| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | DH1 | 2,204,804 | Δ120 bp | intergenic (‑239/‑54) | tqsA ← / → mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 2204803 | 1 (0.000) | 297 (0.620) | 178/296 | 1.8 | 99.7% | intergenic (‑238/‑174) | tqsA/mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ |
| ? | DH1 | 2204924 = | 1 (0.000) | intergenic (‑359/‑53) | tqsA/mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ | |||||
Only 100 of 301 total aligned reads displayed.
AGTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTTACCCATCTTCGTACCTCATCCACTATCTTGCTCGTAGGTGAGCAGCACTGGCGCAACGCGCTTTAGTCCTTTCTTCTGCCAAAGCTTGCGCTATGCGCGGGGCTTGACCACTTTACTTTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAA > DH1/2204653‑2204950 | gTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTg < 3:13311‑M1/151‑2 (MQ=255) gTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTg < 2:1235760‑M1/151‑2 (MQ=255) aaaTATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTAGCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggttt < 1:804916‑M1/151‑6 (MQ=255) aaTATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttc > 2:137306‑M1/1‑145 (MQ=255) aaTATATTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGAGTCCAACTACAGAGCACAATTATCAACCCCGATGACGAGAAGCAACACTCCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttc < 6:1407277‑M1/151‑7 (MQ=255) atatTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGTCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcg > 2:493004‑M1/1‑144 (MQ=255) atTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgct > 4:1227797‑M1/1‑142 (MQ=255) ttGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctga > 5:880155‑M1/1‑139 (MQ=255) gAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaatt < 4:1657879‑M1/151‑15 (MQ=255) gAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaatt < 5:1496515‑M1/151‑15 (MQ=255) aGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaatta < 1:669323‑M1/151‑16 (MQ=255) aGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaatt > 1:856327‑M1/1‑136 (MQ=255) aGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaatt < 8:439335‑M1/150‑15 (MQ=255) aaTTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcg < 5:1015687‑M1/151‑20 (MQ=255) aTTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcga < 1:1375542‑M1/151‑21 (MQ=255) aTTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcga < 3:633674‑M1/151‑21 (MQ=255) tCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaa > 7:739464‑M1/1‑129 (MQ=255) ttAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaat > 7:1551879‑M1/1‑127 (MQ=255) tAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagctaaaatt > 8:611017‑M1/1‑126 (MQ=255) tAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaa < 2:1665477‑M1/148‑23 (MQ=255) aaGCTATGATACAAATCAGGCCTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATATGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaattt > 8:1136282‑M1/1‑125 (MQ=255) cTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaa > 4:901639‑M1/1‑122 (MQ=255) cTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaa > 2:1611508‑M1/1‑122 (MQ=255) tATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaat > 2:834580‑M1/1‑121 (MQ=255) tATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaat > 7:1308555‑M1/1‑121 (MQ=255) aTGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaa < 6:366628‑M1/149‑30 (MQ=255) gATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataat < 3:556756‑M1/151‑34 (MQ=255) aaTCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctctt < 5:1383473‑M1/151‑40 (MQ=255) aaTCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctctt < 3:1607962‑M1/151‑40 (MQ=255) tCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgc > 1:1554042‑M1/1‑110 (MQ=255) aGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgc > 6:1108818‑M1/1‑108 (MQ=255) gCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcagga < 1:259868‑M1/151‑46 (MQ=255) cGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggag < 6:562623‑M1/151‑47 (MQ=255) gtgtTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcagg > 1:1807423‑M1/1‑104 (MQ=255) ggtcaACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaag < 2:752643‑M1/149‑50 (MQ=255) aaCTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggaca < 6:1138957‑M1/151‑54 (MQ=255) aaCTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggac > 5:1620592‑M1/1‑98 (MQ=255) aCTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaa < 7:988689‑M1/151‑55 (MQ=255) cTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACCCGGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACCTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaat > 8:495088‑M1/1‑96 (MQ=255) aCCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgt < 6:1221603‑M1/151‑58 (MQ=255) aCCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatg < 2:418035‑M1/150‑57 (MQ=255) cGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaatgattctcttgcaggagaaggacaatgtat > 7:516544‑M1/1‑92 (MQ=255) cGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtat > 1:1307701‑M1/1‑92 (MQ=255) cGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtat < 3:943830‑M1/151‑60 (MQ=255) gAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtat > 1:1118715‑M1/1‑91 (MQ=255) gACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatattt < 3:1824686‑M1/151‑64 (MQ=255) aaatTATCATCCGCTATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttat < 7:1094071‑M1/150‑66 (MQ=255) aaTTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTCTTCAGGACGTTATTTTCTACATTgctttcgctcaattaagcgaaaataaaaataattctctagcagcagaaggacaatgtatatttatt > 4:314131‑M1/1‑85 (MQ=255) aTTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattg < 1:605936‑M1/151‑68 (MQ=255) ttATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattgg > 4:38072‑M1/1‑83 (MQ=255) tATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattgg < 7:266153‑M1/150‑69 (MQ=255) tATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattgg > 4:531967‑M1/1‑82 (MQ=255) atcatcCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggat < 6:245146‑M1/151‑71 (MQ=255) atcCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggatttt < 4:1767151‑M1/151‑74 (MQ=255) atcCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggatttt < 3:1172749‑M1/151‑74 (MQ=255) ccGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttat < 4:1889996‑M1/151‑76 (MQ=255) ccGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggatttta < 3:899363‑M1/150‑75 (MQ=255) cgATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTATTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattag < 8:1603520‑M1/151‑79 (MQ=255) gATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattagt > 4:1351166‑M1/1‑72 (MQ=255) aTGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTNTCTACATTggtttngctgaattangcgaaaattanaataantctnttgcaggaganggacaatgtatatttattggattttattaggt < 7:126037‑M1/151‑81 (MQ=255) gACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtct < 6:1803491‑M1/151‑83 (MQ=255) gACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtc < 2:695212‑M1/150‑82 (MQ=255) aCGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctg < 5:376490‑M1/151‑84 (MQ=255) cGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctgg < 7:399269‑M1/151‑85 (MQ=255) agaAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggct > 7:1682579‑M1/1‑65 (MQ=255) agaAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggct > 3:1890746‑M1/1‑65 (MQ=255) gaAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggct > 3:1681023‑M1/1‑64 (MQ=255) aaGCAACACTGAGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtaaatttattggattttattaggtctggctat > 6:869045‑M1/1‑63 (MQ=255) gCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattg < 6:750532‑M1/151‑91 (MQ=255) cAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgc > 2:1730120‑M1/1‑60 (MQ=255) aaCACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgct > 3:782371‑M1/1‑59 (MQ=255) cacTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctac > 7:1449220‑M1/1‑57 (MQ=255) acTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctac > 8:713027‑M1/1‑56 (MQ=255) cTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctac > 3:408368‑M1/1‑55 (MQ=255) gCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacag < 4:1511657‑M1/149‑97 (MQ=255) aTAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaatt > 5:189779‑M1/1‑49 (MQ=255) aaTTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattacc > 5:1877761‑M1/1‑47 (MQ=255) tGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccgg < 7:693202‑M1/150‑107 (MQ=255) aaTATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacg < 4:1274990‑M1/151‑111 (MQ=255) aaTATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtac < 6:158210‑M1/150‑110 (MQ=255) atatTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgc > 4:1466446‑M1/1‑40 (MQ=255) atatTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgc > 7:807613‑M1/1‑40 (MQ=255) tattatGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgatttaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgct > 4:753696‑M1/1‑39 (MQ=255) tatGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgt < 5:1122151‑M1/150‑115 (MQ=255) atGCACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgcttcagaaattaacggtacgctgtc > 2:98885‑M1/1‑35 (MQ=255) aTTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaat < 2:1876689‑M1/151‑124 (MQ=255) tGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatggg > 8:174368‑M1/1‑25 (MQ=255) tGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatggg > 6:1664527‑M1/1‑25 (MQ=255) tGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatggg > 4:1068625‑M1/1‑25 (MQ=255) cAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgag < 7:1789108‑M1/151‑131 (MQ=255) cAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcg > 4:1156475‑M1/1‑21 (MQ=255) gACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgt > 8:235876‑M1/1‑18 (MQ=255) aCGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtc > 5:1784875‑M1/1‑17 (MQ=255) gTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcag < 4:1610234‑M1/151‑137 (MQ=255) aTTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaacgacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtga < 8:1318575‑M1/151‑140 (MQ=255) tttCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgag < 3:1061834‑M1/150‑141 (MQ=255) tACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaa > 7:597116‑M1/1‑6 (MQ=255) aCATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaaa < 8:1548745‑M1/150‑146 (MQ=255) cATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaaatg < 1:493887‑M1/151‑148 (MQ=255) aatTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaaatg < 4:680531‑M1/150‑148 (MQ=255) | AGTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTTACCCATCTTCGTACCTCATCCACTATCTTGCTCGTAGGTGAGCAGCACTGGCGCAACGCGCTTTAGTCCTTTCTTCTGCCAAAGCTTGCGCTATGCGCGGGGCTTGACCACTTTACTTTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAA > DH1/2204653‑2204950 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |