New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | DH1 | = 1519086 | 248 (0.640) | 46 (0.120) | 35/300 | 33.0 | 16.1% | coding (71/186 nt) | ECDH1_RS07485 | hypothetical protein |
? | DH1 | 1519099 = | 232 (0.600) | coding (58/186 nt) | ECDH1_RS07485 | hypothetical protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
ATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGC > DH1/1518949‑1519247 | aTCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAAttt < 1:1250009/151‑1 (MQ=255) cGGCTGTGGCCCTGTGTTAATTAGTGGGTATTCGCTGCCAGATCGGCGTCGCTTAGCTGGGTCGCCGCGAGCACCTTGTCACTATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTa < 4:32990/150‑1 (MQ=37) ggCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCAAAGATAcc > 2:360688/1‑151 (MQ=255) gCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATGTTAATCGCTGGAGAATGCAATCCATCGAATATACCt > 1:59090/1‑151 (MQ=255) gtgtgGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCtt < 8:881061/150‑1 (MQ=255) cTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTACTTTTCCtt > 3:447733/1‑151 (MQ=255) cTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCtt > 7:1228886/1‑151 (MQ=255) tgtgGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTc > 1:1135527/1‑151 (MQ=255) gtgGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGGTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCtt < 4:148836/149‑1 (MQ=255) ggggCCTGTGTTAATTAGTGGGTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCt < 8:433905/150‑1 (MQ=255) gggCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTg < 1:1263718/151‑1 (MQ=255) gggCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCAAGGTTAccaaaatg > 2:194837/1‑145 (MQ=255) ccTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTgcca < 5:308460/151‑1 (MQ=255) ccTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTgcca < 1:481257/151‑1 (MQ=255) cTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTgcc > 5:595665/1‑149 (MQ=255) tgtgTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCAAGATTACCttaatgaaccc > 6:1202433/1‑142 (MQ=37) gtgtTAATTAGTGGTTATTCGCTGTCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTgccagcc < 5:487951/151‑1 (MQ=255) gtgtTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTgccagc < 1:84544/150‑1 (MQ=255) 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tAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTTGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGa < 3:31922/150‑1 (MQ=255) aGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATg < 6:347536/151‑1 (MQ=255) aGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATg < 8:1101074/151‑1 (MQ=255) ttggttttCGCTGCCCGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCTGGGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCTATGCTATTTTTATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATgg < 6:1530461/144‑2 (MQ=37) ttATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCATGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACATTCCTGCCAGCCAATTTCATGtcctt > 6:1560560/1‑151 (MQ=255) aTTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGtccttc < 4:1253308/150‑1 (MQ=255) ttCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTTAGTTACCTTCGTGCCAGCCAAATTGCTGtccttcct > 3:982876/1‑151 (MQ=255) ttCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGtccttcct > 7:118084/1‑151 (MQ=255) tCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAAGTTACCTTCCTGATAGCCAATTTGATGTCCTTCGTg > 1:1230518/1‑151 (MQ=255) gCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCa < 8:1410763/151‑1 (MQ=255) atgcgCTTCGCTCACGTGGGGGGGCGCCAGCACAATGTCACGATCAAAGCCCTGCTCCAGCATTCTCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTc < 4:390623/147‑1 (MQ=21) aTCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTACTTTCCCTTCCTGCGGGCCATTGTGAGGTCCTTCCTGACGCAGcggg > 7:535953/1‑148 (MQ=25) cGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTCCCTTCCTGCACGCCTATTTGATGTCCCACCTCCCGAAGCCGTTc > 1:1328489/1‑151 (MQ=37) ggCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCa < 2:1319608/151‑1 (MQ=255) ggCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCa < 7:109133/151‑1 (MQ=255) ggCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGAGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCAGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATCGCTTGTTCATGCAGACCTTCTAATATACCTTCCTGCAAGCCAAAATCAAGTCCTACCTGACCCAGCCCTTc > 5:337118/1‑150 (MQ=25) ggCTTCGCTTAGCTGGGGGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCa < 4:1078476/151‑1 (MQ=255) gCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGGATGTGCATGCAGACCTTCTAAGTTGCATTCCTGCCAGCGAATTTGATGTCCTGCCTGCAGCAGCCGTTc > 1:467361/1‑149 (MQ=37) gCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAg < 3:1064212/151‑1 (MQ=255) tCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCGTGCGAGCCAATTTGATGTCCTTCATGCCGCAGACGTTCAGCa > 7:189357/1‑150 (MQ=255) 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aaGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGt < 4:223802/151‑1 (MQ=255) aGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTc < 1:10741/151‑1 (MQ=255) gCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCg < 4:935106/151‑1 (MQ=255) ttAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGc < 2:906323/150‑1 (MQ=255) aaTGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGcaca < 5:1210774/151‑1 (MQ=255) ggCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAAtc < 7:1124724/151‑1 (MQ=255) gTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCAc < 8:1349140/150‑1 (MQ=255) gTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACg < 5:973955/151‑1 (MQ=255) gTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACg > 3:300433/1‑151 (MQ=255) ccTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCt < 5:352660/151‑1 (MQ=255) ccTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCt < 5:1552941/151‑1 (MQ=255) tCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTg < 8:761157/149‑1 (MQ=255) tCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCt > 8:311449/1‑151 (MQ=255) aaTTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCGATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCa < 2:571161/151‑1 (MQ=255) aaTTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTcc < 1:1468217/150‑1 (MQ=255) aTTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTGCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGGCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAg < 2:1002759/151‑1 (MQ=255) ttACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGc > 5:637602/1‑150 (MQ=255) | ATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGC > DH1/1518949‑1519247 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |