Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | DH1 | 2,204,804 | Δ120 bp | intergenic (‑239/‑54) | tqsA ← / → mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | DH1 | = 2204803 | 0 (0.000) | 348 (0.620) | 203/296 | 1.0 | 99.9% | intergenic (‑238/‑174) | tqsA/mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ |
? | DH1 | 2204924 = | 1 (0.000) | intergenic (‑359/‑53) | tqsA/mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ |
Only 100 of 355 total aligned reads displayed.
AAGTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/2204652‑2204803 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAATGGCG > DH1/2204924‑2205073 GAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGG < 6:699476/150‑1 AAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGT < 1:1076660/150‑1 AAATATTTTGAGTTAATTATTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTT > 4:869545/1‑151 AATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTC < 3:473911/151‑1 AATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTC > 5:259564/1‑151 AATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTC < 6:1524193/151‑1 ATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCG > 1:646865/1‑151 TATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGC > 1:145598/1‑151 TTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGA < 5:191166/150‑1 TTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGA > 6:494367/1‑150 TGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAA < 1:817721/150‑1 GAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATT > 5:717915/1‑151 GAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAAT < 8:1426365/150‑1 GTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTA > 3:2082736/1‑150 TAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAG < 2:1707169/150‑1 TAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAG < 3:1367328/150‑1 ATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCG > 1:1818322/1‑150 TTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGA > 2:1228997/1‑150 TCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAA > 5:1702116/1‑150 TTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAAT > 1:498765/1‑151 TAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATT > 8:2137411/1‑151 TAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAAT < 4:503226/150‑1 TAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAAT < 8:932056/150‑1 TAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAA < 5:883029/149‑1 TAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAA < 7:461915/148‑1 AAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATT > 5:208393/1‑150 AGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTA > 5:1216356/1‑150 GCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAA < 7:215606/151‑1 TATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAAT > 1:1829411/1‑151 ATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATA < 6:1187060/151‑1 ATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAAT > 3:845759/1‑150 ATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAAT > 4:1697059/1‑150 TGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATA > 3:1252824/1‑150 TGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATA > 7:2043822/1‑150 GATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAAT > 4:667821/1‑151 ATACAAATCATGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAAT < 4:1102035/150‑1 ACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCT < 2:1125289/151‑1 ACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTC < 1:958253/150‑1 CAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTg > 4:2158668/1‑150 CAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCT > 6:1321708/1‑150 AAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCT < 4:1860361/151‑1 AATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTT < 2:487063/151‑1 CAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGC < 2:1577441/150‑1 cGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAG < 5:401156/150‑1 AGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAG < 7:318591/151‑1 GGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGG < 8:1763457/151‑1 GCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGA < 7:1087783/151‑1 CGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGG > 6:937277/1‑149 CAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGTGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGAC < 1:1940342/151‑1 TACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATG > 2:852110/1‑151 ACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATG < 8:1044533/150‑1 GAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTAT > 6:1825421/1‑150 GACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTT > 3:2167400/1‑151 ATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTG > 2:2024909/1‑151 TTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGG > 8:673180/1‑151 ATCATCCGCGATGACGTGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGc < 3:1335583/150‑2 CATCCGCGATGTAGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTT < 8:2229968/151‑1 CATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATT < 5:1775709/150‑1 CCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGGAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTAT > 3:1077809/1‑151 CCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTA < 2:1322047/150‑1 GATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGG > 6:384030/1‑151 GACGAGAAGCAACACTGCTGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCT < 6:1031111/151‑1 CGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGG < 5:1461268/151‑1 CGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGG < 4:126790/151‑1 AGAAGCAACCCTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCT < 5:2032358/151‑1 AAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTAT < 6:984962/151‑1 AGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATT < 3:556474/151‑1 GCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTG < 4:2002213/151‑1 ATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATT > 5:1622407/1‑150 ATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGATATTGCTACAGAAATTACAGGTACGCTG > 8:1220763/1‑151 ATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAACGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCT < 2:685165/150‑1 ATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTATGCTGTC > 5:1816922/1‑150 ATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCA < 7:1059697/151‑1 ATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACCCTGTC > 6:213825/1‑150 ACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGA < 1:1303876/151‑1 aAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAA < 6:591506/150‑1 CAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGA > 8:566495/1‑150 CAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGA > 1:1598414/1‑150 ATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAAT > 3:174270/1‑151 TTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATG < 5:606460/150‑1 TGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGG < 4:1455691/150‑1 GTTCAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGC < 2:240895/151‑1 TTCAGGACGTTATTTTCTACATTTGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTAGAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGC < 7:1971370/150‑1 CAGGACGTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGA < 3:1542724/150‑1 GTTATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTC > 2:645330/1‑149 TATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGT < 6:1966128/150‑1 ATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGA < 1:2111276/151‑1 ATTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTG < 7:1401001/150‑1 TTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAG > 2:870750/1‑147 TTTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAG < 1:871382/147‑1 TTTCTACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAG < 8:1997247/150‑1 ACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAGGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGA < 7:1853079/148‑1 ACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAAT < 1:386932/151‑1 ACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAA < 5:486013/150‑1 ACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAA < 7:1621959/149‑1 ACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGA < 2:950841/148‑1 ACATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGA < 5:1345072/148‑1 CATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAATG < 8:1473664/151‑1 CATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAATG < 7:1566718/151‑1 ATTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAATGG > 7:760415/1‑151 AAGTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/2204652‑2204803 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAATAATTCTCTTGCAGGAGAAGGACAATGTATATTTATTGGATTTTATTAGGTCTGGCTATTGCTACAGAAATTACCGGTACGCTGTCAATGAAATGGGCGAGCGTCAGTGAGGGAAATGGCG > DH1/2204924‑2205073 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |