New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | DH1 | = 1519086 | 248 (0.640) | 46 (0.120) | 35/300 | 33.0 | 16.1% | coding (71/186 nt) | ECDH1_RS07485 | hypothetical protein |
? | DH1 | 1519099 = | 232 (0.600) | coding (58/186 nt) | ECDH1_RS07485 | hypothetical protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
GGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/1518938‑1519086 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAA > DH1/1519099‑1519159 GGCCCTTGGGGCAGGTCTCTGGGCCTGTGTTAATTAGTTGTTATTCGCTGCAAGATCGGCTTCTCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAT < 6:575213/150‑1 GGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGG‑TATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATAC > 1:965589/1‑151 CCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACC > 4:1348619/1‑151 CCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCCTACCT > 1:323239/1‑151 aATGGGGATGGTATGTTGGCCTGTGTTAATTAGTCCTTACTCTCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTT < 1:1463516/150‑1 CATGTGGAGCTGCTGTGGTCATGTGTTAATTAGT‑GTTATTCGCTGCAATATCTGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTC < 2:975757/151‑1 CATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTT > 4:1170487/1‑151 CATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTT > 2:1479786/1‑151 CATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTT < 3:1160373/151‑1 ATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTC > 8:619688/1‑151 ATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTC > 6:484325/1‑151 TGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTC > 8:1200257/1‑150 gcTCGTCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTTGTTATTCGCCGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTTGTCACGATCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAT < 5:824138/138‑1 GATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAT > 6:826526/1‑140 ATCGGCTGTGGGCGTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCATGagt > 6:385968/1‑148 GGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCatagaagcc > 4:572174/1‑142 GGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCaaagatacc > 2:360688/1‑142 CTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCgaaaaaacct > 2:825524/1‑140 gTGTGTTAATTAGTGCTTACTCGCTGCCAGATCCGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGCTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGc < 7:278619/150‑2 CTGTGTTAATTAGTTCTTATTCGCTGCCAGATCTGCTTCTCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCT < 8:1334294/134‑1 tgctatcaTAGTAGTTATTCGCTGCCAGATCGGCATCGCTTAGCTGGGTGGGCGCGAGCACCAGGTCACGATCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGAT < 3:282582/139‑1 GTGTTAAGTAGTGCTGAGTCGCTGCCAGATCCGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCCAGCACAAGGTCACGATCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCC < 8:1270627/151‑1 TGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCT > 2:1155670/1‑131 TGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCT < 1:1144637/131‑1 GTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCGTGCGAACCAAggtgcacgcct > 1:1184338/1‑139 GTTAATTAGTGGTGATTCGCTGCCAGATCCGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACATTGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCT < 7:616884/150‑1 AATTATTGGTTATTCTATGCCATATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACATGGTCACGATCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCT < 3:567423/151‑1 AATTAGTCGTTATTCGCTGCCATATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTTGTCACGATCAAAGCCCTGGTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCC < 5:41393/130‑1 AATTAGTCGTTAATCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCCAGCACCTTGTCACGATCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCT < 3:208143/151‑1 TAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCATGAAAGCCAAATTGATagctagta > 4:284653/1‑139 GTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCAAGCCAGCCAATTTGATCCCCTTCCTGCagt > 2:901373/1‑148 gcTTAGTCGCTGCCATATCCGCTTCGCTTAGGTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAG < 3:414428/149‑1 TATTCGCTGCCATATCCGCTTCGGTTAGGTGGGTGGGCGCGAGCACATGGTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCC < 7:1193752/150‑1 TATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTC > 5:775715/1‑115 CCATATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACATGGTCACGATCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTT < 5:1480557/120‑1 CCAGATCGGCTTCGGTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTTGTCACGATCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAAT < 1:894125/151‑1 CCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCATGACAGCCAATat > 6:1488107/1‑118 catATCGGCTGCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTTGTCACGATCAACGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATA < 2:603253/148‑1 gTTCGGTTAGGTGGGTGGCCGCGAGCACCATGTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAA < 1:255251/150‑1 gcgggTAGCTGGGTGGGCGCCAGCACATTGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAA < 2:1196848/144‑1 GCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATAC > 2:147801/1‑73 AAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTC > 4:1364899/1‑57 AAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATAC < 2:678048/52‑1 AAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATAC > 1:672359/1‑52 AGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTG > 6:933724/1‑58 AGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTG < 5:931202/58‑1 GGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/1518938‑1519086 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAA > DH1/1519099‑1519159 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |