| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | DH1 | 2,204,804 | Δ120 bp | intergenic (‑239/‑54) | tqsA ← / → mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 2204803 | 1 (0.000) | 297 (0.620) | 178/296 | 1.8 | 99.7% | intergenic (‑238/‑174) | tqsA/mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ |
| ? | DH1 | 2204924 = | 1 (0.000) | intergenic (‑359/‑53) | tqsA/mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ | |||||
Only 100 of 301 total aligned reads displayed.
AAGTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/2204652‑2204803‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAATGGC > DH1/2204924‑2205072 GTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTG < 3:13311/151‑1 GTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTG < 2:1235760/151‑1 AATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTC > 2:137306/1‑151 AATATATTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGAGTCCAACTACAGAGCACAATTATCAACCCCGATGACGAGAAGCAACACTCCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTC < 6:1407277/151‑1 ATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGTCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCG > 2:493004/1‑151 ATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCT > 4:1227797/1‑151 TTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGA > 1:696645/1‑150 TTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGA > 5:880155/1‑150 GAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATT < 4:1657879/151‑1 GAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATT < 5:1496515/151‑1 AGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATT < 8:439335/150‑1 AATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCG < 5:1015687/151‑1 ATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGA < 1:1375542/151‑1 ATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGA < 3:633674/151‑1 TCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAA > 7:739464/1‑150 TTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAAT > 7:1551879/1‑151 TAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCTAAAATT > 8:611017/1‑151 TAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAA < 2:1665477/148‑1 AAGCTATGATACAAATCAGGCCTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATATGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAATTT > 8:1136282/1‑150 CTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAA > 2:1611508/1‑150 CTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAA > 4:901639/1‑150 TATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAAT > 7:1308555/1‑151 TATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAAT > 2:834580/1‑151 ATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAA < 6:366628/149‑1 GATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAAT < 3:556756/151‑1 GATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAA < 1:618373/150‑1 AATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTT < 5:1383473/151‑1 AATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTT < 3:1607962/151‑1 TCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGC > 1:1554042/1‑151 AGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGC > 6:1108818/1‑149 GCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGA < 1:259868/151‑1 CGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAG < 6:562623/151‑1 GTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGG > 1:1807423/1‑148 ggTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAG < 2:752643/149‑1 AACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACA < 6:1138957/151‑1 AACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGAC > 5:1620592/1‑150 ACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGAga > 2:1026163/1‑148 ACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAA < 7:988689/151‑1 CTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACCCGGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACCTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAAT > 8:495088/1‑151 ACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGT < 6:1221603/151‑1 ACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATG < 2:418035/150‑1 CGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATGATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTAT > 7:516544/1‑151 CGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTAT < 3:943830/151‑1 CGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTAT > 1:1307701/1‑151 GAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTAT > 1:1118715/1‑150 GACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTT < 3:1824686/151‑1 aAATTATCATCCGCTATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTAT < 7:1094071/150‑1 AATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTCTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGCTTTCGCTCAATTAAGCGAAAATAAAAATAATTCTCTAGCAGCAGAAGGACAATGTATATTTATT > 4:314131/1‑151 TTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGG > 4:38072/1‑151 TATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGG < 7:266153/150‑1 TATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGG > 4:531967/1‑150 ATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGAT < 6:245146/151‑1 ATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTT < 4:1767151/151‑1 ATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTT < 3:1172749/151‑1 CCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTAT < 4:1889996/151‑1 CCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTA < 3:899363/150‑1 CGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTATTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAG < 8:1603520/151‑1 GATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGt > 4:1351166/1‑150 ATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTNTCTACATTGGTTTNGCTGAATTANGCGAAAATTANAATAANTCTNTTGCAGGAGANGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGT < 7:126037/151‑1 GACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCT < 6:1803491/151‑1 GACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTC < 2:695212/150‑1 ACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTG < 5:376490/151‑1 ACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTCTCGCTGAATTAAGAGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTG < 1:541479/151‑1 CGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGG < 7:399269/151‑1 AGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCT > 3:1890746/1‑151 AGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCT > 7:1682579/1‑151 GAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCT > 3:1681023/1‑150 AAGCAACACTGAGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTAAATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTAT > 6:869045/1‑151 GCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTG < 6:750532/151‑1 CAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGC > 2:1730120/1‑151 AACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCT > 3:782371/1‑151 CACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTAC > 7:1449220/1‑151 ACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTAC > 8:713027/1‑150 CTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTAC > 3:408368/1‑149 GCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAG < 4:1511657/149‑1 ATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATT > 5:189779/1‑150 AATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACC > 5:1877761/1‑151 TGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGG < 7:693202/150‑1 AATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACG < 4:1274990/151‑1 AATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTAC < 6:158210/150‑1 ATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGC > 4:1466446/1‑151 ATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGC > 7:807613/1‑151 TATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGATTTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCT > 4:753696/1‑151 ATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTG < 1:836349/151‑1 TATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGT < 5:1122151/150‑1 ATGCACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTTCAGAAATTAACGGTACGCTGTC > 2:98885/1‑150 ATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAAT < 2:1876689/151‑1 TGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGG > 4:1068625/1‑151 TGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGG > 8:174368/1‑151 TGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGG > 6:1664527/1‑151 CAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAG < 7:1789108/151‑1 CAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCG > 4:1156475/1‑149 GACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGT > 8:235876/1‑151 ACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTC > 5:1784875/1‑151 GTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAG < 4:1610234/151‑1 ATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAACGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGA < 8:1318575/151‑1 TTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAG < 3:1061834/150‑1 TACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAA > 7:597116/1‑150 ACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAA < 8:1548745/150‑1 aATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAATG < 4:680531/150‑1 AAGTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/2204652‑2204803‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAATGGC > DH1/2204924‑2205072 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |