New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | DH1 | = 1519281 | 297 (0.760) | 41 (0.110) +AACCTTCTAATT |
30/276 | 33.1 | 13.1% | coding (788/900 nt) | yfaD | transposase |
? | DH1 | 1519282 = | 297 (0.760) | coding (787/900 nt) | yfaD | transposase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
AAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/1519255‑1519281 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAAT > DH1/1519282‑1519428 |||||||||||| AAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTTGTGGTGAACGTTCCGCAATATCCGCAATAACACGGGT > 3:1328223/1‑151 AGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAAGGTTCGGCAAAATCCGCGATAAAcgtggtg > 1:331081/1‑144 GCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTTGTGGTTAAGGATCTGCAATCTCCTCAATAACCCGGGTc > 1:414636/1‑149 GCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAAACTCCGCTATAACACTGGTc > 5:1190330/1‑149 AATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTTAACGATCGGCAATCTCCTAAATAAAACGGGTCAA > 4:41873/1‑150 ATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCAGCAATCTCATAAATAAAGCGGGTCAAcc > 6:1385330/1‑149 TTTAATGGCTTGTTCATTCTAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAAC < 6:1015814/116‑1 TTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGAGGTGAAC > 5:1013185/1‑116 TTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGATGAACGATCAGCAATCTCATAAATAAAACGTGTCAAACGc > 8:580209/1‑150 TTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAAGGTTCGTCAATATCATCAATAAAACGGGTCAAAAGGG > 6:314791/1‑151 TTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGCTGAACGTTCGGCAAAATCCTGAATAAAACTGGTGAAACGGc > 4:1503280/1‑150 TTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGTCAAGCTCCTAAATAAACCTGGTGAAACGGG > 3:935094/1‑151 TTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCAGCAATCTCATCAATAAAACGGGTCAAACGGG > 2:1439217/1‑151 TAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTCAAACGGG > 4:1252473/1‑150 AATGGCTTTTTCATTGAAACCTTCATCATTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGGCCTTCCTGCCGGAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAG < 2:418873/151‑1 AATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGAGGTGAAGGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAc > 1:13968/1‑150 AATCGCTTGTTAATGCAATCCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAG < 1:1424217/151‑1 ATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGAAGTGGTGAACGATCGGCACTCTCCTCCATAAAACGGGTGACACGGCAGG > 8:1269/1‑151 ATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCATCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGG > 5:1256035/1‑151 TGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGCTGAACGATCGGCAATCTCCTCAATAAAACTGGTGAAACGGGAGGT > 4:173682/1‑151 GGCTTGTTCATTCAATCGTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTA < 4:942037/151‑1 GGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTCATGAACGTTAGTCAATCTCCTAAATAAAACGTGTGAAACGGGAGat > 6:1276706/1‑148 caattttaatCAAATCTTCTATGATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATC < 4:529796/141‑1 CTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTTACCGTTCTGCAATCTCCTCAATAACACTGGTGAAACGGGAGGTATC > 1:1360329/1‑151 CTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTC > 4:1443292/1‑124 CTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCATAAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATC > 5:656973/1‑151 CTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTC < 3:1429962/124‑1 TTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCATCAATAAAACGGGTGAA > 2:441674/1‑138 TTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAA < 1:436853/138‑1 TGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTTTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGC > 7:303447/1‑151 TGTTCATGCAAAACTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCATCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATC < 6:1261650/149‑1 GTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGGAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCG > 5:1418132/1‑110 GTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCG < 6:1423827/110‑1 ttgattgtaatgTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGGAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCC < 4:1338856/138‑1 TCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCGCAATAAGACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGg > 8:1226008/1‑150 CATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGTTGAACGTTCGTCAATCTCATAAATAAAACGTGTGAAACGGGAGGTATCTCCGa > 6:1385462/1‑149 CATGCAAACCTTCTAACTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGC < 5:1379943/150‑1 ATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCAT > 2:1144842/1‑151 gtgctcttgcgagcTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATT < 3:1069095/136‑1 CAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAA > 2:759228/1‑65 CAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTGAATAAACCGGGTGAAAAGGGAGGTATCGCCGCATTGC > 5:764268/1‑151 CAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAA < 1:752885/65‑1 AAATCTTCTACTATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCA < 6:1194650/151‑1 atCCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTC < 6:1511521/98‑1 AACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTC > 5:1503796/1‑100 AACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTAGTCAATCTCATCAATAAAACGGGTGAAAAGGGAGGTATCGCCGCATTGCAc > 7:161497/1‑150 AACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGCTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAc > 4:1182209/1‑150 ACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTC > 1:1306024/1‑111 ACCTTCTAATATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTC < 2:1320046/111‑1 CCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATATCCTCAATAAAACTGGTGAAACGGGAGGTATCGCCTCATTGCAGC > 8:13426/1‑150 gTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGGCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAG < 8:821874/150‑1 CTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCA < 6:803576/110‑1 CTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCA > 5:801193/1‑110 CTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAACCGGGTGAAAAGGGAGGTATCGCCTAATTGCAGC > 3:419469/1‑149 CTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTCTAGTGCTTAACGTTCGGCAATATCCTCTATAAAACGGGTGAAACGGGAGCTATCGCCTCATTGCAGC > 7:817535/1‑149 TTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATAGCAGC > 1:1251501/1‑148 TTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACG > 6:651427/1‑93 TTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGGCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACG < 5:649593/93‑1 TCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTTAACGTTAGTCAATCTCATCAATAAAACGTGTGAAAAGGTAGGTATCGCCTCATTGCAGC > 8:906807/1‑147 TCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCATCAATAAAACGGGTGAAACGCGAGGTATCGCCGCATTGCAG > 2:453356/1‑146 TCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTG > 7:1564723/1‑88 TCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAG < 1:448368/146‑1 TCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTG < 8:1571561/88‑1 CTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTT < 7:1052425/78‑1 TAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGCAGTGGTGAACGTTCGGCAAGCTCCTCAATAAAACGGGTGAA > 1:1103876/1‑120 TAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTTTAGTGTTG > 4:423585/1‑86 TAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGAATTGCAGCAGATA > 6:325453/1‑150 TAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTG < 3:418496/86‑1 TAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGCAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAA < 2:1114134/120‑1 atTTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGGCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATA < 8:305343/147‑1 agaTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATA < 3:171541/146‑1 AATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTAGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAAAGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAAT > 4:1341860/1‑151 AATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTTTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTCCAGCAGATAAT > 2:184762/1‑151 TTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAA > 5:463557/1‑108 TTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCATCAA > 1:1358201/1‑104 TTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAA < 2:1372057/104‑1 |||||||||||| AAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/1519255‑1519281 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAAT > DH1/1519282‑1519428 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |