| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 2478888 | 228 (0.470) | 234 (0.500) | 162/290 | 3.0 | 47.9% | noncoding (5/1204 nt) | repeat_region | repeat region |
| ? | DH1 | 2480088 = | 289 (0.610) | intergenic (‑73/‑63) | insH1/fnr | transposase/fumarate and nitrate reduction regulatory protein | |||||
Only 100 of 535 total aligned reads displayed.
GGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCCATTGCCAGGATTGCAGCATCAGCCAGCTTTGCA > DH1/2479938‑2480238 | ggACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGa < 7:86451/151‑1 (MQ=11) ggttatcttttgctgtaaacattaaacaatttgtgccagcttgttcacacttttatgtaaagttacccttaacaacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagac > 7:537623‑M2/150‑151 (MQ=255) ggttatcttttgctgtaaacattaaacaatttgtgccagcttgttcacacttttatgtaaagttacccttaacaacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagac > 5:953465‑M2/150‑151 (MQ=255) ggttatcttttgctgtaaacattaaacaatttgtgccagcttgttcacacttttatgtaaagttacccttaacaacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagac < 1:618663‑M2/2‑1 (MQ=255) aCAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTTTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGatt < 8:145508/151‑3 (MQ=11) ttatcttttgctgtaaacattaaacaatttgtgccagcttgttcacacttttatgtaaagttacccttaacaacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagactt > 5:1789676‑M2/148‑151 (MQ=255) cAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGactt < 7:1175034/151‑1 (MQ=32) cAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGactt > 8:641280/1‑151 (MQ=32) atcttttgctgtaaacattaaacaatttgtgccagcttgttcacacttttatgtaaagttacccttaacaacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagacttac > 3:66842‑M2/146‑151 (MQ=255) aGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGattgtt > 6:1195225/1‑146 (MQ=11) cttttgctgtaaacattaaacaatttgtgccagcttgttcacacttttatgtaaagttacccttaacaacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagacttactt > 8:837489‑M2/144‑151 (MQ=255) aaaaTCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGattgtttt < 7:64331/151‑8 (MQ=11) aaaaTCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGacttactt > 3:1858016/1‑151 (MQ=35) aaaaTCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGacttactt > 2:537261/1‑151 (MQ=35) aaaTCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGattgttttc > 6:768203/1‑143 (MQ=11) tttgctgtaaacattaaacaatttgtgccagcttgttcacacttttatgtaaagttacccttaacaacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagacttactt < 2:1823515‑M2/8‑1 (MQ=255) ctctTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGattgttttcttcg > 2:1143923/1‑139 (MQ=2) ctTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGattgttttcttcgcc > 6:1700708/1‑137 (MQ=2) ctTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCt > 3:451212/1‑151 (MQ=40) tttCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGattgttttcttcgcc < 1:1527271/149‑15 (MQ=2) aacattaaacaatttgtgccagcttgttcacacttttatgtaaagttacccttaacaacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTaaaa < 6:29425‑M2/19‑1 (MQ=255) acattaaacaatttgtgccagcttgttcacacttttatgtaaagttacccttaacaacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTaaaa > 7:1944796‑M2/132‑150 (MQ=255) ggTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTaaaaa < 4:1738310/149‑1 (MQ=255) ggTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGa < 2:665037/151‑1 (MQ=255) cTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGt > 1:1785599/1‑151 (MQ=255) aacaatttgtgccagcttgttcacacttttatgtaaagttacccttaacaacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGtt > 4:1852600‑M2/126‑151 (MQ=255) gACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAATGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGt < 4:1498968/149‑1 (MQ=255) acaatttgtgccagcttgttcacacttttatgtaaagttacccttaacaacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTa < 4:66726‑M2/27‑1 (MQ=255) tttgtgccagcttgttcacacttttatgtaaagttacccttaacaacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAAt > 5:309044‑M2/121‑151 (MQ=255) tgtgccagcttgttcacacttttatgtaaagttacccttaacaacttaagcgttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAAtt < 1:1162391‑M2/32‑1 (MQ=255) gcTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTg > 7:757255/1‑151 (MQ=255) gcTTACTGCTGAATACACTGTCGCCGAACGTAAGTTGATCACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATCACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTCCTCCCTAAAAAGATGATAAAATTg > 4:600497/1‑151 (MQ=17) tACTGCTGATTTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTGGTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGa < 8:1053213/149‑1 (MQ=255) tACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGa < 7:805603/149‑1 (MQ=255) tACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGAc > 8:1591156/1‑150 (MQ=255) aCTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACa < 4:874617/150‑1 (MQ=255) tctgAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACaaa < 2:126832/148‑1 (MQ=255) tgAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAatat > 8:1166912/1‑150 (MQ=255) tgttcacacttttatgtaaagttacccttaacaacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAatat < 6:198097‑M2/41‑1 (MQ=255) tgttcacacttttatgtaaagttacccttaacaacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATc < 2:1522258‑M2/42‑1 (MQ=255) tgttcacacatttatgtaaagttacccttaacaacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAatat < 6:888494‑M2/41‑1 (MQ=255) gAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAatat < 3:1654416/149‑1 (MQ=255) gAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATc < 5:765980/150‑1 (MQ=255) cacacttttatgtaaagttacccttaacaacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAAtt < 2:911506‑M2/46‑1 (MQ=255) cACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTAc < 4:1239385/151‑1 (MQ=255) cACTGTCGGCGAAGGTAAGGGGATGACTCATGATGAAGCCTGTTCTATGGCTCGAGATGACAAAAATCATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTa < 5:1149343/150‑1 (MQ=21) aCTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACg < 7:1835691/151‑1 (MQ=255) cGGCGAATGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCtt < 4:1610759/150‑1 (MQ=255) cGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCtt < 5:1051206/150‑1 (MQ=255) tatgtaaagttacccttaacaacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAGATTGACAAATATCAATTACGGCTtgc > 1:848218‑M2/97‑150 (MQ=255) aaGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCac > 6:43160/1‑150 (MQ=255) aaagttacccttaacaacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAg < 7:1302896‑M2/59‑1 (MQ=255) tacccttaacaacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTa < 8:465476‑M2/64‑1 (MQ=255) acccttaacaacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATg > 4:1288991‑M2/86‑151 (MQ=255) ccttaacaacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGAt < 7:1645069‑M2/68‑1 (MQ=255) caacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCgg > 8:904116‑M2/78‑150 (MQ=255) caacttaagggttttcaaatagatagacatatatttacatctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCgg > 2:27781‑M2/78‑150 (MQ=255) atgatgAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGaaaa < 3:1067427/151‑1 (MQ=255) 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cAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGt > 8:183493/1‑151 (MQ=255) catctaatatcggaattctctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTtgt > 4:491431‑M2/41‑151 (MQ=255) aTCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTAt > 7:110381/1‑151 (MQ=255) gaattctctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCCATTGc > 1:659800‑M2/29‑151 (MQ=255) attctctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGTGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTTGCGGTTGTGCTATCCATTGCCa < 4:1069901‑M2/125‑1 (MQ=255) attctctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCCATTGCCa < 3:1199594‑M2/125‑1 (MQ=255) aGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCCATTGcc > 7:289828/1‑149 (MQ=255) ctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCCATTGCCAgg < 7:1426868‑M2/127‑1 (MQ=255) ctgctgttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCCATTGCCAGGa < 5:165243‑M2/128‑1 (MQ=255) aCTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCCATTGCCAGGAtt > 2:1637167/1‑151 (MQ=255) aCTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCCATTGCCAGGAtt < 1:1051662/151‑1 (MQ=255) tGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCCATTGCCAGGATTg < 2:698299/149‑1 (MQ=255) gTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCCATTGCCAGGATTgca < 4:787340/150‑1 (MQ=255) gttaaggtttgcttagACTTACGTGCTCCCAAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTCAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCCATTGCCAGGATTgca < 8:1697626‑M2/133‑1 (MQ=255) ttaaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCCATTGCCAGGATTgcagc > 1:1654825‑M2/16‑150 (MQ=255) taaggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATACCGGAAAAGAGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGCCGGTTGTGCTATCCATTGCCAGGATTCAAGCAt > 3:246348‑M2/15‑151 (MQ=255) aggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCCATTGCCAGGATTGCAGCATca < 5:499772‑M2/139‑1 (MQ=255) aggtttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCCATTGCCAGGATTGCAGCATc > 3:1527660‑M2/13‑150 (MQ=255) tttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCCATTGCCAGGATTGCAGCATcagcc > 5:1600284‑M2/10‑151 (MQ=255) ttgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCCATTGCCAGGATTGCAGCATcagcc > 1:208448‑M2/9‑150 (MQ=255) tgcttagACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCCATTGCCAGGATTGCAGCATcagcca < 1:958303‑M2/143‑1 (MQ=255) gcttagACTTACTTTCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAATCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCCATTGCCAGGATTGCAGCATcagccag < 1:1356100‑M2/144‑1 (MQ=255) | GGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGACTTACTTGCTCCCTAAAAAGATGTTAAAATTGACAAATATCAATTACGGCTTGAGCAGACCTATGATCCCGGAAAAGCGAATTATACGGCGCATTCAGTCTGGCGGTTGTGCTATCCATTGCCAGGATTGCAGCATCAGCCAGCTTTGCA > DH1/2479938‑2480238 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |