‑150 TGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCT > 1:77448/1‑150 GGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTA < 3:772424/150‑1 GGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTA < 8:780439/150‑1 GGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAAC < 1:842746/151‑1 GGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACn < 7:1353380/151‑2 GGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACG < 1:1053612/151‑1 GGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACG > 4:1603357/1‑151 GGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACG > 2:886450/1‑151 GCCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGT < 2:1373203/151‑1 CCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTT > 3:1209853/1‑151 CCAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTT > 8:538919/1‑151 CAAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTT < 7:781171/151‑1 AAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAAGTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTC > 2:1655622/1‑151 AAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTC > 7:447438/1‑151 AAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTC > 4:363212/1‑151 AAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTC < 6:477967/151‑1 AAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAAAGTTT > 6:477959/1‑150 GAACAACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTCAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTAAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/3969884‑3970042 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttggggccaAACTGTCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTC < DH1/3970338‑3970189 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |