| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | DH1 | 2,204,804 | Δ120 bp | intergenic (‑239/‑54) | tqsA ← / → mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 2204803 | 0 (0.000) | 277 (0.580) | 171/296 | 2.6 | 100% | intergenic (‑238/‑174) | tqsA/mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ |
| ? | DH1 | 2204924 = | 0 (0.000) | intergenic (‑359/‑53) | tqsA/mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ | |||||
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
AGTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTTACCCATCTTCGTACCTCATCCACTATCTTGCTCGTAGGTGAGCAGCACTGGCGCAACGCGCTTTAGTCCTTTCTTCTGCCAAAGCTTGCGCTATGCGCGGGGCTTGACCACTTTACTTTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAA > DH1/2204653‑2204950 | aGTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATT > 5:1268897‑M1/1‑151 (MQ=255)aGTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATT > 5:693460‑M1/1‑151 (MQ=255) tGAAAATATTTCGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTgt > 8:377349‑M1/1‑149 (MQ=255) aaTATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttc < 1:106352‑M1/151‑7 (MQ=255) aaTATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttc > 1:1391448‑M1/1‑145 (MQ=255) tatTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgc > 5:1807795‑M1/1‑143 (MQ=255) atTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgct > 3:1352915‑M1/1‑142 (MQ=255) atTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgct < 2:1340238‑M1/151‑10 (MQ=255) gAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaatt < 7:1843680‑M1/151‑15 (MQ=255) tAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaag < 3:1207579‑M1/150‑18 (MQ=255) aaTTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcg < 8:704976‑M1/151‑20 (MQ=255) aTTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcga < 6:51096‑M1/151‑21 (MQ=255) aTTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcg > 8:1882972‑M1/1‑131 (MQ=255) ttCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcga > 3:329834‑M1/1‑130 (MQ=255) tCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaa < 2:995507‑M1/150‑22 (MQ=255) tCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaa < 8:1794191‑M1/150‑22 (MQ=255) ttAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaat > 1:450710‑M1/1‑127 (MQ=255) aaGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaatt > 4:7095‑M1/1‑125 (MQ=255) aaGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaatt > 4:861058‑M1/1‑125 (MQ=255) aGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaa < 3:1725161‑M1/151‑28 (MQ=255) gCTATGATACAAATCAGGCTTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAAGACTGCGGTTAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcggtgaattaagcgaaaattaaa < 4:1531309‑M1/151‑29 (MQ=255) aTGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaat < 1:242337‑M1/150‑31 (MQ=255) tGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaata > 2:435312‑M1/1‑119 (MQ=255) gATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGGAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataat < 3:1083985‑M1/151‑34 (MQ=255) gATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataa < 4:1019584‑M1/150‑33 (MQ=255) gATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGACGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataat < 6:493633‑M1/151‑34 (MQ=255) aCAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattct < 7:836195‑M1/151‑37 (MQ=255) aCAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattct > 5:397075‑M1/1‑115 (MQ=255) aCAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattc < 7:431965‑M1/150‑36 (MQ=255) aaaTCAGGCGTGTTGAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagagaaaattaaaataattctct > 7:979878‑M1/1‑113 (MQ=255) aTCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttg < 7:1602788‑M1/151‑41 (MQ=255) aTCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttg > 7:708224‑M1/1‑111 (MQ=255) cAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgc > 6:279179‑M1/1‑109 (MQ=255) aGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcag < 6:190840‑M1/151‑44 (MQ=255) aGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgc > 4:54369‑M1/1‑108 (MQ=255) tgtTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggaga > 8:1623963‑M1/1‑103 (MQ=255) gtTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaa < 3:670393‑M1/150‑49 (MQ=255) gtTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaa < 1:717213‑M1/150‑49 (MQ=255) cAACTACCGAGGACAATTATGATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaagga < 2:1485755‑M1/150‑52 (MQ=255) cAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaagga < 6:146465‑M1/150‑52 (MQ=255) aCTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggaca > 4:422042‑M1/1‑97 (MQ=255) aCCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgt < 7:1148752‑M1/151‑58 (MQ=255) aCAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatattta < 6:1755082‑M1/151‑65 (MQ=255) aCAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatattt > 5:315699‑M1/1‑87 (MQ=255) cAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttat > 8:28063‑M1/1‑86 (MQ=255) aaTTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGTATAATTTTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttatt < 1:1740860‑M1/151‑67 (MQ=255) aTTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattg > 8:972715‑M1/1‑84 (MQ=255) tATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattgg < 7:370389‑M1/150‑69 (MQ=255) atcatcCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggat > 5:1322506‑M1/1‑81 (MQ=255) atcCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggatttt < 8:136188‑M1/151‑74 (MQ=255) ccGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttat < 8:121023‑M1/151‑76 (MQ=255) ccGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggatttta < 1:1805592‑M1/150‑75 (MQ=255) tGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatatattggattttattagttc > 2:1629427‑M1/1‑70 (MQ=255) cGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctgg > 4:1842181‑M1/1‑67 (MQ=255) gagaAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggg > 1:1745427‑M1/1‑66 (MQ=255) gagaAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggc > 4:227489‑M1/1‑66 (MQ=255) agaAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggct > 1:1268247‑M1/1‑65 (MQ=255) aaGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctat < 4:1346097‑M1/151‑89 (MQ=255) aGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctatt > 5:971868‑M1/1‑62 (MQ=255) gCAACACTGCGGATAATTTTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgtaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattg < 1:1189547‑M1/151‑91 (MQ=255) gCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattg > 1:101221‑M1/1‑61 (MQ=255) gCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattg > 7:1667312‑M1/1‑61 (MQ=255) acacTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgct > 7:1271846‑M1/1‑58 (MQ=255) tGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctac > 2:200728‑M1/1‑54 (MQ=255) cGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaa > 2:1811501‑M1/1‑52 (MQ=255) aTAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaatta < 3:1565257‑M1/151‑103 (MQ=255) aTAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaatt > 8:1216258‑M1/1‑49 (MQ=255) aTAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattatcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaatt > 5:609726‑M1/1‑49 (MQ=255) tAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaatta > 2:60053‑M1/1‑48 (MQ=255) gTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggt > 1:51976‑M1/1‑43 (MQ=255) tAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattcctacagaaattacaggtac > 3:1477209‑M1/1‑42 (MQ=255) aaTATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacg > 4:96385‑M1/1‑41 (MQ=255) tattatGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgct > 5:1916794‑M1/1‑39 (MQ=255) attatGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctg > 1:334164‑M1/1‑38 (MQ=255) ttatGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattgg < 3:896904‑M1/105‑69 (MQ=255) atGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggaatttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtaagctgtc > 6:883949‑M1/1‑35 (MQ=255) gACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatg > 5:856598‑M1/1‑32 (MQ=255) gACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatg < 1:847618‑M1/151‑120 (MQ=255) aCAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatga < 8:1112033‑M1/151‑121 (MQ=255) aaatTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaa < 6:232788‑M1/150‑122 (MQ=255) aTTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaat > 6:1728325‑M1/1‑28 (MQ=255) tttGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatg > 4:1235735‑M1/1‑27 (MQ=255) tGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatggg > 7:1016684‑M1/1‑25 (MQ=255) tGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgg < 8:1476358‑M1/150‑126 (MQ=255) tGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgg < 5:1222789‑M1/150‑126 (MQ=255) tCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcg > 6:732790‑M1/1‑22 (MQ=255) aGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagc < 5:1017209‑M1/151‑132 (MQ=255) gTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcag < 4:1765516‑M1/151‑137 (MQ=255) gTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtc > 2:1098929‑M1/1‑15 (MQ=255) gTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtc > 6:86800‑M1/1‑15 (MQ=255) tATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtg > 8:452092‑M1/1‑13 (MQ=255) tATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagt < 6:1588076‑M1/150‑138 (MQ=255) tttCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagg > 5:1562029‑M1/1‑10 (MQ=255) tttCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgag < 7:1380962‑M1/150‑141 (MQ=255) cTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgaggga > 6:1665835‑M1/1‑7 (MQ=255) aCATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaaat < 7:1553036‑M1/151‑147 (MQ=255) aCATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgaggga < 7:931339‑M1/148‑144 (MQ=255) cATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgtgcgagcgtcagtgagggaaatg > 6:1285258‑M1/1‑4 (MQ=255) cATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaaatg > 3:720646‑M1/1‑4 (MQ=255) cATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaaatg < 5:1700564‑M1/151‑148 (MQ=255) | AGTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTTACCCATCTTCGTACCTCATCCACTATCTTGCTCGTAGGTGAGCAGCACTGGCGCAACGCGCTTTAGTCCTTTCTTCTGCCAAAGCTTGCGCTATGCGCGGGGCTTGACCACTTTACTTTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAA > DH1/2204653‑2204950 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |