Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | DH1 | 2,204,804 | Δ120 bp | intergenic (‑239/‑54) | tqsA ← / → mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | DH1 | = 2204803 | 0 (0.000) | 277 (0.580) | 171/296 | 2.6 | 100% | intergenic (‑238/‑174) | tqsA/mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ |
? | DH1 | 2204924 = | 0 (0.000) | intergenic (‑359/‑53) | tqsA/mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ |
Only 100 of 284 total aligned reads displayed.
AAGTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/2204652‑2204803 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAATGGCG > DH1/2204924‑2205073 AAGTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACAT > 8:1865969/1‑151 AAGTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGAGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACAT > 4:1787171/1‑151 AGTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATT > 5:1268897/1‑151 TGAAAATATTTCGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGt > 8:377349/1‑150 GAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGG < 8:1412042/150‑1 AATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTC < 1:106352/151‑1 AATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTC < 8:1286815/151‑1 AATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTC > 1:1391448/1‑151 TATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGC > 5:1807795/1‑151 ATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCT < 2:1340238/151‑1 ATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGGTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCT < 4:1403582/151‑1 TTTGAGTTTATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGTGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTG < 2:1812307/150‑1 TTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTG < 1:1777918/150‑1 TTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTG < 7:1880261/150‑1 TTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGA < 3:1851402/150‑1 TGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAAT > 3:1240228/1‑151 TGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAA < 3:53904/150‑1 TTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCATGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTA > 4:1321050/1‑149 AATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCG < 8:704976/151‑1 ATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGA < 6:51096/151‑1 TCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAA < 2:995507/150‑1 TTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAAT > 1:450710/1‑151 TTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAAATACCGAGGACAATTATCATACGCGATGACGAGAAGAAACAATGCTGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTAATTTTCTACATTGATTTCAATTAATTAAGCGAAAAT > 8:1666283/1‑151 AAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATT > 4:7095/1‑150 AAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATT > 4:861058/1‑150 AGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTA < 8:1493151/150‑1 ATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAAT < 1:242337/150‑1 TGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATA > 2:435312/1‑150 GATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAA < 4:1019584/150‑1 ACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCT > 5:397075/1‑151 ACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTC < 7:431965/150‑1 ATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTG > 7:708224/1‑151 AGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAG < 6:343613/151‑1 AGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAG < 6:190840/151‑1 AGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGC > 4:54369/1‑149 CAACTACCGATGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGA < 7:1605861/150‑1 CAACTACCGAGGACAATTATGATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGA < 2:1485755/150‑1 CAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGA < 6:146465/150‑1 ACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACA > 4:422042/1‑150 GGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATT < 4:1833718/151‑1 ACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTA < 6:1755082/151‑1 ACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTA < 1:825673/151‑1 ACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTT > 5:315699/1‑150 CAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTAT > 8:28063/1‑151 AATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGTATAATTTTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATT < 1:1740860/151‑1 AATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATT > 3:1108283/1‑151 ATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTG > 8:972715/1‑151 ATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGAT > 5:1322506/1‑151 ATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGAT < 7:851678/151‑1 CCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTAT < 8:121023/151‑1 CCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTA < 1:1805592/150‑1 GAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGC > 4:227489/1‑151 AGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCT > 1:1268247/1‑151 AGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATT < 7:1754681/151‑1 AGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATT > 5:971868/1‑151 GCAACACTGCGGATAATTTTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGTAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTG < 1:1189547/151‑1 GCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTG > 1:101221/1‑151 GCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTG > 7:1275530/1‑151 ACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTAC > 8:1147863/1‑150 TGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTAC > 7:1053455/1‑148 TGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTAC > 2:200728/1‑148 GATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATT < 7:1155130/151‑1 ATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTA < 3:1565257/151‑1 ATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTATCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATT > 5:609726/1‑150 TAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTA > 2:60053/1‑150 GTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGT > 1:51976/1‑150 TAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTCCTACAGAAATTACAGGTAC > 3:1477209/1‑151 TATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCT > 5:1916794/1‑151 TATTATCGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGCTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAAATCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGTTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCT > 3:1442325/1‑151 ATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTG > 1:334164/1‑151 ATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCT < 3:678359/150‑1 TTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGG < 3:896904/105‑1 TTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGG > 4:895735/1‑105 ATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAATTTACCGGTACGCTGTCA < 7:377777/151‑1 ATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGAATTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTAAGCTGTC > 6:883949/1‑150 GACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATG > 5:856598/1‑151 GACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATG < 1:847618/151‑1 aAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAA < 6:232788/150‑1 ATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAAT > 6:1728325/1‑151 ATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAAT < 8:1850800/151‑1 TTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATG > 2:166576/1‑151 TTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATG > 6:500489/1‑151 TGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGG < 5:1222789/150‑1 TGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAAATCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGG < 7:950038/150‑1 GTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAATCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGC < 5:705954/151‑1 TCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCG > 6:732790/1‑150 AGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGC < 5:1017209/151‑1 GTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTC > 6:86800/1‑149 GTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTC > 2:1098929/1‑149 TATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTG > 8:452092/1‑151 TATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGT < 6:1588076/150‑1 TTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGG > 5:1562029/1‑151 TTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAG < 7:1380962/150‑1 ACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAAT < 3:761063/151‑1 ACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAAT > 4:1610181/1‑151 ACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAAT < 7:1553036/151‑1 CATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGTGCGAGCGTCAGTGAGGGAAATG > 6:1285258/1‑151 CATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAATG < 5:1700564/151‑1 TGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAATGGCG > 6:1703576/1‑151 TGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAATGGC < 8:1000641/150‑1 AAGTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/2204652‑2204803 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAATGGCG > DH1/2204924‑2205073 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |