| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 2478888 | 228 (0.470) | 234 (0.500) | 162/290 | 3.0 | 47.9% | noncoding (5/1204 nt) | repeat_region | repeat region |
| ? | DH1 | 2480088 = | 289 (0.610) | intergenic (‑73/‑63) | insH1/fnr | transposase/fumarate and nitrate reduction regulatory protein | |||||
Only 100 of 474 total aligned reads displayed.
AAGGTTATCTTTTGCTGTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATCCCCAGTT > DH1/2478738‑2479033 | ggTTATCTTTTGCTGTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGac > 2:956149‑M1/1‑149 (MQ=255) gTTATCTTTTGCTGTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGa < 7:1718616/151‑1 (MQ=255) tttGCTGTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttactt < 2:1823515‑M1/149‑9 (MQ=255) gTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATaa < 7:1394458/150‑1 (MQ=255) tAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctc < 8:13565‑M1/150‑17 (MQ=255) aaaCATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGc < 1:1512170/150‑1 (MQ=255) aaCATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCgg > 4:529008/1‑151 (MQ=255) aCATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTCCTTAGacttacttgctccctaaaa > 4:875826‑M1/1‑131 (MQ=255) cATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaa > 6:254522‑M1/1‑130 (MQ=255) ttAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGa > 1:1114613/1‑150 (MQ=255) aaaCAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgt > 3:404342‑M1/1‑126 (MQ=255) aCAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgtt > 4:903892‑M1/1‑124 (MQ=255) aTTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaa > 5:1386929‑M1/1‑121 (MQ=255) ttGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaatt > 8:1513614‑M1/1‑119 (MQ=255) tgtgCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCg > 6:1466060/1‑151 (MQ=255) gtgCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCgg > 8:1868194/1‑151 (MQ=255) ccAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaa < 1:80986‑M1/151‑38 (MQ=255) ccAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTg > 2:1473573/1‑151 (MQ=255) gCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGTGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACt < 4:1649980/151‑1 (MQ=255) ttGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTCAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGCCTc > 4:451224/1‑150 (MQ=255) tGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatat < 6:198097‑M1/149‑42 (MQ=255) tGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTc < 1:1887174/149‑1 (MQ=255) gTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaa < 7:1521247‑M1/151‑45 (MQ=255) tCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaat < 5:383409‑M1/150‑46 (MQ=255) cacaCTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGtcat > 5:123353/1‑151 (MQ=255) acTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGtcatttc > 1:1186535/1‑151 (MQ=255) acTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGtcatttc > 3:1186460/1‑151 (MQ=255) acTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGtcatttc < 7:1026431/151‑1 (MQ=255) ttttATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggct > 7:600912‑M1/1‑99 (MQ=255) ttttATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggct > 6:344557‑M1/1‑99 (MQ=255) tttATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggct < 7:1100223‑M1/150‑53 (MQ=255) tttATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGtcatttcatt > 7:1467218/1‑151 (MQ=255) ttATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggctt < 1:1068907‑M1/150‑54 (MQ=255) tAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagca < 4:1572746‑M1/150‑59 (MQ=255) aaaGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcag < 7:1302896‑M1/150‑60 (MQ=255) aaGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCAtt > 1:555104/1‑150 (MQ=255) aGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGt > 3:1717350/1‑151 (MQ=255) ttACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGttg > 3:995000/1‑150 (MQ=255) aCCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatg > 4:1288991‑M1/1‑85 (MQ=255) aCCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTg > 2:1719494/1‑150 (MQ=255) cccTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatga < 1:639332‑M1/151‑68 (MQ=255) cccTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGAATCACTCATTTCATTTCTTCATGttag > 4:1120740/1‑147 (MQ=255) ccTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgat < 2:874648‑M1/151‑69 (MQ=255) cTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgat > 8:1679734‑M1/1‑82 (MQ=255) ttAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCg > 7:832099/1‑151 (MQ=255) caacTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccgg > 2:1532773‑M1/1‑77 (MQ=255) caacTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccgg > 8:904116‑M1/1‑77 (MQ=255) caacTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGAttt > 1:7759/1‑151 (MQ=255) cTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaatagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcgctgaaa > 8:805403‑M1/1‑74 (MQ=255) tAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaag < 7:43709‑M1/150‑79 (MQ=255) aaGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTtctc < 5:1828694/151‑1 (MQ=255) gggTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTccc < 6:755757/151‑1 (MQ=255) tttCAAATAGATAGAGATATATTTACATCTAATATCGTAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaatta < 8:40841‑M1/150‑86 (MQ=255) tCAAATATATATAAATATATTTAGATCTATTATCTTAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTaaa < 6:508677/150‑1 (MQ=18) cAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATg > 3:895899/1‑151 (MQ=255) cAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATg < 3:835931/151‑1 (MQ=255) aaaTAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacgg > 4:255633‑M1/1‑61 (MQ=255) aaaTAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCACGTAAATGc > 8:686856/1‑151 (MQ=255) aaTAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGcc > 1:1739843/1‑151 (MQ=255) atagatagACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcg > 7:792803‑M1/1‑59 (MQ=255) atagatagACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcg < 2:741826‑M1/151‑93 (MQ=255) tagatagaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattataaggagc > 2:593148‑M1/1‑58 (MQ=255) agatagaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTg < 4:973182/151‑1 (MQ=255) atagaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGaa < 3:1840049/151‑1 (MQ=255) atagaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGa > 5:283038/1‑150 (MQ=255) tagaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgcgccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattc > 5:690746‑M1/1‑54 (MQ=255) tagaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAAt > 6:1314419/1‑151 (MQ=255) gaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattc > 4:1726861‑M1/1‑52 (MQ=255) cATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtg > 2:1285350‑M1/1‑50 (MQ=255) atatatTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtct > 3:718872‑M1/1‑49 (MQ=255) atatatTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtct < 6:152115‑M1/151‑103 (MQ=255) tatatTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctg > 6:1746701‑M1/1‑48 (MQ=255) tatTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggc > 2:452908‑M1/1‑46 (MQ=255) tttACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTAttt > 1:413178/1‑151 (MQ=255) cTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgct > 3:543682‑M1/1‑37 (MQ=255) aaTATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgcta < 8:1711361‑M1/150‑116 (MQ=255) aaTATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGAcc < 6:704157/147‑1 (MQ=255) aaTATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGttt > 6:1691859/1‑151 (MQ=255) atatCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggattgagaagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggctcattcagtctggcggttgtgctaac > 8:1153113‑M1/1‑34 (MQ=255) atCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTttctt < 6:1013107/151‑1 (MQ=255) cGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTttcttc < 6:123060/150‑1 (MQ=255) aTTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatcaattgcc > 5:865258‑M1/1‑26 (MQ=255) aTTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGCCTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCAt > 7:195047/1‑151 (MQ=255) gtctGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTa < 1:1358817/150‑1 (MQ=255) ctgctgTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccagga < 5:165243‑M1/149‑129 (MQ=255) gctgTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccaggat < 4:1060135‑M1/148‑130 (MQ=255) gctgTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGTGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGc < 6:84898/151‑1 (MQ=255) gTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccaggattgcagc > 3:1335029‑M1/1‑16 (MQ=255) tAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccgtaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccaggattgcagca < 2:670365‑M1/150‑137 (MQ=255) tAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgataccggaaaagagaattatacggcgcattcagtctgccggttgtgctatccattgccaggattcaagcat > 3:246348‑M1/1‑14 (MQ=255) aaGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATc > 2:253701/1‑151 (MQ=35) aaGGTTGGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggctggagcagacctatgatcccggaaaagcgaagtatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccaggattgcagcatc < 2:1133171‑M1/151‑139 (MQ=255) aGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccaggattgcagcatc > 3:1527660‑M1/1‑12 (MQ=255) aGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATcc > 4:797441/1‑151 (MQ=34) ggTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATccc > 4:573285/1‑151 (MQ=33) tttGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccaggattgcagcatcagcc > 5:1600284‑M1/1‑9 (MQ=255) tGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccaggattgcagcatcagcca < 1:958303‑M1/150‑144 (MQ=255) tGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcgggtgtgctatccattgccaggattgcagaatcagcca < 1:305074‑M1/150‑144 (MQ=255) gCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccaggattgcagcatcagccagc < 8:292637‑M1/151‑146 (MQ=255) gCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCAGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATACCAAGtt > 8:619863/1‑151 (MQ=2) | AAGGTTATCTTTTGCTGTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATCCCCAGTT > DH1/2478738‑2479033 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |