New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | DH1 | = 1519281 | 297 (0.760) | 41 (0.110) +AACCTTCTAATT |
30/276 | 33.1 | 13.1% | coding (788/900 nt) | yfaD | transposase |
? | DH1 | 1519282 = | 297 (0.760) | coding (787/900 nt) | yfaD | transposase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 339 total aligned reads displayed.
AGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAATTAA > DH1/1519137‑1519431 | gTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACATTTCCGAATATCAGAATCAGTAAGTTTGCTTGTAAAAAGCAAAATATCACGTAAAAAGACCAGCTAAATAAACAGAAAAGCAATATTAATGGCTTGTTGCTGGAGACATTCCtc > 8:1293049/1‑150 (MQ=255) cAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGGATCAGAGAGTTGGGTTGTCGACAGCACAATCTCACGTAAAAAGACCTGCTAAATAATGAGGAAATCAATATTAATGTCTTGATAATGCATAAGTTCATgcc > 4:1286887/1‑150 (MQ=255) gCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGAGATGTAGGTTTGTGAGGATCAGTGAGGTGGTTTGGGGCACTCACAATATCACGTTCAAAGCCCTGGTCGAGCATTCGAAAAGAAATTTTAATGGCTTGTTGATGCATACCTTCCTgcgcgc > 1:1505336/1‑147 (MQ=255) aTAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTgccagcca > 5:787529/1‑150 (MQ=255) aGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAAtt > 1:317548/1‑151 (MQ=255) cATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTg > 4:922284/1‑150 (MQ=255) cATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTg > 4:538310/1‑150 (MQ=255) tAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGc > 8:455982/1‑151 (MQ=255) tAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAAATTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGc > 2:585717/1‑151 (MQ=255) tcCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATCCCCTTCCt > 4:186277/1‑151 (MQ=255) ccTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTg > 8:401255/1‑151 (MQ=255) cTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGc > 1:875617/1‑151 (MQ=255) tAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGt > 2:904013/1‑150 (MQ=255) aaTGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGt > 2:33226/1‑149 (MQ=255) tGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGcc > 6:910285/1‑151 (MQ=255) aGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTc > 7:119071/1‑151 (MQ=255) ttCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTc > 3:749970/1‑149 (MQ=255) ggAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCa > 8:1485229/1‑150 (MQ=255) 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atatCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGACCTGCTCCACCATGCGCAAACCAAAATTAATGGCTAGTTCATCCATACCTTCATGCCAGCCAATTTCATGCCCTTCCTGCCGAAGCCGGTCAGCaaaat > 8:638186/1‑148 (MQ=255) tatCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGt > 7:381336/1‑151 (MQ=255) gttcggttaggtGGGTGGCCGCGAGCACCATGTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTaa < 1:255251/140‑1 (MQ=18) tCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAAtc > 4:1115797/1‑151 (MQ=255) cAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAAtct > 3:972672/1‑151 (MQ=255) aGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAAtctc > 1:48203/1‑151 (MQ=255) gctctgccgttctccAGCACATTGTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCt < 3:878636/138‑1 (MQ=21) ttGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCttt > 3:1379592/1‑151 (MQ=255) ttGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCttt > 1:1337839/1‑151 (MQ=255) tGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCtttt > 3:1454546/1‑151 (MQ=255) gTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCNGCNAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGt > 5:1531931/1‑150 (MQ=255) gTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGt > 6:60799/1‑150 (MQ=255) tGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAgt > 1:159549/1‑151 (MQ=255) tCGCAAGCACAATGTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCATGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAgt < 3:607005/149‑1 (MQ=255) cGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAgtggt > 8:491993/1‑151 (MQ=255) 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tcACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGAAATAGTCATTAATCTCTCGTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCa > 6:470633/1‑150 (MQ=255) acccGTTCTAACCCCGGCTACAGAATGCTCAAAGCATTTTTAATGCCTTGTTCAACCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCaa < 5:1160577/148‑1 (MQ=21) ccGTTCAACGCCCTGCTCCAGCATGCTAAAAGCAATTTTAATGCCTTGTTCATCCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAAtc < 8:538981/150‑1 (MQ=255) ttCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCCCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATctcc > 5:202158/1‑151 (MQ=255) cAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATctcctc > 7:1082331/1‑151 (MQ=255) 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gTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTgcagca < 8:119762/150‑1 (MQ=255) gTTCATCCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGcagcag < 4:353460/151‑1 (MQ=255) cttctaatttACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAACCGGGTGAAAAGGGAGGTATCGCCTAATTgcagc > 3:419469/10‑149 (MQ=18) cttctaatttACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGAAGTGATGAACGATCGTCAATATCATCAATAAAACTTGTGAAACGGAAGCTATCGCCGCATTgcacca > 6:1518067/10‑150 (MQ=17) cttctaatttACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTCTAGTGCTTAACGTTCGGCAATATCCTCTATAAAACGGGTGAAACGGGAGCTATCGCCTCATTgcagc > 7:817535/10‑149 (MQ=18) ttctaatttACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATagcagc > 1:1251501/9‑148 (MQ=21) ttCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTgcagc > 8:1337979/1‑148 (MQ=255) tctaatttACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCATCAATAAAACGGGTGAAACGCGAGGTATCGCCGCATTgcag > 2:453356/8‑146 (MQ=21) tctaatttACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTgcag < 1:448368/139‑1 (MQ=255) tCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCAGTAATCTCTCCTTTTGTAGTGTTGTACGTTCGGCAATCTCCTCAAGAAAACGGGTGAAACGGGACGTATCGCCTCATTgcagc > 8:1079098/1‑147 (MQ=25) cATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGAt > 8:1531499/1‑150 (MQ=255) cATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGAt > 2:1424116/1‑150 (MQ=255) taatttACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTTTAgtgttg > 4:423585/6‑86 (MQ=11) aTGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATaa < 1:581343/151‑1 (MQ=255) attttACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGGCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATa < 8:305343/145‑1 (MQ=255) aatttACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTTTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTCCAGCAGATAAt > 2:184762/5‑151 (MQ=255) aatttACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAAAGAGCTGAACGTTCTTCAAACTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGCGAGGTATCGCCGCATAGCAGCAGATAAt > 6:1043143/5‑151 (MQ=18) tttACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCaa < 2:1372057/102‑1 (MQ=255) cATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTACTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAATTa < 5:1110374/151‑1 (MQ=255) ttACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAAGGTTGGGCAGGATCCTCAATAAAACGTGTGGAACGCGAGGTATCGCCGGATTGCAGCAGATAATTa > 1:1005875/2‑150 (MQ=18) tACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCAt < 8:163490/134‑1 (MQ=255) tACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAATTaa > 7:961945/1‑150 (MQ=255) | AGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAATTAA > DH1/1519137‑1519431 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |